# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/meg02309.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1380.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1380, 2428 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916183 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2790+/-0.000195; mu= 12.0309+/- 0.011 mean_var=112.1429+/-21.637, 0's: 44 Z-trim: 59 B-trim: 443 in 2/65 Lambda= 0.121112 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 44, opt: 32, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|149260924|ref|XP_980927.2| PREDICTED: jumonji d (2530) 16054 2817.8 0 gi|97054094|sp|Q69ZK6.2|JHD2C_MOUSE RecName: Full= (2350) 15633 2744.2 0 gi|109509427|ref|XP_228122.4| PREDICTED: similar t (2615) 14941 2623.3 0 gi|109089661|ref|XP_001091777.1| PREDICTED: simila (2536) 13970 2453.6 0 gi|114630701|ref|XP_001166111.1| PREDICTED: jumonj (2540) 13970 2453.6 0 gi|85541650|sp|Q15652.2|JHD2C_HUMAN RecName: Full= (2540) 13965 2452.8 0 gi|119574627|gb|EAW54242.1| jumonji domain 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