FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0750.ptfa, 1106 aa vs ./tmplib.26680 library 1767911 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6934+/-0.00515; mu= 11.5030+/- 0.344 mean_var=181.1091+/-42.746, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0953 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1364 ( 776 res) mbg16438 ( 776) 3190 451 2.4e-127 mFLJ00407 ( 1081 res) msh04044 (1081) 2138 307 1e-83 mFLJ00139 ( 992 res) mbp09110 ( 992) 349 61 1.1e-09 mKIAA1668 ( 883 res) mpf01101 ( 883) 339 60 2.6e-09 mKIAA0903 ( 1242 res) mfj01081 (1242) 321 57 1.8e-08 mKIAA4049 ( 1290 res) mbg01111 (1290) 297 54 1.8e-07 mKIAA0376 ( 1135 res) mbg00975 (1135) 294 53 2.2e-07 mKIAA4061 ( 1011 res) mbg07137 (1011) 287 52 4e-07 >>mKIAA1364 ( 776 res) mbg16438 (776 aa) initn: 3284 init1: 2613 opt: 3190 Z-score: 2378.8 bits: 451.4 E(): 2.4e-127 Smith-Waterman score: 3272; 67.886% identity (69.103% ungapped) in 738 aa overlap (5-731:3-738) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 VDRTMGENEDEKQAQASQVFENFVQATTCKGTLQAFNILTCLLDLDPLDHRNFYSQLKSK : : ..: :: .:. :::::::::::.::. : :.: : :.:.:: .:::: mKIAA1 GNMEERKQETTNQAHVLFDRFVQATTCKGTLRAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 VNTWKAKALWHKLDKRGSHKEYKRGKACSNTKCLIVGGGPCGLRTAIELAYLGAKVVVVE .: ::::::: :::::::::.::.::::.::::::.:.:::::::::.:. :::::::.: mKIAA1 LNYWKAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 KRDTFSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGSIDHISIRQLQLILFKVALMLGVE :::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::.::.: mKIAA1 KRDAFSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 VHVNVEFVRVLEPPEDQENQKVGWRAEFLPADHALSDFEFDVIIGADGHRNTLEGFRRKE .:::::: ...:::::::...:::: : : .:..::.::::.::.::::::::::: mKIAA1 IHVNVEFQGLVQPPEDQENERIGWRALVHPKTHPVSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 FRGKLAIAITANFINRNSTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQDLKEETGIDLENIVYYKDST :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:.: :::::::::::::.: mKIAA1 FRGKLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDT 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 HYFVMTAKKQSLLDKGVILNDYIDTEMLLCSENVNQDNLLSYAREAADFATNYQLPSLDF :::::::::::::::::::.:: :::.:: :::.:. ::.::::::::.:. ::::::: mKIAA1 HYFVMTAKKQSLLDKGVILHDYTDTELLLSRENVDQEALLNYAREAADFSTQQQLPSLDF 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 AINHNGQPDVAMFDFTSMYASENAALMRERQAHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGCARGFL :::: ::::::::::: :::::::::.::...:::::::::::::::::::::: ::::: mKIAA1 AINHYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFL 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 AAFDTAWMVKSWDQGTPPLEVLAERESLYRLLPQTTPENINKNFEQYTLDPATRYPNLNL ::.:.::::.::. :: ::::::::::.:::::::::::..::: ::..::.:::::.:. mKIAA1 AAMDSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINI 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 mKIAA0 HCVRPHQVKHLYITKEMDRFPLERWGSV--RRSVSLSRRESDIRPNKLLTWCQQQTKGYQ . .:: ::.::: . : . :: . : : . .:.: :: : .::: :::.::.::. mKIAA1 NFLRPSQVRHLYDSGETKDIHLEMENMVNPRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTEGYS 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 HVRVTDLTTSWRSGLALCAIIHSFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAKREFGILPVT : ::::: ::.:::::::::: .::.::.::::.:... .:::::::.:..:.:: :. mKIAA1 GVNVTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIM 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 TGKEMASTQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPMDSWRKNYGENADF-GLGKTFIQN-N :::::::. :::::::::::..:::.:. . : :. : :.: . . :. :. . mKIAA1 TGKEMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDS-LSSSDTLDLNAEEKAVLIASTKSPISFLS 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 YLNLTLPRKRTPRVDTQTEENDMNKRRRQGFNHLEELPSFSSR-------SLGSSQEYAK :. :. :::.:. : . ...: .::. . :: : : . : ..... mKIAA1 KLGQTISRKRSPK-DKKEKDSDGAGKRRKTSQSEEEEPPRSYKGERPTLVSTLTDRRMDA 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 ESGSQNKVKHMANQLLAKFEENTRNPSVVKQDCRRVSGIGKPVLCSASRPPGTSCCPKLE :.:::::.::.:::::::::. mKIAA1 AVGNQNKVKYMATQLLAKFEENAPAQSTGVRRQVSPKLSSRMTTWYRKEGLHAAISQALV 720 730 740 750 760 770 >>mFLJ00407 ( 1081 res) msh04044 (1081 aa) initn: 2219 init1: 1110 opt: 2138 Z-score: 1595.4 bits: 307.0 E(): 1e-83 Smith-Waterman score: 2139; 52.128% identity (54.016% ungapped) in 658 aa overlap (20-674:47-684) 10 20 30 40 mKIAA0 VDRTMGENEDEKQAQASQVFENFVQATTCKGTLQAFNILTCLLDLDPLD ::.:::: :. .:..:. : : .. mFLJ00 ADTGFSPSCSCCQQGPYMASPASTNPAHDHFETFVQAQLCQDVLSSFQGLCRALGVESGG 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 HRNFYSQLKSKVNTWKAKALWHKLDKRGSHKEYKRGKACSNTKCLIVGGGPCGLRTAIEL . : ..:...: :.::.:: :::::.:. :..:.::.:::::.::.::::::.:.:: mFLJ00 GLSQYHKIKAQLNYWSAKSLWAKLDKRASQPVYQQGQACTNTKCLVVGAGPCGLRAAVEL 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 AYLGAKVVVVEKRDTFSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGSIDHISIRQLQLI : :::.::.:::: :::.::::::::::::::.::::::::.::.:..::::::::::. mFLJ00 ALLGARVVLVEKRIKFSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQLL 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 LFKVALMLGVEVHVNVEFVRVLEPPEDQENQKVGWRAEFLPADHA-LSDFEFDVIIGADG :.::::.::::.: .:.:. . ::. . ::::.. : : :...::::.:.: : mFLJ00 LLKVALLLGVEIHWGVKFTGLQPPPR----KGSGWRAQLQPNPPAQLASYEFDVLISAAG 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 HRNTLEGFRRKEFRGKLAIAITANFINRNSTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQDLKEETGI . . ::: .:.::::::.:::::.: .. :..: :::::: :.::::::.: . ::: mFLJ00 GKFVPEGFTIREMRGKLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQKFFQSLLKATGI 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 DLENIVYYKDSTHYFVMTAKKQSLLDKGVILNDYIDTEMLLCSENVNQDNLLSYAREAAD :::::::::: ::::::::::: :: ::. .: .:..:: . :: . : .:: ::: mFLJ00 DLENIVYYKDETHYFVMTAKKQCLLRLGVLRQDLSETDQLLGKANVVPEALQRFARAAAD 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 FATNYQLPSLDFAINHNGQPDVAMFDFTSMYASENAALMRERQAHQLLVALVGDSLLEPF :::. .: .:.:: . :.:::: ::::::. .:..: ..:... .::..:::: :.::: mFLJ00 FATHGKLGKLEFAQDARGRPDVAAFDFTSMMRAESSARVQEKHGARLLLGLVGDCLVEPF 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 WPMGTGCARGFLAAFDTAWMVKSWDQGTPPLEVLAERESLYRLLPQTTPENINKNFEQYT ::.::: :::::::::.::::: : .:. ::::::::::::.:: ::.:::...: :: mFLJ00 WPLGTGVARGFLAAFDAAWMVKRWAEGAGPLEVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQYG 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 LDPATRYPNLNLHCVRPHQVKHLYITKEMDRFPLERWGSVRRSVSLSRRES--DIRPNKL ::::::::::::. : :.::. :: ::. .: . . ::. . . ..: mFLJ00 