FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1318.ptfa, 1157 aa vs ./tmplib.26680 library 1767860 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1875+/-0.00745; mu= -13.9221+/- 0.490 mean_var=424.2512+/-103.704, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0623 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0306 ( 1359 res) mbh00666 (1359) 309 43 0.00034 mKIAA0181 ( 1169 res) mpm10369 (1169) 276 40 0.0024 >>mKIAA0306 ( 1359 res) mbh00666 (1359 aa) initn: 156 init1: 66 opt: 309 Z-score: 167.6 bits: 43.2 E(): 0.00034 Smith-Waterman score: 383; 25.124% identity (29.335% ungapped) in 808 aa overlap (65-827:347-1083) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 QITDEDTEAMSKVLMTALASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSALASGETPAQPT--NPPE ::: .. ...: :.:. . :: mKIAA0 GQGSTAVPLRPPPPGAGGPATPSKATRFPPTDSATFRRKRPESVGSLEAPGPSVIAAPPS 320 330 340 350 360 370 100 110 120 130 140 mKIAA1 SEG--IPTVLMSGS----DSAVMSSLPMPVSGSGAMPTPLLSIPDAGEIATLPKPVPDVE . : . :... : ... . : : : . :: .:: : : .... .:: . mKIAA0 GGGNLLQTLVLPPSKEDREGTRVPSAPAPPLAYGAPAAPLCR-PAATMVTNVVRPVSS-- 380 390 400 410 420 430 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 AMSPLLMTALTSTVMP-SQLISASSSGVMSPDTTQNINSEVMSAPPIRVSSTGLMSTLPV .:. ..: .: : :::. . . : .. .:.: .. :. :: ..: mKIAA0 --TPV---PIASKPFPTSGRAEASSNDIAGARTEMGTGSRVPGGSPMGVSL--VYSDKKS 440 450 460 470 480 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 RASDTAATPIQLMRVPASGNMSTSQKTVPVSGSMSTP-LMAVTSPGAIFTEQ-MPSTASG :. :. .: .:. : :... . :: .. ..:: : .::.. : : :..:. mKIAA0 AAAATSPAP-HLVAGPLLGTVGKAPATV-TNLLVGTPGYGAPASPAVQFIAQGAPGSATP 490 500 510 520 530 540 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 TMSTHLTMPQTPGTMPIGFMKSTSNGAVSAQQIRCSVSGMMSTQPVIATASEIMSVSQST . : : : .:.:... ::.. ...:. ..: .. : . ..:. . mKIAA0 AGSGASTGSGPNGPVPLGILQP---GALG------KAGGITQVQYILPTLPQQLQVAPAP 550 560 570 580 590 330 340 350 360 370 mKIAA1 VPTSGSVSTQKTRAPVSGPMSTTQIRTTASALTSTP-QMRATASGTMSIPLM----TAKT .:. :. :. :: ::: ::.:: : ::: .. :... : .::.. .: mKIAA0 APAPGT----KAAAP-SGPAPTTSIRFTLPPGTSTNGKVLAATAPTAGIPILQSVPSAPP 600 610 620 630 640 650 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 SGSASTLLMRDTASGVISVPQMRAPGSGTV--SKPLMTSKASGMFMQQMTTAAFGATPTS . :. .. : :: . :. ::. : . : :. ...: : . .. .: : mKIAA0 PKAQSVSPVQATPSG--GSAQL-LPGKVLVPLAAPSMSVRGGGA-GQPLPLVS---SPFS 660 670 680 690 700 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 L-MRDTASGGLSMPQMTD-PAS--GGMSTLLTRATASGTKSTSQMTATTSGGIFMPQTRL . ... :. .. :.: :.: .:. :. :: : : : . :. . : . mKIAA0 VPVQNGAQQPSKIIQLTPVPVSTPSGLVPPLSPATMPGPTSQPQKVLLPSSTRI---TYV 710 720 730 740 750 760 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 SGPGATSTPLMRATASEKMPSQAMNIQDSGGVSTPLMRPVALGGVQMRSQGSGTMSTPLL .. :. . :: ..: ::. .. . : .:. :::: ... .: . .. ::: mKIAA0 QSAGGHTLPLGTSSAC----SQTGTVTSYGPTSS-----VALGFTSLGPSGPAFVQ-PLL 770 780 790 800 810 560 570 580 590 mKIAA1 RASDSSEMS---MLLTKAPS---------SGERPLLLVRP----PASGEIAPHSRTP--- :... .. . .. .:: :: . : :.:. ..: :..: mKIAA0 SAGQAPLLAPGQVGVSPVPSPQLPPACTASGGPVITAFYPGSPAPTSAPLGPPSQAPPSL 820 830 840 850 860 870 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 VYGTISAPHMTTTASGVMTMSPMKTSVPVSESATLLRPTDSGVMSIPLTRTPASRAKSR- :: :. : : :. .. .: .:. .. . : :. .: :. :. :.: . . mKIAA0 VY-TV-ATSTTPPAATILPKGP-PASATATPAPTSPFPSATGSMTYSLVAPKAQRPSPKA 880 890 900 910 920 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 PQMATACGDMCPLPVRAPATAGISPSPVRSPASSTLSTLLRRPSDGAVTAELERVLGPAQ :: . : . .:: . .: . : .: .:. : . :.:. : .::: :. mKIAA0 PQKVKAA--IASIPV-GSFESGTTGRPGSTPRQSSDSGVAREPA--APESELEG--QPTP 930 940 950 960 970 980 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 FAAMTPGEMSKPLMRASAPGTTTMPLMSPMTSGEMSMPLMKTTPSGTMSTLQTKVMSSRA : : : : :.: : :: . : . . :: :: mKIAA0 PAPPPPTETWPPTARSSPPP----PLPAEERPGTKGPETASKFPS-----------SSSD 990 1000 1010 1020 780 790 800 810 820 mKIAA1 TSLPQPRNAASGVIANPPQRAPASG-AGSTPLMRVSGSGMMS--TPLLGATASGGMSMPQ .: . : .::. :::.: .::. ..:: . :: ..:.: .: mKIAA0 WRVPGLGLESRGEPPTPPSPAPATGPSGSSSGSSEGSSGRAAGDTPERKEVTSSGKKMKV 1030 1040 1050 1060 1070 1080 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 MAPPTSGDMFSPLMRSPAPGIMSTPQTAFGMTPTLNVKATDSGEASTSHTRFTAPGSKST mKIAA0 RPHRLKKTFDSVDKVLSEVDFEERFAELPEFRPEEVLPSPTLQSLATSPRAILGSYRKKR 1090 1100 1110 1120 1130 1140 >>mKIAA0181 ( 1169 res) mpm10369 (1169 aa) initn: 69 init1: 53 opt: 276 Z-score: 152.4 bits: 40.1 E(): 0.0024 Smith-Waterman score: 325; 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