FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0979.ptfa, 1191 aa vs ./tmplib.26680 library 1767826 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6800+/-0.00751; mu= 0.7373+/- 0.498 mean_var=282.7161+/-66.982, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0763 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0648 ( 1122 res) meh01005 (1122) 4472 507 9.7e-144 >>mKIAA0648 ( 1122 res) meh01005 (1122 aa) initn: 4472 init1: 4472 opt: 4472 Z-score: 2673.0 bits: 506.5 E(): 9.7e-144 Smith-Waterman score: 4472; 75.943% identity (75.943% ungapped) in 848 aa overlap (1-848:275-1122) 10 20 30 mKIAA0 FDLILELYNIDSHLLLSVLPQLEFKLKSND :::: ::. :: .:::::.::::::::::: mKIAA0 VQTIEACIANFFNQVLVLGRSSVSDLSEHVFDLIQELFAIDPQLLLSVMPQLEFKLKSND 250 260 270 280 290 300 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 NEERLQVVKLLAKMFGAKDSELASQNKPLWQCYLGRFNDIHVPIRLECVKFASHCLMNHP .:::: ::.::::.::.:::.::.::.:::::.::::::::::.::: :::::::::::: mKIAA0 GEERLAVVRLLAKLFGSKDSDLATQNRPLWQCFLGRFNDIHVPVRLESVKFASHCLMNHP 310 320 330 340 350 360 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 DLAKDLTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVSIVTAAKKDILLVNDHLLNFVRERTLDKRWRVR :::::::::::::::::::::::::::.:.::::.:. ::::.::.:::::::::::::: mKIAA0 DLAKDLTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVTIITAAKRDLALVNDQLLGFVRERTLDKRWRVR 370 380 390 400 410 420 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 KEAMMGLAQIYKKYSLQSAAGKDAAKQISWVKDKLLHIYYQNSIDDRLLVERIFAQYMVP :::::::::.:::: :.. :::.::...::.:::::::::::::::.::::.:::::.:: mKIAA0 KEAMMGLAQLYKKYCLHGEAGKEAAEKVSWIKDKLLHIYYQNSIDDKLLVEKIFAQYLVP 430 440 450 460 470 480 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 HNLETTERMKCLYYLYATLDLNAVKALNEMWKCQNLLRHQVKDLLDLIKQPKTDASVKAI ::::: :::::::::::.:: ::::::::::::::.:: .:..:::: ::: ..:. .:. mKIAA0 HNLETEERMKCLYYLYASLDPNAVKALNEMWKCQNMLRSHVRELLDLHKQPTSEANCSAM 490 500 510 520 530 540 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 FSKVMVITRNLPDPGKAQDFMKKFTQVLEDDEKIRKQLEALVSPTCSCKQAEGCVREITK :.:.:.:..:::::::::::.:.:.::: ::::.:.::: :.:::::::::. :::::.. mKIAA0 FGKLMTIAKNLPDPGKAQDFVKEFNQVLGDDEKLRSQLELLISPTCSCKQADVCVREIAR 550 560 570 580 590 600 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 KLGNPKQPTNPFLEMIKFLLERIAPVHIDTESISALIKQVNKSIDGTADDEDEGVPTDQA ::.::::::::::::.:::::::::::::.:.::::.: .::::.::::::.::: :.: mKIAA0 KLANPKQPTNPFLEMVKFLLERIAPVHIDSEAISALVKLMNKSIEGTADDEEEGVSPDSA 610 620 630 640 650 660 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 IRAGLELLKVLSFTHPISFHSAETFESLLACLKMDDEKVAEAALQIFKNTGSKIEEDFPH ::.::::::::::::: :::::::.:::: ::.:.:.::::::.:::.::: ::: :.:. mKIAA0 IRSGLELLKVLSFTHPTSFHSAETYESLLQCLRMEDDKVAEAAIQIFRNTGHKIETDLPQ 670 680 690 700 710 720 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 IRSALLPVLHHKSKKGPPRQAKYAIHCIHAIFSSKETQFAQIFEPLHKSLDPSNLEHLIT :::.:.:.::.:.:.: :.::: :.::::::::.::.:.::::::: .::. . :.::: mKIAA0 IRSTLIPILHQKAKRGTPHQAKQAVHCIHAIFSNKEVQLAQIFEPLSRSLNADVPEQLIT 730 740 750 760 770 780 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 PLVTIGHIALLAPDQFAAPLKSLVATFIVKDLLMNDRLPGKKTTKLWVPDEEVSPETMVK :::..:::..:::::::.:.::.::.::::::::::: :.:. ::: ::::::::...: mKIAA0 PLVSLGHISMLAPDQFASPMKSVVANFIVKDLLMNDRSTGEKNGKLWSPDEEVSPEVLAK 790 800 810 820 830 840 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 IQAIKMMVRWLLGMKNNHSKSGTSTLRLLTTILHSDGDLTEQGKISKPDMSRLRLAAGSA . ....::::::::::.:::..::::::...: :.:::::: .::: :::::::::::: mKIAA0 VYLLRLLVRWLLGMKNNQSKSANSTLRLLSAMLVSEGDLTEQKRISKSDMSRLRLAAGSA 850 860 870 880 890 900 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 IVKLAQEPCYHEIITLEQYQLCALAINDECYQVRQVFAQKLHKGLSRLRLPLEYMAICAL :.::::::::::::: ::.:::::.::::::::::.:::::::.: .: :::::::: :: mKIAA0 IMKLAQEPCYHEIITPEQFQLCALVINDECYQVRQIFAQKLHKALVKLLLPLEYMAIFAL 910 920 930 940 950 960 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 CAKDPVKERRAHARQCLVKNITVRREYLKQHAAVSEKLLSLLPEYVVPYTIHLLAHDPDY :::::::::::::::::.:::..::::.::. ..:::::::::::::: :::::::::. mKIAA0 CAKDPVKERRAHARQCLLKNISIRREYIKQNPMATEKLLSLLPEYVVPYMIHLLAHDPDF 970 980 990 1000 1010 1020 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 VKVQDIEQLKDVKECLWFVLEILMAKNENNSHAFIRKMVENIKQTKDAQGPDDTKMNEKL .. ::..::.:.::::::.::.::.:::::::::..::.:::: :.:::.::..: :::: mKIAA0 TRSQDVDQLRDIKECLWFMLEVLMTKNENNSHAFMKKMAENIKLTRDAQSPDESKTNEKL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 YTVCDVAMNIIMSKSTTYSLESPKDPVLPARFFTQPDKNFSNTKNYLPPEMKSFFTPGKP :::::::. .: :::. . .:::::::: .:::::.: mKIAA0 YTVCDVALCVINSKSALCNADSPKDPVLPMKFFTQPEK 1090 1100 1110 1120 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 KTANVLGAVNKPLSSAGKQSQTKSSRMETVSNASSSSNPSSPGRIKGRLDSSEMDHSENE 1191 residues in 1 query sequences 1767826 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:33:11 2006 done: Mon Mar 27 10:33:12 2006 Scan time: 1.070 Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]