LDPATRYPNLNLRAVTPNQVQDLY--DMMDKEHAQR----KSDEPDSRKTTTGSAGTEEL 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 LTWCQQQTKGYQHVRVTDLTTSWRSGLALCAIIHSFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFD : :::.:: :. :.:::...:: .::::::..: ..: :.. . :. :.: . :. mFLJ00 LHWCQEQTAGFPGVHVTDFSSSWADGLALCALVHHLQPGLLEPSELQGMGALEATTWALR 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 VAKREFGILPVTTGKEMASTQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPMDSWRKNYGENADF ::..:.:: :: ... . . ..: :... :::.:. :..: . . .: . mFLJ00 VAEHELGITPVLSAQAVMAGSDP--LGLIAYLSHFHSAFKNTSHSSGLVSQPSGTPSAIL 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 GLGKTFIQNNYLNLTLPRKRTPRVDTQTEENDMNKRRRQGFNHLEELPSFSSRSLGSSQE ::: :. .: : :. .:: .: mFLJ00 FLGK-------LQRSLQRTRA-KVDEETPSTEEPPVSEPSMSPNTPELSEHQEAGAEELC 670 680 690 700 710 >>mFLJ00139 ( 992 res) mbp09110 (992 aa) initn: 366 init1: 273 opt: 349 Z-score: 266.5 bits: 61.0 E(): 1.1e-09 Smith-Waterman score: 349; 29.392% identity (32.103% ungapped) in 296 aa overlap (537-822:1-281) 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 SVRRSVSLSRRESDIRPNKLLTWCQQQTKGYQHVRVTDLTTSWRSGLALCAIIHSFRPEL :. : .:..:::.:.:::.:::.: ::.: mFLJ00 YRDVSITNMTTSFRDGLAFCAILHRHRPDL 10 20 30 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 INFDSLNEDDAVENNQLAFDVAKREFGILPVTTGKEMASTQEPDKLSMVMYLSKFYELFR :::..: ... :::.:::.::....:: . ...:.. . ::.::.. :.:..:. :. mFLJ00 INFSALRKENIYENNKLAFQVAEEQLGIPALLDAEDMVALKVPDRLSILTYVSQYYNYFH 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 G-TPLRPMDSWRKNYGENADFGLGKT-FIQNNYLNLTLPRKRTPRVDTQTEENDMNKRRR : .:. : . .. ..... :: . : : .:.: ..: : . .: . mFLJ00 GRSPIGGMAGIKRPSSDSTEELSGKKGLSQPAKLPSPAQTQRSPLSPART--NPVVQRNE 100 110 120 130 140 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 QGFNHLEELPSFSSRSLGSSQEYAKESGSQNKVKHMANQLLAKFEENTRNPSVVKQDCRR : .. :. . . ::: .. : .: :.... :: . :. :: : mFLJ00 GGSQR--PSPKAAPGTAGSS--VSSICGVCGKHVHLVQRHLADGRLYHRSCFRCKQ-CSS 150 160 170 180 190 200 750 760 770 780 790 mKIAA0 V--SGI----GKP--VLCSASRPPGTSCCPKLEESTPRLPPPLKRQFSSTVATGQVLREL . :: :.: .:. :: :: . . : : . . . .:... ...: mFLJ00 TLHSGAYRATGEPGVFVCTHHSSEVTSVSPKSSNLASRKPGGVTAD-TRSVGVSWTVQE- 210 220 230 240 250 260 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 NQVPASGECPSRPWRARAKSDLQLGGVENLATLPRTCQGALALSGVLRRLQQVEEKVLQK :.:: . : :.:. . . :: mFLJ00 ----ANGE--GTPLRVRTAAWEHAGGNTTAKGFVQTELKPPSTSQVHVGSSAGPKLPTST 270 280 290 300 310 >>mKIAA1668 ( 883 res) mpf01101 (883 aa) initn: 482 init1: 339 opt: 339 Z-score: 259.6 bits: 59.5 E(): 2.6e-09 Smith-Waterman score: 346; 25.735% identity (29.006% ungapped) in 408 aa overlap (526-912:21-403) 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 EMDRFPLERWGSVRRSVSLSRRESDIRPNKLLTWCQQQTKGYQHVRVTDLTTSWRSGLAL ::.::..: .::. : . ::..:.:.:::. mKIAA1 PIPSPGRLRAGPAMAGPRGALLAWCRRQCEGYRGVDIRDLSSSFRDGLAF 10 20 30 40 50 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 CAIIHSFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAKREFGILPVTTGKEMASTQEPDKLSMV :::.: ::.:..:.::..... :::.:::.::..:.:: . ..:.: . :: ::.. mKIAA1 CAILHRHRPDLLDFQSLSKENVFENNRLAFEVAEKELGIPALLDPNDMVSMSVPDCLSIM 60 70 80 90 100 110 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 MYLSKFYELFRGTPLRPMDSWRKNYGENADFGLGKTFIQNNYLNLTLPRKRTPRVDTQTE :.:..:. : .. . . :: . . : : . : ..: . mKIAA1 TYVSQYYNHFTSSGQAAASPPKP----------GKDPAPPSPTS-TSPAVQ-PGEEAQGD 120 130 140 150 680 690 700 710 720 mKIAA0 ENDMNKRRRQGFNHLEELPSFSSRSLGSS----QEYAKESGSQNK----VKHMANQLL-A . . .. .:: .. :: . . :. :.: :. .. .. .. :. . mKIAA1 DLSPDSLSEQG---KQQPPSSACAACGQRVHLVQRYLAEGRLYHRHCFRCRQCSSTLVPG 160 170 180 190 200 210 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 KFEENTRNPS-VVKQDCRRV---SGIGKPVLCSASRPPGTSCCPKLEESTPRLPPPLKRQ .. . .. . : . : :. : : .: . . :... :.. : : . mKIAA1 SYSSGPEEGTFVCAERCTRLGPGSRSGTRLLSQQRQQPAAAEAKDAEDNDPSLSVAAVAE 220 230 240 250 260 270 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 FSSTVATGQVLRELNQVPASGECPSRPWRARAKSDLQLGGVENLATLPRTCQGALALSGV . :...: ..:.. ::.: . . :: . : :: . . ::. mKIAA1 ADRLQASSEVQF---HTPTKPPLPSKPQELASPP----GGRPTPA--PRKASESSALTPP 280 290 300 310 320 850 860 870 880 890 mKIAA0 LRR----LQQVEEKVLQKRAQNLANREFHTKNI-KEKAAHLAS--MFGHGDLPQDKLLSK : ::: . : :. ...:.: ... . : ... : : . : : . mKIAA1 TPRPRSSLQQ-DGTVEQSVSSGLVNGRLQEPPVPKPRGTPKLSERMAAPRKDPPWITLVQ 330 340 350 360 370 380 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 RVPHAHP-PSPPSCLPSPHPAAASSPPAADSVSPARKLTVGKVSSGIGAAAEVLVNLYLN :. .: :.::: :.: mKIAA1 TEPKKKPAPQPPSSGPGPLSQAYRQVEDGGLEEQTQKSSGTEPEPKPYNPFEEEEEEEGE 390 400 410 420 430 440 >>mKIAA0903 ( 1242 res) mfj01081 (1242 aa) initn: 324 init1: 261 opt: 321 Z-score: 244.5 bits: 57.2 E(): 1.8e-08 Smith-Waterman score: 321; 28.926% identity (30.702% ungapped) in 242 aa overlap (522-757:463-696) 500 510 520 530 540 mKIAA0 YITKEMDRFPLERWGSVRRSVSLSRRESDIRPN---KLLTWCQQQTKGYQHVRVTDLTTS .:: .::.::.. ::.:. :..:..::: mKIAA0 GVNENTVVSAGKDLSTSPKPSPIPSPVLGQKPNASQSLLAWCREVTKNYRGVKITNFTTS 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 WRSGLALCAIIHSFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAKREFGILPVTTGKEMASTQE ::.::..:::.: :::.::.. ::: .: :::. :.: . .:: . ..:. mKIAA0 WRNGLSFCAILHHFRPDLIDYKSLNPQDIKENNKKAYD-GFASIGISRLLEPSDMVLLAI 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 PDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPMDSWRKNYGENADFGLGKTFIQNNYLNLTLPRKRTP ::::... :: .. : : : .. ..: .... . .:. ..: . . .: mKIAA0 PDKLTVMTYLYQIRAHFSGQELNVVQI-EENSSKST-YKVGNYETDTN--SSVDQEKFYA 560 570 580 590 600 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 RVDTQTEENDMNKRRRQGFNHLEELPSFSSRSLGSSQEYAKESGSQNKVKHMANQLLAKF ... .: . .. : . . : . : . : .. .:: :. :.. . . . mKIAA0 ELSDLKREPEPHQPARGAVDLLSQDDSVFVTDSGVGE---SESEHQTPDDHLSPSTASPY 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 EENTRN---PSVVKQDCRRVSGIGKPVLCSASRPPGTSCCPKLEESTPRLPPPLKRQFSS . :.. :. .:. :.:: : : :.. mKIAA0 YRRTKSDTEPQKSQQSSARTSGSDDPGLSSSTDSAQALASLGKKRLKAENLELSDLCVSD 670 680 690 700 710 720 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 TVATGQVLRELNQVPASGECPSRPWRARAKSDLQLGGVENLATLPRTCQGALALSGVLRR mKIAA0 KKKDVSPLSAYEQKLQTVHASSDMEQGKMEKSRSLECRLDGELAITKPNVSSPSKLGYNR 730 740 750 760 770 780 >>mKIAA4049 ( 1290 res) mbg01111 (1290 aa) initn: 250 init1: 250 opt: 297 Z-score: 226.5 bits: 53.9 E(): 1.8e-07 Smith-Waterman score: 297; 29.474% identity (31.111% ungapped) in 190 aa overlap (458-645:123-304) 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 MVKSWDQGTPPLEVLAERESLYRLLPQTTPENINKNFEQYTLDPATRYPNLNLHCVRP-- ::..: . :. . .. :.. : . mKIAA4 