FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA2010.ptfa, 848 aa vs ./tmplib.26680 library 1768169 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7418+/-0.00622; mu= 2.8691+/- 0.414 mean_var=187.1890+/-44.924, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0937 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1387 ( 865 res) mph00154 ( 865) 2963 414 5.1e-116 >>mKIAA1387 ( 865 res) mph00154 (865 aa) initn: 3365 init1: 2022 opt: 2963 Z-score: 2175.3 bits: 413.6 E(): 5.1e-116 Smith-Waterman score: 4042; 73.778% identity (76.704% ungapped) in 839 aa overlap (19-839:37-861) 10 20 30 40 mKIAA2 GPGVPRLRPPAFSGHCPWATRAGPPAGTMTDTRRRVKVYTLNEDRQWD : .:: : ::.:::::::::::::::::: mKIAA1 PLQSRCHHRRCRHYRLSRVRDTGEVSEEVAAGTVGPEA-TMSDTRRRVKVYTLNEDRQWD 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 mKIAA2 DRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNTAYQKQQDTLIVWSEAENYDL ::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA1 DRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNTAYQKQQDTLIVWSEAENYDL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 mKIAA2 ALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEERFDDM--SSPGLELPSCELS :::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::::..: .: ..::.:::: mKIAA1 ALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEERFEEMPETSHLIDLPACELS 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 mKIAA2 RLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFHVCEDLENIEGLHHLYEIIKG .:::::.::.: : ::.:::::::::::::::::::.::..::.::: ::::::::::.: mKIAA1 KLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQACENLENTEGLHHLYEIIRG 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 mKIAA2 IFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPTLSQPRKHREFLTKTAKFKEVIPISDPELK :..::...:::::::.::::::.:::::::.:.::..:::::::::::::::::.: ::. mKIAA1 ILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHREFLTKTAKFKEVIPITDSELR 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 mKIAA2 QKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEIVGMLQEDEKFLTDLFAQL ::::::::::::::..::::::::::.:::: :::::::::::.:::::::::...:::: mKIAA1 QKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKVEIVSMLQEDEKFLSEVFAQL 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 mKIAA2 TDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNMGILPALEVILGMDDTQVR ::::::..::.:::::.::::::::::::::::::::::...:::::::...:::: ::: mKIAA1 TDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLAKLGILPALEIVMGMDDLQVR 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 mKIAA2 SAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLIIEHMICDTDPELGGAVQLMGL ::::::::::::..::::::::::::::.:::.::::..::.:::::::::::::::::: mKIAA1 SAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDVLLINVVIEQMICDTDPELGGAVQLMGL 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 mKIAA2 LRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANTTEDKPSKDD--------- ::::.::::::::.:::::.:::.:::.:::::::::::.::.::: ::. mKIAA1 LRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLTNTSEDKCEKDNMLGSNTTNT 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 mKIAA2 -----FQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALR .::::::::.:::::::::::::::::::.:::.:::::::: :::.:::::::: mKIAA1 ICPDNYQTAQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALR 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 mKIAA2 FKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLT : :.::::::::::::: :. :::::..:.:.::.::::.:::.::.::::::::::::: mKIAA1 FMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLT 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 mKIAA2 AHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLED ::..::..::::...::::::::: ..::...:: : ::.:. ::::..:.::::..::. mKIAA1 AHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQ-NQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEE 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 mKIAA2 EEEMWFNTDEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLS .:::::: ::: :.:.::..: .:.:..::. : :::: :: ::::.:: : : : mKIAA1 DEEMWFN--EDDDEEGKAVITPVEKSKTEDDFPDSYEKFMETKKAKESEDKENLPKRASS 730 740 750 760 770 780 760 770 780 790 800 810 mKIAA2 GRQSPSFKLSLS-SGTKTNLTSQSSATSLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKSTSQTAAIT- : .::...: : . :: :..... :. : .:.: . .: :.:: ....: mKIAA1 G----GFKFTFSHSPSATNGTNSTNSKSVV-SQTTPASSNVASS-----KTTSLATSVTA 790 800 810 820 830 820 830 840 mKIAA2 TKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPVSKKAKFES :::.::::::::::.:.:.:.:.. : mKIAA1 TKGNLVGLVDYPDDEEEDEEEESSPRKRPRLGS 840 850 860 848 residues in 1 query sequences 1768169 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:57:38 2006 done: Mon Mar 27 10:57:39 2006 Scan time: 0.900 Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]