# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbp18039.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1617.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1617, 948 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916667 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9997+/-0.000188; mu= 15.0126+/- 0.011 mean_var=81.2780+/-15.672, 0's: 40 Z-trim: 50 B-trim: 3 in 1/65 Lambda= 0.142262 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|67461554|sp|Q5DTW2.2|SMBT2_MOUSE RecName: Full= ( 938) 6388 1321.6 0 gi|74188606|dbj|BAE28050.1| unnamed protein produc ( 942) 6364 1316.6 0 gi|74184795|dbj|BAE27994.1| unnamed protein produc ( 975) 4643 963.4 0 gi|67461560|sp|Q5VUG0.1|SMBT2_HUMAN RecName: Full= ( 894) 3956 822.4 0 gi|73949162|ref|XP_850333.1| PREDICTED: similar to ( 894) 3910 813.0 0 gi|149743590|ref|XP_001500014.1| PREDICTED: simila ( 894) 3890 808.9 0 gi|109088168|ref|XP_001118715.1| PREDICTED: Scm-li ( 881) 3871 804.9 0 gi|119923717|ref|XP_607062.3| PREDICTED: similar t ( 891) 3870 804.7 0 gi|189518188|ref|XP_683042.3| PREDICTED: Scm-like ( 858) 2892 604.0 9.6e-170 gi|55962228|emb|CAI11875.1| novel protein similar ( 860) 2892 604.0 9.7e-170 gi|50754123|ref|XP_414254.1| PREDICTED: similar to ( 867) 2651 554.5 7.5e-155 gi|6635353|gb|AAF19794.1|AF168132_1 RU1 [Homo sapi ( 866) 2618 547.8 8.2e-153 gi|114587351|ref|XP_001172770.1| PREDICTED: Scm-li ( 866) 2618 547.8 8.2e-153 gi|67461585|sp|Q9UHJ3.2|SMBT1_HUMAN RecName: Full= ( 866) 2618 547.8 8.2e-153 gi|109039108|ref|XP_001084525.1| PREDICTED: simila ( 866) 2617 547.6 9.5e-153 gi|109039126|ref|XP_001084404.1| PREDICTED: simila ( 863) 2609 545.9 3e-152 gi|114587359|ref|XP_516523.2| PREDICTED: Scm-like ( 823) 2604 544.9 5.8e-152 gi|119585675|gb|EAW65271.1| Scm-like with four mbt ( 823) 2604 544.9 5.8e-152 gi|109039123|ref|XP_001084282.1| PREDICTED: simila ( 823) 2603 544.7 6.7e-152 gi|224065903|ref|XP_002193767.1| PREDICTED: Scm-li ( 867) 2600 544.1 1.1e-151 gi|76648990|ref|XP_589414.2| PREDICTED: Scm-like w ( 865) 2599 543.9 1.2e-151 gi|73985463|ref|XP_850085.1| PREDICTED: similar to ( 866) 2595 543.1 2.2e-151 gi|126336618|ref|XP_001380240.1| PREDICTED: simila ( 917) 2583 540.6 1.2e-150 gi|149728585|ref|XP_001492212.1| PREDICTED: Scm-li ( 866) 2566 537.1 1.3e-149 gi|67461581|sp|Q9JMD1.1|SMBT1_MOUSE RecName: Full= ( 863) 2553 534.4 8.5e-149 gi|67461213|sp|Q9JMD2.2|SMBT1_RAT RecName: Full=Sc ( 863) 2540 531.8 5.4e-148 gi|8100077|dbj|BAA96304.1| polycomb-group protein ( 863) 2539 531.6 6.2e-148 gi|110331867|gb|ABG67039.1| Scm-like with four mbt ( 639) 2454 514.0 9e-143 gi|116283581|gb|AAH18217.1| Sfmbt1 protein [Mus mu ( 644) 2430 509.1 2.8e-141 gi|74140645|dbj|BAE35882.1| unnamed protein produc ( 636) 2423 507.6 7.4e-141 gi|74191808|dbj|BAE32857.1| unnamed protein produc ( 637) 2422 507.4 8.5e-141 gi|210101401|gb|EEA49466.1| hypothetical protein B ( 841) 2325 487.6 1e-134 gi|27370691|gb|AAH36972.1| Sfmbt1 protein [Mus mus ( 591) 2267 475.6 3e-131 gi|5262586|emb|CAB45734.1| hypothetical protein [H ( 711) 2090 439.3 3e-120 gi|148676061|gb|EDL08008.1| mCG20492 [Mus musculus ( 836) 2027 426.5 2.6e-116 gi|149021009|gb|EDL78616.1| Scm-like with four mbt ( 696) 1846 389.2 3.5e-105 gi|42490841|gb|AAH66188.1| Sfmbt1 protein [Mus mus ( 465) 1666 352.1 3.5e-94 gi|29028244|gb|AAO61788.1| Scm-related protein [Mu ( 533) 1578 334.1 1e-88 gi|215506897|gb|EEC16391.1| conserved hypothetical ( 635) 1486 315.3 5.7e-83 gi|26333843|dbj|BAC30639.1| unnamed protein produc ( 183) 1192 254.5 3.5e-65 gi|74214191|dbj|BAE40348.1| unnamed protein produc ( 216) 1192 254.5 3.9e-65 gi|156213894|gb|EDO34899.1| predicted protein [Nem ( 556) 1162 248.8 5.4e-63 gi|47218992|emb|CAG02030.1| unnamed protein produc ( 954) 1073 230.7 2.5e-57 gi|169642215|gb|AAI60499.1| LOC100145310 protein [ ( 310) 983 211.8 4.1e-52 gi|56204571|emb|CAI19140.1| Scm-like with four mbt ( 186) 979 210.7 5.1e-52 gi|210109551|gb|EEA57420.1| hypothetical protein B ( 583) 919 198.9 5.8e-48 gi|47218292|emb|CAG04124.1| unnamed protein produc ( 875) 901 195.4 1e-46 gi|189525155|ref|XP_001922723.1| PREDICTED: Scm-li ( 891) 895 194.2 2.4e-46 gi|149423866|ref|XP_001517763.1| PREDICTED: simila ( 283) 847 183.8 9.7e-44 gi|212518358|gb|EEB20111.1| conserved hypothetical ( 968) 831 181.1 2.3e-42 >>gi|67461554|sp|Q5DTW2.2|SMBT2_MOUSE RecName: Full=Scm- (938 aa) initn: 6388 init1: 6388 opt: 6388 Z-score: 7081.0 bits: 1321.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 6388; 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