# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/meg00701.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0166.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0166, 2246 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7921246 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2074+/-0.000181; mu= 16.0035+/- 0.010 mean_var=74.4294+/-14.469, 0's: 34 Z-trim: 35 B-trim: 8 in 1/67 Lambda= 0.148663 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81175181|sp|Q8C3Y4.2|KNTC1_MOUSE RecName: Full= (2207) 14385 3096.3 0 gi|114647569|ref|XP_001168340.1| PREDICTED: Rough (2209) 11841 2550.6 0 gi|1723117|sp|P50748.1|KNTC1_HUMAN RecName: Full=K (2209) 11822 2546.6 0 gi|119618739|gb|EAW98333.1| kinetochore associated (2209) 11817 2545.5 0 gi|194214360|ref|XP_001492639.2| PREDICTED: simila (2208) 11785 2538.6 0 gi|126324288|ref|XP_001374157.1| PREDICTED: simila (2411) 9755 2103.3 0 gi|118098509|ref|XP_415157.2| PREDICTED: similar t 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