FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0552.ptfa, 560 aa vs ./tmplib.26680 library 1768457 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1126+/-0.00859; mu= -7.8398+/- 0.568 mean_var=397.2146+/-96.170, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.0644 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1813 ( 675 res) mph02162 ( 675) 975 104 2.9e-23 mKIAA0341 ( 539 res) mbp04120 ( 539) 439 55 2.4e-08 >>mKIAA1813 ( 675 res) mph02162 (675 aa) initn: 814 init1: 494 opt: 975 Z-score: 510.1 bits: 104.5 E(): 2.9e-23 Smith-Waterman score: 1023; 39.539% identity (44.600% ungapped) in 564 aa overlap (7-526:100-643) 10 20 30 mKIAA0 SGLIMAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPD . :. : .. .:: : ::: mKIAA1 GYEAQEPLCPAVPPRKAVPGNSFTYVNEDFRTESPPSPSSDVEDPREHQAHNAHLRGPP- 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 mKIAA0 PRL--TMGSCSEP----LVRPSAFKPVVPK--NFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGP-AGLK :.: . :. . :.::.:::::.:: . :. .. :.. : : :: . : mKIAA1 PKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPGFLGPRAAGLS-GSQGSLTQLF 130 140 150 160 170 180 90 100 110 120 130 mKIAA0 GGLDKSRTMT--------PAGGSG-------GGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLS :: .: . . : . :: : :::::::::.::::::.. .. : . mKIAA1 GGPASSSSSSSSSSAADKPLALSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAE---PTT 190 200 210 220 230 240 140 150 160 170 180 mKIAA0 ASTSHINRIGTAGYSSGSSGGGSGYQDLGT--SDSGRASSKSGSSSSMGR--SGHLGSGE : . ... . : . :. : . : :::::.::.....: :: .: :::: mKIAA1 NSPG--GHLPSHGPGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGA 250 260 270 280 290 300 190 200 210 220 230 mKIAA0 --------GGNGGLPFAACSPPSPSALIQE-LEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVAQV ::. . : ::: ::.. :: .: ..: :. :: :...:::.: :. mKIAA1 RASPGSSSGGDRSPPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSMDESEATVCQA 310 320 330 340 350 360 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 LEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAAQLIR . ::. : :: .: :... ::...:.::::: :::::..:::.:.:::.. :::.. mKIAA1 FGARQRRWPRERGE---DCAAQAQQATQRVQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQ 370 380 390 400 410 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 QREELEDKVAVCQKEQADFLPRMEETKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVG .::.:: . :. ..:: .. ::.::::::::::.:::::::::::.:::.. :: ::.:. mKIAA1 EREQLERRCATFEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVA 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 LRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFGSKQASLELSEGELPPACLKPALTPVDLVEPQEA :: :::.::.:: .: . .:... ... :: :: . . .: . mKIAA1 LRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARAREQELE--------ACSQELQRYRQEAERLRE 480 490 500 510 520 530 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 LASCESDEAKMRRQAGVAAAAS---LVSVDGEVE----AGGEGGTRALRREVGRLQAELA :. . ::. :. : :.. :.. . :.. :.: ::. :: .: ::. :: mKIAA1 KAGHLDAEASGLRDPPVPPATTDPFLLAESDEAKVQRAAAGAGGS--LRAQVERLRQELQ 540 550 560 570 580 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 AERRARERQGASFAEERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGG :.: ..: :: :: .: :::.::.:::::: .:..::.::.:::..:.. mKIAA1 REQRRGDEQRDSFEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELE 590 600 610 620 630 640 540 550 560 mKIAA0 SSTPTPQHGEEKKAWTPSRLERIESTEI mKIAA1 ARELADLGLAESAPCICLEEITATEI 650 660 670 >>mKIAA0341 ( 539 res) mbp04120 (539 aa) initn: 677 init1: 233 opt: 439 Z-score: 242.3 bits: 54.6 E(): 2.4e-08 Smith-Waterman score: 613; 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