FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1305.ptfa, 1161 aa vs ./tmplib.26680 library 1767856 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6051+/-0.00408; mu= 13.9806+/- 0.273 mean_var=89.3903+/-20.649, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 30 in 1/35 Lambda= 0.1357 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0323 ( 718 res) mbg03489 ( 718) 884 184 1e-46 mKIAA0615 ( 919 res) mid10054 ( 919) 679 144 1.4e-34 mKIAA1726 ( 613 res) mbp12272 ( 613) 395 88 5.7e-18 mKIAA1466 ( 921 res) mbg06319 ( 921) 173 44 9.4e-05 >>mKIAA0323 ( 718 res) mbg03489 (718 aa) initn: 871 init1: 670 opt: 884 Z-score: 931.2 bits: 183.6 E(): 1e-46 Smith-Waterman score: 884; 64.179% identity (65.816% ungapped) in 201 aa overlap (23-218:436-636) 10 20 30 40 mKIAA1 VPSRSKHQFLKEGLLGAWEGSQRLSPHSQGT---NIVTSFQRYNEALNTPFE : :: ..:: :.::. ::..:::. :: mKIAA0 APEPPWPCGDRDRDRDRGDRGDKQQAGARGRGSPWKRGTRGGNLVTGTQRFQEALQDPFT 410 420 430 440 450 460 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 MNLSEEPGNPGLRRVVIDGSSVAMVHGLQHFFSCRGIAMAVQYFWNRGHREITVFVPTWQ . :.. ::.: ::..:::::.:::::::::.:: ::::.::::::.::::.:::::: :. mKIAA0 LCLANVPGQPDLRHIVIDGSNVAMVHGLQHYFSSRGIALAVQYFWDRGHRDITVFVPQWR 470 480 490 500 510 520 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 LKKNRRVRESHFLTKLHRLKMLSITPSQLENGKKITTYDYRFMVKLAEETDGVIVTNEQI ..:. .::::::: ::. :..::.:::.. .::.:..:: ::::::::::::.::.:.:. mKIAA0 FSKDSKVRESHFLQKLYSLSLLSLTPSRVMDGKRISSYDDRFMVKLAEETDGIIVSNDQF 530 540 550 560 570 580 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 HILMNNSKKLM--VKDRLLPFTFAGSLFMVPDDPLGRDGPTLEEFLKKPNRLDMDIGNFL . : ..: : : ...:::::::.:.:::::::::::.::::.:::::: : mKIAA0 RDLAEESDKWMAIIRERLLPFTFVGNLFMVPDDPLGRNGPTLDEFLKKPVRKQGSSKTQQ 590 600 610 620 630 640 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 KVWKTLPPSSASISELSDDADAEPLEDPQDVEEAGKEEGSLEEEPGIPKPDEEDEQDTNP mKIAA0 PSKGSTEQANQQQGKDADRSNGGIRKTRETERLRRQLLEVFWGQDHKVDFILQREPYCRD 650 660 670 680 690 700 >>mKIAA0615 ( 919 res) mid10054 (919 aa) initn: 669 init1: 506 opt: 679 Z-score: 712.9 bits: 143.5 E(): 1.4e-34 Smith-Waterman score: 679; 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