FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1617.ptfa, 948 aa vs ./tmplib.26680 library 1768069 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9889+/-0.00496; mu= 10.7898+/- 0.330 mean_var=121.7309+/-27.867, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1162 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00162 ( 718 res) mej01253 ( 718) 455 88 4.4e-18 mKIAA1798 ( 761 res) mpm09365 ( 761) 376 75 4.5e-14 mFLJ00197 ( 362 res) mfj37062 ( 362) 219 48 2.3e-06 mKIAA0681 ( 826 res) mzz00001 ( 826) 152 37 0.0097 >>mFLJ00162 ( 718 res) mej01253 (718 aa) initn: 550 init1: 326 opt: 455 Z-score: 416.9 bits: 88.1 E(): 4.4e-18 Smith-Waterman score: 832; 32.857% identity (35.698% ungapped) in 490 aa overlap (34-505:173-641) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 LGGLLISMERYLPVSKKRNSSSSLEKITGSANGNGTLYSEEDTNLEE--NDFSWGDYLEE :.:.: : . :. . :.:: .:.. mFLJ00 LARLQGKPPTKKAKVLHKAAWSAKIGAFLHAQGTGQLADGTPTGQDALVLGFDWGKFLKD 150 160 170 180 190 200 70 80 90 100 110 mKIAA1 TGTRAVPHVSFRHVEISIR-SNFQPGMKLEVANKNN--PD-TYWVATIITTCGQLLLLRY . .:.: :.:: . . . . :::.:: :.. :. .::.::.: . : .:::: mFLJ00 HSYKAAPVSCFKHVPLYDQWEDVMKGMKVEVLNSDAVLPSRVYWIATVIQAAGYRVLLRY 210 220 230 240 250 260 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 CGYGEDRRADFWCDVIIADLHPVGWCTQNNKVLRPPDAIKDKYSDWTDFLIRELTGSRTA :. .: ::::.. .:.::.:::. :.:.: :: .:. :..:: ..:...:.:::: mFLJ00 EGFENDASHDFWCNLGTVDVHPIGWCAINSKILVPPRTIHAKFTDWKSYLMKRLVGSRTL 270 280 290 300 310 320 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 PANL-LEGPLRGKGPIDLITVDSLIELQDSQNPFQYWIVSVTENVGGRLRLRYVGLEHTE ::.. .. : :. .:. :. . . .. : .:::::: : . . mFLJ00 PADFHIKMVESMKYPFRQ---GMRLEVVDKTQVSRTRMAVVDTVIGGRLRLLYEDGDSDD 330 340 350 360 370 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 SYDRWLFYLDYRLRPIGWCQE--NKYRM-DPPSDLYYLKLPFEWKCALEKALVLAAESPL : : . . ..:.:: .. . .: : :. . . : . . mFLJ00 --DFWCHMWSPLIHPVGWSRRVGHGIKMSDRRCDMSHHPTFRKIYC-----------DAV 380 390 400 410 420 300 310 320 330 340 mKIAA1 PMEVFKDHA-DLQSHFFTVGMRLETLHISDPFH---IYPASVTKVFNSKFFQVAIDDLRP :. : .: .. .: ::.::.. ::.. : :.. ::. . .... .: : mFLJ00 PYLFKKVRAVYTEGGWFEEGMKLEAI---DPLNLGSICVATICKVLLDGYLMICVDG-GP 430 440 450 460 470 480 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 EADKPTMLC-HADSLGILPVQWCLKNGVNLAPPKGYSGQDFNWVDYHKQRQAEEAPHFCF .: .: ::.: .:.:. .: :: ..:.::::: : : : : .. ... :: : mFLJ00 STDGSDWFCYHASSHAIFPATFCQKNDIELTPPKGYETQPFAWETYLEKTKSKAAPARLF 490 500 510 520 530 540 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 K-NAFSRGFSKNMKLEAVNPVNPGEVCVATVVSVKGRLLWLHLEGLETPMPDIIVDMDSM . . ..::. .::::::. ..: .::::: : ::: .:..: .. . : :: .: mFLJ00 NMDCPNHGFKVGMKLEAVDLMEPRLICVATVKRVVHRLLSIHFDGWDNEY-DQWVDCESP 550 560 570 580 590 600 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 DIFPVGWCEANSYPLTTPYKA--SSKSKRKTVHFKMEKQLLSPVPIEKIPHELCLLPPQM ::.:::::: ..: : : .: .. .: : . : .::. mFLJ00 DIYPVGWCELTGYQLQPPVSAEPNTPQKGKDTTKKKKKQFGKKRKRIPSAKTRPLRQGSK 610 620 630 640 650 660 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 DSPVGAINAKYCCPQLFVNHRCFSGPFLNKGRISELPQSVGPGMCVLVLKEILTLITNAA mFLJ00 KPLLEDNLEALGVSEPVPDDIIAVCVKEEHQDISSLDRSPSPQLPLPIESIKQERNN 670 680 690 700 710 >>mKIAA1798 ( 761 res) mpm09365 (761 aa) initn: 349 init1: 171 opt: 376 Z-score: 345.0 bits: 74.9 E(): 4.5e-14 Smith-Waterman score: 515; 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