FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4087.ptfa, 1285 aa vs ./tmplib.26680 library 1767732 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2195+/-0.00535; mu= 16.7944+/- 0.357 mean_var=146.6289+/-34.279, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1059 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0868 ( 1399 res) mbg15527 (1399) 287 57 2.5e-08 mKIAA0533 ( 1702 res) mpf00729 (1702) 212 46 7.8e-05 mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 193 43 0.00056 mKIAA0578 ( 1553 res) mbg00030 (1553) 192 43 0.00062 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 189 42 0.00085 mKIAA0743 ( 1211 res) mbg16847 (1211) 186 42 0.001 >>mKIAA0868 ( 1399 res) mbg15527 (1399 aa) initn: 274 init1: 109 opt: 287 Z-score: 241.9 bits: 57.1 E(): 2.5e-08 Smith-Waterman score: 389; 21.327% identity (25.424% ungapped) in 1055 aa overlap (315-1256:255-1252) 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 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