FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1380.ptfa, 2428 aa vs ./tmplib.26680 library 1766589 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5660+/-0.00695; mu= 3.3322+/- 0.462 mean_var=247.1155+/-59.510, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0816 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 44, opt: 32, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1082 ( 1150 res) mpm09312 (1150) 1083 142 9.3e-34 mKIAA0742 ( 1334 res) mpm06338 (1334) 1065 140 4.5e-33 >>mKIAA1082 ( 1150 res) mpm09312 (1150 aa) initn: 1415 init1: 595 opt: 1083 Z-score: 698.4 bits: 142.2 E(): 9.3e-34 Smith-Waterman score: 1155; 33.773% identity (38.381% ungapped) in 758 aa overlap (1260-1942:354-1095) 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA1 DYLKPEAGETGRIILPNVNLESAHVKSEKNFEAVSQGNVPVSVMSAVNVVSTTKADVFTS :. .:: ::: . . .. :: . :: : mKIAA1 ATDNKPLGFSFSCSSASESQKDSDLSKNLFFQCMSQ-NVPST--NYLSRVSESVAD--DS 330 340 350 360 370 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA1 AATTTSVSSLSSAETSYSLSNTISASTPFECTSSKSVVSQAVAQAKDCTVSTAVPGTLAC .. . ..:: : .. . .. .. .. : :.. : . :.. : : .: mKIAA1 SSRDSFTQSLESLTSGLCKGRSVLGADTQPGPKAGSSVDRKVPAESMPTLTPAFPRSLLN 380 390 400 410 420 430 1350 1360 1370 1380 1390 mKIAA1 SKTG-------------SAVQPGSGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQFKNSSV----SEAE ..: : .:.. : . .. .. . .. .. :. ..::. :.: mKIAA1 TRTPENHENLFLQPPKLSREEPSNPFLAFVEKVEHSPFSSFVSQASGSSSSATSVTSKAT 440 450 460 470 480 490 1400 1410 1420 1430 mKIAA1 LNTVRNQTVAASLPL----------DST-MTCTASNKAISVGN------GPAAQSSQPNY . .... : : :: ::. .. . ..:.:.:. : . .:: : mKIAA1 ASWPESHSSAESAPLAKKKPLFITTDSSKLVSGVLGSALSTGSPSLSAVGNGRSSSPTNS 500 510 520 530 540 550 1440 1450 1460 1470 1480 mKIAA1 HTK-LKKAWLTRHSEEDKNT---NKMENSG-NSVSEIIKPCSVNLIASTSN-DIENRADG :. .. :. :.. : ....: .. : .. : ..... .. ::.: mKIAA1 LTQPIEMPTLSSSPTEERPTVGPGQQDNPLLKTFSTVFGRHSGSFLSAPAEFAQENKAPF 560 570 580 590 600 610 1490 1500 1510 1520 1530 1540 mKIAA1 RVAVDKYGRDEKVSRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKR . :: ... ::. .. .:...: :: :.:. :: : : : . :. . mKIAA1 E-AVKRFSLDER--SLACRQDSDSSTNSDLSDLSDSE-EQL---QAKSGLKGIPEHLMGK 620 630 640 650 660 670 1550 1560 1570 1580 1590 1600 mKIAA1 KGEVEEDSKPNGVLSRSAKDKSKLKLQNSNSAGVPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDS : : : . .:... .. . : .::::: ::.::::.:: :::: : mKIAA1 LGPNGERSA-ELLLGKGKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVRKLKQSGEPFLQDGS 680 690 700 710 720 730 1610 1620 1630 1640 1650 1660 mKIAA1 CCEIGPNLQKCRECRLIRSK--KGEESTHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQ : ...:.:.::::::: : . : .:. : : :::..:::: :...::.:..:: ::.: mKIAA1 CINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLVFTRKGVLRVEGFLSPQQ 740 750 760 770 780 790 1670 1680 1690 1700 1710 1720 mKIAA1 YDDEAMSLWTHENYEDDEVDVETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRA : .::.:: . . .:.::::::: .::.::::: ::: :. :. :.::::: mKIAA1 SDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAWKRA 800 810 820 830 840 850 1730 1740 1750 1760 1770 1780 mKIAA1 VRGVREMCDACEATLFNVHWVCRKCGFVACLDCY---KAKERKSSR---DKELYAWMKCV :::::::::.::.::::.::::::::: .::::: :.. :. .. :.:...:.::. mKIAA1 VRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWLKCA 860 870 880 890 900 910 1790 1800 1810 1820 1830 1840 mKIAA1 KGQPHDHKHLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHILREKYGIKSHCHCTNRQNLQGGNVPTMNGV ::: :. ..:::::::::..: .. : .: : :.:::..: : .::. . . ::. mKIAA1 KGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQSKSVLRPAVTNGI 920 930 940 950 960 970 1850 1860 1870 1880 mKIAA1 SQV--LQNVLHHSNKTS---------VSLPESQQQNSPQKSQTNGNS-----SPGSAS-T ::. . .:.:. :. :: .: :. . :.: : . :::: . mKIAA1 SQLPSVTPSASSGNETTFSSGGGAAAVTNPEPDQ--VPKGAGTDGRSEEPLKAEGSASNS 980 990 1000 1010 1020 1890 1900 1910 1920 1930 mKIAA1 DSRL----TP-PESQSP---LHWLADLAEQKSREEKQENKEF--TLEREIKEDGDQDASD .:.: : :.. : :::::::: ::..:: .. . .:..: . :. . mKIAA1 NSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKDAGSLRSVLNKESHSPFGLDSFN 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1940 1950 1960 1970 1980 1990 mKIAA1 SPNGSTSPPASQSNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGTSSGKGGRTMP : ....:: mKIAA1 S-TAKVSPHVTSDLAHPRRWGCSPSRTLHEHRSLQDPGRAHCFSQEAPGLGNVYLVKNRF 1090 1100 1110 1120 1130 1140 >>mKIAA0742 ( 1334 res) mpm06338 (1334 aa) initn: 2377 init1: 581 opt: 1065 Z-score: 686.2 bits: 140.2 E(): 4.5e-33 Smith-Waterman score: 2553; 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