FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA1380.ptfa, 2428 aa
vs ./tmplib.26680 library
1766589 residues in 2168 sequences
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Lambda= 0.0816
FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are: opt bits E(2168)
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.. . ..:: : .. . .. .. .. : :.. : . :.. : : .:
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..: : .:.. : . .. .. . .. .. :. ..::. :.:
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. .... : : :: ::. .. . ..:.:.:. : . .:: :
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. :: ... ::. .. .:...: :: :.:. :: : : : . :. .
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: : : . .:... .. . : .::::: ::.::::.:: :::: :
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: ...:.:.::::::: : . : .:. : : :::..:::: :...::.:..:: ::.:
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: .::.:: . . .:.::::::: .::.::::: ::: :. :. :.:::::
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1730 1740 1750 1760 1770 1780
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::: :. ..:::::::::..: .. : .: : :.:::..: : .::. . . ::.
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980 990 1000 1010 1020
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
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: ....::
mKIAA1 S-TAKVSPHVTSDLAHPRRWGCSPSRTLHEHRSLQDPGRAHCFSQEAPGLGNVYLVKNRF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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: : : .. :. . .... . .: ::
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930 940 950 960
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970 980 990 1000 1010 1020
2120 2130 2140 2150 2160 2170
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
2240 2250 2260 2270 2280 2290
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
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:.
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1330
2428 residues in 1 query sequences
1766589 residues in 2168 library sequences
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start: Mon Mar 27 10:42:54 2006 done: Mon Mar 27 10:42:56 2006
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]