FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0986.ptfa, 921 aa vs ./tmplib.26680 library 1768096 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9828+/-0.00437; mu= 14.5654+/- 0.294 mean_var=84.7661+/-19.101, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1393 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3021 ( 756 res) mbg12853 ( 756) 2445 502 1.1e-142 mKIAA0532 ( 1603 res) mbg05668 (1603) 307 73 4.1e-13 mKIAA0453 ( 1918 res) mbg01969 (1918) 277 67 3.1e-11 >>mKIAA3021 ( 756 res) mbg12853 (756 aa) initn: 2187 init1: 1447 opt: 2445 Z-score: 2653.9 bits: 502.1 E(): 1.1e-142 Smith-Waterman score: 2445; 49.934% identity (51.565% ungapped) in 759 aa overlap (170-915:2-749) 140 150 160 170 180 190 mKIAA0 GLKMEYQVGVTINLSSFNITRIVTFIPFYMIKNKSKYHISVAEEGSD------KWLSLDL . :::. . :.: .:: :: . mKIAA3 PVANKSSLDLEVGEIASDGSIPTNKWHYVAS 10 20 30 200 210 220 230 240 250 mKIAA0 EQSIPFWPENASNILLIQVERSEDPPKRIYFNKQDNCILLRLNNELGGIIAEVNLAEHST . ::::::: :. : . : : : ...:.::: :: :.. :::....: ::::: mKIAA3 SECIPFWPENLSGKLCVGVVGYEGSSKPFFYNRQDNGTLLSLEDLNGGILVDINTAEHST 40 50 60 70 80 90 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 VITFSDYHDGAATFLLINHTKSDPVQYNQSSLGEIEDSLPPGKAVYYTWADPVGSRKLKW ::::::::.:.: :..:::. : . :.::. : : : ::.. ..::::.: ::: : mKIAA3 VITFSDYHEGSAPALIMNHTQWDVLTYKQSGSQE-ELVLLPGETRLFAWADPTGIRKLTW 100 110 120 130 140 150 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 SCGQSYGEVTH-KDDM-MTPISVGKKTIYLVSFFEGLQRIILFTEDPRVFKVTYESEKAE . . ..:: ::. . : ... . :. :::..: ::..:::.: . . . ..:. : mKIAA3 NYAANFGEHDLLKDECGQFPYDANIQ-IHWVSFLDGRQRVLLFTDDVALVSKALQAEEME 160 170 180 190 200 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 LAELEVVLALQDVGISLVNNYTKQEVAYIGITSSDVVWEAKPKKKARWKPMSVKHTEKLE :. ::.:.:...:.::::: .::::.:.::::: :::: :::.: :::.: :. .:: mKIAA3 QADHEVALSLHSLGLSLVNNENKQEVSYVGITSSGVVWEMKPKQK--WKPFSQKQIMSLE 210 220 230 240 250 260 440 450 460 470 480 mKIAA0 KEFREYTEASPLEDK-VVELD-NIPVRLTPSGNDMKILQPHVIPVRRNYLPALKVEYNTS . . . . .:. :.:: :. : . .:.. : :..:..: ...::.. : mKIAA3 QAYSKRLAS---QDRGWVKLDSNFEVNFDKVPMEMRL--PIRCPIKRDFLSGIQVEFKQS 270 280 290 300 310 320 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 AHQSSFRIQIYRIQIQNQIHGAIFPFVFYPIKPPRSVTMDSAPKPFTDVSIVMRSAGHSQ :: :.: ..: .:..::. :..:: ::.:. ::.:...:: :::: :::.. : .:. mKIAA3 PHQRSLRARLYWLQVDNQLPGTMFPVVFHPVAPPKSIALDSEPKPFIDVSVITRFNEYSK 330 340 350 360 370 380 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 ISRIKYFKVLIQEMDLSLDLGFVYALADLVTKAE--VTEKTEVEHFHKDVEAFEQEYEVV . ..::: :::::: :..: ::. :. .: : . .:. ... ...:..:.. : mKIAA3 VLQFKYFMVLIQEMALKVDQGFLGAVISLFTPTTDPEAERKRTKLIQQDIDALNTELMES 390 400 410 420 430 440 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 SSVDQSQVNLFEYFHISPIKLHLSVSLSSGRDEAKDSEQHGGLIPVHSLNLLLKSIGATL : .:.: ...::.:::::.:::::.::.:: .:. .:. .: .::.::::::::::: mKIAA3 SMTDMSILSFFEHFHISPVKLHLSLSLGSGGEESDKEKQE--MIAIHSVNLLLKSIGATL 450 460 470 480 490 500 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 TDVQDVVFKLAFFELNYQFHTTSELQSEVIRHYSKQAIKQMYVLILGLDVLGNPFGLIRE :::.:..::::..:. :::. ..:. :.::::.: .::::::.:::::::::::::: mKIAA3 TDVDDLIFKLAYYEIRYQFYKRDQLMWSVVRHYSEQFLKQMYVLVLGLDVLGNPFGLIRG 510 520 530 540 550 560 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 FSEGVEAFFYEPYQGAIQGPEEFVEGMALGLKALVGGAVGGLAGAASKITSAMAKGVAAM .::::::.::::.:::.::::::.::...:...::: .::: ::..:.::....::.::. mKIAA3 LSEGVEALFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRSLVGHTVGGAAGVVSRITGSVGKGLAAI 570 580 590 600 610 620 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 TMDEDYQQKRREAMNKQPAGLREGITRGGKGLVSGFVSGITGIVTKPIKGAQKEGAAGFF :::..::::::: :..:: . ....:::::.. : :.:.:::.:::..::.:::::::: mKIAA3 TMDKEYQQKRREEMGRQPKDFGDSLARGGKGFLRGVVGGVTGIITKPVEGAKKEGAAGFF 630 640 650 660 670 680 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 KGVGKGLVGAVTRPTGGIIDMASSTFQGIKRATETSE-VESLRPPRFFNEDGVIRPYRLR ::.::::::::.:::::::::::::::::.:..:..: : ::::::...:::.:::: . mKIAA3 KGIGKGLVGAVARPTGGIIDMASSTFQGIQRVAESTEEVSSLRPPRLIHEDGIIRPYDRQ 690 700 710 720 730 740 910 920 mKIAA0 DGSGNQMLQASKSLI .. :...:. mKIAA3 ESEGSDLLEQEMGTQE 750 >>mKIAA0532 ( 1603 res) mbg05668 (1603 aa) initn: 416 init1: 286 opt: 307 Z-score: 327.7 bits: 72.7 E(): 4.1e-13 Smith-Waterman score: 394; 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