FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1517.ptfa, 937 aa vs ./tmplib.26680 library 1768080 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8020+/-0.00496; mu= 13.1684+/- 0.332 mean_var=109.2570+/-24.840, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1227 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4209 ( 1417 res) mfj00137 (1417) 700 135 5.4e-32 mKIAA0224 ( 1224 res) mpg04132 (1224) 537 106 2.3e-23 mKIAA0134 ( 1167 res) mbh02208 (1167) 492 98 5.7e-21 mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264) 492 98 6e-21 mKIAA0577 ( 1048 res) mbg07362a (1048) 469 94 8.8e-20 mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 ( 425) 360 75 3e-14 mKIAA0890 ( 1057 res) mbg06494 (1057) 183 44 0.00015 >>mKIAA4209 ( 1417 res) mfj00137 (1417 aa) initn: 719 init1: 303 opt: 700 Z-score: 666.8 bits: 135.3 E(): 5.4e-32 Smith-Waterman score: 781; 27.918% identity (31.099% ungapped) in 831 aa overlap (30-812:569-1362) 10 20 30 40 50 mKIAA1 PPKTPASAPPPPVAKPAVFIPVNRTPEMQEERLKLPILAEEQAIMEAVAEHPIVIVCGE .:: :: :...:.. ...: .:.. : mKIAA4 RPAKSLFAENSKICRQFQMKQASRQFHAILQERQLLPAWEERETILKLLSKHQVVVISGM 540 550 560 570 580 590 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 TGSGKTTQVPQFLYEA---GYSSEDSIIGVTEPRRVAAVAMSQRVAKEMNLSHRV---VS :: :::::.:::. . : . . : :.:::..:.....::::: ..:: :. mKIAA4 TGCGKTTQIPQFILDNSLNGPPERVANIICTQPRRISAISVAERVAKER--AERVGLTVG 600 610 620 630 640 650 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 YQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLKYKVVIIDEAHERSVYTDILLGLLSR :::: :. . ::. . : ::::.... : : .:.::.:::. .:.:: .:. mKIAA4 YQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRLEGDATLQGVTHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKD 660 670 680 690 700 710 180 190 200 210 220 mKIAA1 IVALRAKRHLPLKLLIMSATLRVEDFTQNQRLFTTPPPVIKVESRQFPVTVHFNK----- :: :: :....::::: . :.. . . ::: . .: ::: : . mKIAA4 IVMQRAT----LQVILMSATLDAGLFSK----YFSYCPVITIPGRAFPVDQFFLEDALAV 720 730 740 750 760 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 -RTPLDDYSGECFRKVCKIHRM-LPAGGILVFLTGQAEVHA---LCRRLRKAFPFRCSQP : :.: : .:.. .: . : : :.: ::. : .:. . mKIAA4 TRYVLQDGSPY-MRSMKQIAKEKLKARHNR---TAQEEVEEDLRLSLHLQDEEESVKDTI 770 780 790 800 810 820 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 QEKEEDSAEGMRRFKK-SRTRARKAQAMALPQINLDNYSVLPAGEGDEDREAEMDDEEEA ... : . . :.: :.. . ..: . ..::. .: : ..: . mKIAA4 PDQQLDFKQLLIRYKGVSKSVIKTMSVMDFEKVNLELIEALLEWIVD-GKHAYPPGAVLV 830 840 850 860 870 880 350 360 370 380 390 mKIAA1 L--G-SDLDLDLGDSEANEGEQPDASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPPEGTRLCVVA . : ... . . ..: . : . ::.: :. :.: :: :: :. ... mKIAA4 FLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSHRCVIHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPMGVTKIIIS 890 900 910 920 930 940 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 TNVAETSLTIPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAGRAGRTEPGH ::.::::.:: . ::.: ::.:.. :: :. :.. :.::::.: :: :::::. : mKIAA4 TNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDAGKGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGV 950 960 970 980 990 1000 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 CYRLYSSAVFG-DFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALSIEKVINFP-----FPTPPSVEA :..:..: .. .. . ::: : :.:.: :..: : . .. :. . :: ... mKIAA4 CFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSTHNLQSVFSRLIEPPHIDS 1010 1020 1030 1040 1050 1060 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 LVAAEELLVALGALQAPPKQERMKKLQMSQLSCPITALGRTMSTFPVAPRYAKMLALSQQ : :.. : :::: : .: :: ....:: : .:.. :.. mKIAA4 LRASKVRLRDLGALTPDEK---------------LTPLGYHLASLPVDVRIGKLMLLGSI 1070 1080 1090 1100 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 HGCLPYTIAIVAAMTVRELF-EELDRPAASEKELAELKGRRARVAQMKRTWAGQGPSLKL :: ...:.:... . : :. .... :. . . .. : : : mKIAA4 FRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDYLALLCAYKGWQLSTKE 1110 1120 1130 1140 1150 1160 640 650 660 670 mKIAA1 GDLMV-------LLGAVGACEYAGCSPQFCQ--------ANGLRYKAMLEIRRLRGQLTT . .:.. :.:. . :: . .::: : ::.. :.: mKIAA4 SARASYNYCRQNFLSGRTLQEMASLKRQFTELLSDIGFVKEGLRAK---EIEK-RAQGGD 1170 1180 1190 1200 1210 1220 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 AV-NAVCPEAGL-FLDPKMQPPTESQVTYLRQIMAAGLGDHLARRVQSEDLLDPKWKNAY .: .:. ::. .::. . . : ... .. . .. :.:: . mKIAA4 GVLDATGEEANTNAENPKLISAVLCAALYPNVVQVKTPEGKFQKTSSGVVRLQPKSAELK 1230 1240 1250 1260 1270 1280 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 KTPLLDDPVFIHPSSVLFK----ELPEFVVYQEIVETTKMYMKGVSTVEIQWIPSLLPSY . : : :::::: .. . : ...:.: ..:...... : : . : .: . mKIAA4 FVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSP-YLLYHEKIKTSRVFIRDCSMVSVY--PLVLFGG 1290 1300 1310 1320 1330 1340 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 CQFDAPLEEPAPSYCPESGQVLCHRASVFYRVGWPLPAVQVDFPEGIDRYKYFARFLLEG : .. :.. : ..: . mKIAA4 GQVNVQLQRGAFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIKNPSMDLCSCP 1350 1360 1370 1380 1390 1400 >>mKIAA0224 ( 1224 res) mpg04132 (1224 aa) initn: 1029 init1: 373 opt: 537 Z-score: 511.7 bits: 106.4 E(): 2.3e-23 Smith-Waterman score: 1006; 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