DGRMLIKLLEVLSGERLPKPTKGRMRIHCLENVDKAL-QFLKEQRVHLENMGSHDIVDGN 100 110 120 130 140 150 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 HQVKHLYITKEMDRFPLERWGSVRRSVSLSRRESDIRPNKLLTWCQQQTKGYQHVRVTDL :.. : . :: .. ::. . . .:. . :: :::..: :: .: . .. mKIAA4 HRLTLGLIWTIILRFQIQDI-SVE---TEDNKEKKSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNIHNF 160 170 180 190 200 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 TTSWRSGLALCAIIHSFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAKREFGILPVTTGKEMAS :::::.:.:. :.::. ::.::.::.:....: : : ::..:....:. . ... : mKIAA4 TTSWRDGMAFNALIHKHRPDLIDFDKLKKSNAHYNLQNAFNLAEQHLGLTKLLDPEDI-S 210 220 230 240 250 260 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 TQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPMDSWRKNYGENADFGLGKTFIQNNYLNLTLPRK ...::. :.. :. .:. : . .. . : :. : mKIAA4 VDHPDEKSIITYVVTYYHYF--SKMKALAVEGKRIGKVLDNAIETEKMIEKYESLASDLL 270 280 290 300 310 320 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 RTPRVDTQTEENDMNKRRRQGFNHLEELPSFSSRSLGSSQEYAKESGSQNKVKHMANQLL mKIAA4 EWIEQTIIILNNRKFANSLVGVQQQLQAFNTYRTVEKPPKFTEKGNLEVLLFTIQSKMRA 330 340 350 360 370 380 >>mKIAA0376 ( 1135 res) mbg00975 (1135 aa) initn: 222 init1: 222 opt: 294 Z-score: 224.9 bits: 53.5 E(): 2.2e-07 Smith-Waterman score: 294; 37.168% identity (37.500% ungapped) in 113 aa overlap (513-625:1022-1133) 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 VRPHQVKHLYITKEMDRFPLERWGSVRRSVSLSRRESDIRPNKLLTWCQQQTKGYQHVRV .:.:. . . : :: :::..:.:::.. . mKIAA0 PQLSLSSSPTASVTPSTRSRIREERKDPLSALAREYGGSKRNALLKWCQKKTEGYQNIDI 1000 1010 1020 1030 1040 1050 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 TDLTTSWRSGLALCAIIHSFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAKREFGILPVTTGKE :....:: .:::.::..:.. : : .. :: .: .: :::..:. :: . .: mKIAA0 TNFSSSWNDGLAFCALLHTYLPAHIPYQELNSQDKKRNFTLAFQAAES-VGIKSTLDINE 1060 1070 1080 1090 1100 1110 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 MASTQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPMDSWRKNYGENADFGLGKTFIQNNYLNLTL :: :..:: ....:.. .:. :. mKIAA0 MARTERPDWQNVMLYVTAIYKYFET 1120 1130 >>mKIAA4061 ( 1011 res) mbg07137 (1011 aa) initn: 214 init1: 214 opt: 287 Z-score: 220.3 bits: 52.4 E(): 4e-07 Smith-Waterman score: 287; 37.168% identity (37.500% ungapped) in 113 aa overlap (513-625:898-1009) 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 VRPHQVKHLYITKEMDRFPLERWGSVRRSVSLSRRESDIRPNKLLTWCQQQTKGYQHVRV .:.:. . . : :: :::..:.:: .. . mKIAA4 LGFGNTRLLSASTGGLKPSKLSVERRDPLAALAREYGGSKRNALLKWCQKKTEGYANIDI 870 880 890 900 910 920 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 TDLTTSWRSGLALCAIIHSFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAKREFGILPVTTGKE :....:: .::::::..:.. : : .. :: .. .: :::..:. :: : .: mKIAA4 TNFSSSWSDGLALCALLHTYLPAHIPYQELNSQEKKRNLLLAFEAAQS-VGINPSLELSE 930 940 950 960 970 980 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 MASTQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPMDSWRKNYGENADFGLGKTFIQNNYLNLTL : :..:: :...:....:. :. mKIAA4 MLYTDRPDWQSVMQYVAQIYKYFET 990 1000 1010 1106 residues in 1 query sequences 1767911 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:27:51 2006 done: Mon Mar 27 10:27:52 2006 Scan time: 1.050 Display time: 0.370 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]