FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1697.ptfa, 814 aa vs ./tmplib.26680 library 1768203 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3398+/-0.00399; mu= 18.4027+/- 0.268 mean_var=75.8209+/-17.490, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1473 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1603 ( 871 res) mbp01081 ( 871) 1182 261 3.4e-70 mKIAA1997 ( 1226 res) mtj02423 (1226) 776 175 4e-44 mKIAA0325 ( 1999 res) mbg00515 (1999) 512 119 4.2e-27 >>mKIAA1603 ( 871 res) mbp01081 (871 aa) initn: 979 init1: 216 opt: 1182 Z-score: 1352.6 bits: 261.3 E(): 3.4e-70 Smith-Waterman score: 1415; 28.764% identity (31.417% ungapped) in 817 aa overlap (6-812:113-870) 10 20 30 mKIAA1 SDNLHERLKILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIY .:. .... .. ..:::.:.::... mKIAA1 VNEMYQTSLRQFLGLFDLSLARSVKSPITSKRIANIIEHMTYEVFKYAARGLYEEHKFLF 90 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 SFMLCVDIMREHEQLTEAEWNFFLRGSAGME-KERPPKPEAPWLPIQMWFSCCDLEESFP ...: . : ... . . :. ...:.:... : :::: . :. . :.. .: . mKIAA1 TLLLTLKIDIQRNLVKHEEFLTLIKGGASLDLKACPPKP-SKWILDMTWLNLVELSK--- 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 IFEGLTKHILLRPISIKLGSFETYINPPVWE-GYPKQRHEEEK-DHVWGLDFSSFHKLIL :. .: : .. : .:. . :. ::: ... ... :..:.: mKIAA1 ----------LKQFSDILDQISR--NEKMWRVWFDKENPEEEPLPNAYDKSLDCFRRLLL 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 VKC-CKEEKVVFALTDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQDMSNSTPLVFILSTGSDPMGA .. : .. .. : ......:... : .:: ... . :::. .:: :::: . mKIAA1 IRSWCPDRTIAQA-RKYIMDSMGENYAEGVILDLEKTWEESDPRTPLICLLSMGSDPTDS 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 FQRFARESGYAERVQSISLGQGQGPIAEKMIKDAMKTGNWVFLQNCHLAVSWMLAMEELI . .... : .:.:::: :.:.....: .:.::.::::::..... .::. mKIAA1 IIALGKRLKIETRY--VSMGQGQEVHARKLLHQTMANGGWVLLQNCHLGLDFL---DELM 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 KTFTDPNQTIKDTFRLFLSSMPCSTFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSF . :. ..:..:::::.... . ::.:.:: :.: .::::.::::..::.. .. .. mKIAA1 DVVTE-TETVHDTFRLWITTEVHKQFPITLLQMSIKFANEPPQGLRAGLRRTYGGVSQDL 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 mKIAA1 FEENILGMKWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALLNL-----NL .. .. : .:. ..... :.:. .:::.::::::::: ::::..: . .. . .. mKIAA1 LDVSV-GAQWKPMLYAVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNQADFNATVQFIQNHLDDM 420 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 YCHEGKIPWDALIYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFFSPETLDDDYTYSDSGIYF ..: . : .. :. ::: ::::::: .:.: : : : .:: . . :.:. .. : mKIAA1 DVKKG-VSWTTVRYMIGEIQYGGRVTDDYDKRLLNTFAKVWFSENMFGPDFTFYQG--YN 480 490 500 510 520 530 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 APLADSLQDFKEYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLVFQYKETNTLITTILEVQPRSSSGGQ : .... . .::..:: :.::.::.: ::....: : .. .. ::: .::..:::: mKIAA1 IPKCSTVDGYLQYIQSLPAYDSPEVFGLHPNADITYQSKLAKDVLDTILGIQPKDSSGGG 540 550 560 570 580 590 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 GKSNDEIVQELVASIQTRVPESLQMEGASESLFVKDPQGRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLK .. . .: .:. .. ..::. . ..: : . .: .. .. : ::.::.. .:. mKIAA1 DETREAVVARLADDMLEKLPEDYSPFEVKERL---QKMGPFQPMNIFLRQEIDRMQRVLS 600 610 620 630 640 650 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 LIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTAYPSLKPLGSWVKDLILR :.. .: :. :. : ..:::... . . ... ..:. :..... : . :: : .:. : mKIAA1 LVRSTLTELKLAVDGTIIMSENLRDALDCMFDARIPARWKKASWVS-STLGFWFTELLER 660 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 TAFVDLWLKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHAR-KYNLPIDELSFKYNMIPVYRDQ . :.. :.:. ::..::: ::::::. :. .: . . .:.. . .. ..: mKIAA1 NCQFTSWVSNGRPHCFWMTGFFNPQGFLTAMRQEITRANKGWALDNMVLCNEVTKFMKD- 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 AAVIESAKDIQFGTELPMDKELPSPEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMVIEDALPGQMNPML : : : .:: :.:...... :: ..: . .. : . .. mKIAA1 ------------------DISAP-PTEGVYVYGLYLEGAGWDKRNMKLIESKPKVLFELM 780 790 800 810 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 PVVHFEPKQNYEPVHTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRISDYWISKG ::... ..: :: :.:: .:. . :....: : . . ..:. .: mKIAA1 PVIRIFAENNTARDPRLYCCPIYKKPVRT--------DLNYIAAVDLKTAQAPEHWVLRG 820 830 840 850 860 810 mKIAA1 SALLCQLSE ::::... mKIAA1 VALLCDVK 870 >>mKIAA1997 ( 1226 res) mtj02423 (1226 aa) initn: 532 init1: 235 opt: 776 Z-score: 884.6 bits: 175.2 E(): 4e-44 Smith-Waterman score: 843; 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