FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA2002.ptfa, 710 aa vs ./tmplib.26680 library 1768307 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0860+/-0.00599; mu= 13.6878+/- 0.401 mean_var=171.0819+/-39.703, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0981 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00269 ( 1185 res) msp04032 (1185) 691 110 1.2e-24 mFLJ00387 ( 590 res) mbj00169 ( 590) 187 39 0.0023 >>mFLJ00269 ( 1185 res) msp04032 (1185 aa) initn: 1504 init1: 441 opt: 691 Z-score: 534.9 bits: 110.2 E(): 1.2e-24 Smith-Waterman score: 1481; 40.223% identity (46.677% ungapped) in 716 aa overlap (35-708:525-1183) 10 20 30 40 50 60 mKIAA2 KMSLNGELCDRVTHEVAGELSPRDPRTPAGKQDGTSVTPTLPPPDLEREEEKDDTSDPTD .... :..:.. . . : : .: mFLJ00 LEAFSPPPPPPKSRHLLKMNKSSSDLEKVSQSSAESLSPSFRGAHVSFTTGSTD-SLASD 500 510 520 530 540 550 70 80 90 100 110 120 mKIAA2 VSPCSATYSNLGQSRAAMIPPKHPRHPKGAVDDAIAFGEKTDQEGLNASQPT-PPPLPKK ::: . ... : :. : . : . .. .. :. :::::.: mFLJ00 SRPCSDGGPSYEPTHSPTISGKKLFAP-------VPFPSGSTEDVSPGGGPVQPPPLPQK 560 570 580 590 600 130 140 150 160 mKIAA2 MI--RANTEP--------------ISKDLQKAM-ESSLCVMANPTYDIDPNWDASSAGSS : :: . : : :. . :...:. .: .. . : .:. mFLJ00 KIVSRAASSPDGFFWTQGSPKPRTASPKLNLSHSETNVCAHDEPPFNCSLN-----SGNR 610 620 630 640 650 660 170 180 190 200 210 220 mKIAA2 ISYELKGLDVESYESLERPLHKERPVPSA---ANSISSLATLSVKDRFSNSMESLSSRRG . .. : : ::. .. . : : ::: .. .. :.. : ..: . ::. . mFLJ00 SHHVFS-----SSEPLEKAFKGNAPWAPALGLANSKGGCGSPSLQCRAATS--TSSSQLS 670 680 690 700 710 230 240 250 260 270 280 mKIAA2 LSYRQTRSIQKPQRQALYRGLDNREEVVGKLRSLHTDALKRLAVKCEDLFMAGQKDQLRF .: . . : . : ..: .....: . .:: .:.:..: ::..:::::::.::: .::: mFLJ00 VSSQASSSSTQLQLHSLLSSISSKEGTYAKLGGLYTQSLARLVTKCEDLFMGGQKKELRF 720 730 740 750 760 770 290 300 310 320 330 340 mKIAA2 GVDSWSDFRLTSDKPCCEAGDAVYYTASYAKDPLSNYAVKICKSKAKESQQYYHSLAVRQ . . :: :.:: .::::..:::.:: :. ..:: : :::::::. .: .: mFLJ00 NENYWSLFKLTCNKPCCDSGDAIYYCATCSEDPGSIYAVKICKTPEPKSASY-----CSP 780 790 800 810 820 350 360 370 380 390 400 mKIAA2 SLPVHFNIQQDCGHFLAEVPSRLLPWEDPDAPEKAEDGTEDSEEEGKAETLGGNPEPCSE :.:::::::::::::.: ::: .: .::. : :. : .. .:.: mFLJ00 SVPVHFNIQQDCGHFVASVPSSMLA--SPDTSSK------DT-----APAV--SPQP--- 830 840 850 860 870 410 420 430 440 450 460 mKIAA2 TEPSQKENQRVTNRKQRSHVVVITREVPHLTVADFVRDSLAHHGNSPDLYERQVCLLLLQ :.:... :::::::::: :..::::::.: : :..:::.::.:::: mFLJ00 --PAQEQDC----------VVVITREVPHQTASDFVRDSMASHRAEPEVYERRVCFLLLQ 880 890 900 910 470 480 490 500 510 mKIAA2 LCSGLEHLKPYHVTHCDLRLENLLLV----QHQPGGAAQG--PSPADPCP------TLAC ::.:::::: . . : :: ::::::. : .:: .: :. .. :: : :: mFLJ00 LCNGLEHLKEHGIIHRDLCLENLLLAHCNPQISPGPSATPTVPTTTSRCPSAVPAATTAC 920 930 940 950 960 970 520 530 540 550 560 mKIAA2 ---P-----TRLIVSNFSQAKQK-SHLVDPQILRDQSRLAPEIITATQYKKCDEFQTGIL : :::.::: .:::: . .. : ..:.::::::..:.::.: :::::::: mFLJ00 QGGPGEKQLPRLIISNFLKAKQKPGGTTNLQQKKSQARLAPEIVSASQYRKFDEFQTGIL 980 990 1000 1010 1020 1030 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 IYEMLHLPNPFDENPELKEKEYTRTDLPRIPLRSPYSWGLQQLASCLLNPNPSERILISD :::.:: ::::. .:.:..: : ::: .: : :: :::::: ::. .: .:: :.. mFLJ00 IYELLHQPNPFEVRAQLRERDYRREDLPPLPTLSLYSPGLQQLAHLLLEADPIKRIRIGE 1040 1050 1060 1070 1080 1090 630 640 650 660 670 680 mKIAA2 AKGILQCLLWGPREDLFQIFTTSATLAQKNALLQNWLDIKRTLLMIKFAEKSLDREGGIS :: .:::::::::..: . :: . .. :.::.:.::.:.:.:::::..::. :. mFLJ00 AKRVLQCLLWGPRRELVEQPCTSEEVLCNT--LHNWIDMKRALMMMKFAEKAVDRRRGVE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 690 700 710 mKIAA2 LEDWLCAQYLAFATTDSLSYIVKILQYR :::::: :::: : .: .:.:: mFLJ00 LEDWLCCQYLASAEPGALLQSLKLLQLL 1160 1170 1180 >>mFLJ00387 ( 590 res) mbj00169 (590 aa) initn: 171 init1: 85 opt: 187 Z-score: 152.8 bits: 38.5 E(): 0.0023 Smith-Waterman score: 199; 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