# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/meg00878.fasta.nr -Q ../query/mKIAA2006.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA2006, 2383 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919179 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7250+/-0.000189; mu= 14.2505+/- 0.011 mean_var=94.3085+/-18.080, 0's: 36 Z-trim: 42 B-trim: 2 in 1/65 Lambda= 0.132068 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|158563867|sp|Q5DTT3.2|CJ018_MOUSE RecName: Full (2382) 15581 2980.8 0 gi|112180659|gb|AAH85160.1| BC016423 protein [Mus (2149) 14046 2688.3 0 gi|109505188|ref|XP_341553.3| PREDICTED: similar t (2384) 11904 2280.2 0 gi|49523371|gb|AAH75685.1| BC016423 protein [Mus m ( 941) 6167 1186.8 0 gi|34536595|dbj|BAC87659.1| unnamed protein produc ( 935) 6116 1177.1 0 gi|54611734|gb|AAH45617.1| BC016423 protein [Mus m ( 909) 5954 1146.2 0 gi|148700278|gb|EDL32225.1| mCG1986 [Mus musculus] ( 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