# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbp06230.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1462.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1462, 758 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919022 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7605+/-0.000189; mu= 10.6203+/- 0.011 mean_var=90.3916+/-17.470, 0's: 39 Z-trim: 41 B-trim: 35 in 1/64 Lambda= 0.134899 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|109505049|ref|XP_574050.2| PREDICTED: hypotheti ( 990) 4029 794.7 0 gi|149032573|gb|EDL87451.1| rCG45278, isoform CRA_ (1331) 4029 794.8 0 gi|118085631|ref|XP_418578.2| PREDICTED: hypotheti (1636) 1373 277.9 2.1e-71 gi|57997580|emb|CAI46027.1| hypothetical protein [ (1041) 1089 222.5 6.5e-55 gi|119606423|gb|EAW86017.1| hCG1643737, isoform CR (1221) 1089 222.6 7.4e-55 gi|114629897|ref|XP_001136194.1| PREDICTED: hypoth (1217) 1069 218.7 1.1e-53 gi|114629895|ref|XP_001136276.1| PREDICTED: hypoth (1355) 1069 218.7 1.2e-53 gi|109088603|ref|XP_001082542.1| PREDICTED: hypoth (1356) 831 172.4 1e-39 gi|13093785|emb|CAC29500.1| hypothetical protein [ ( 717) 774 161.1 1.4e-36 gi|149634746|ref|XP_001507721.1| PREDICTED: hypoth (1369) 553 118.3 2e-23 gi|73948916|ref|XP_535151.2| PREDICTED: hypothetic (1364) 508 109.5 8.8e-21 gi|47213006|emb|CAF95398.1| unnamed protein produc (1146) 307 70.3 4.6e-09 gi|189525997|ref|XP_001341226.2| PREDICTED: hypoth (1465) 269 63.0 9.4e-07 gi|47225119|emb|CAF98746.1| unnamed protein produc ( 768) 202 49.8 0.0048 >>gi|109505049|ref|XP_574050.2| PREDICTED: hypothetical (990 aa) initn: 3246 init1: 1656 opt: 4029 Z-score: 4234.8 bits: 794.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 4029; 81.340% identity (90.407% similar) in 761 aa overlap (1-758:232-990) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::.::.::::: ::::::::::.::::::: gi|109 RDSKVESHASSPQPQSEGTCRTHTKLRKFETGIQSRKSSKK-SNATIFCLVSVPVKSESL 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL : :::::::.:: :::..:: :: ::.:::::::::::::::::::::::::::::: : gi|109 VPDTDTNNNDLKLGADKNHGLYQGPALEEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQVL 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 RESEDGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGEA :::::: :::: ::::::.::.::. ::::::::::::::: ::::::::::::::::: gi|109 GESEDGQTDDPRTLHLIKPRELRASGSWPGHQYRDQQTQTSFPEDSKSSQLLPATKPGEA 330 340 350 360 370 380 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 SNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAINQ ::.: :::::: ::::: ::.::: :: .::::::::.:: :::::::::::::::.::: gi|109 SNAALTPTCPDDTASEVHLHAALASSDPSQKPSVPHLRGQMSLSPSRNSAFSRTSSTINQ 390 400 410 420 430 440 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 ASMSKGTSDQLPGANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWDLISQLESF .:: ::.: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 TSMPKGASGQLPSANPVPKPEVVKGESTVGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWDLISQLESF 450 460 470 480 490 500 280 290 300 310 320 mKIAA1 NKELQEEEESHG---GSGSEDSEAEQPEDCADSRTKSWALQGTRTAQQPAGLALENVASP :::::::::::: :. ::::::::::::::: .:. . : :: :.:: ::: ... : gi|109 NKELQEEEESHGVSSGGDSEDSEAEQPEDCADSSAKTRGHQETRREQRPAELALGEAGPP 510 520 530 540 550 560 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 DRRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWADGSLTAEQKSQEDLNGMC ::..::: ..:::::: .. :.::::::: ::::::::. :.:.::::::: ::::: gi|109 GGRLGESQSRSKEPKPGHPCARSQALGPSQEEDSRGVPVQWGHGNLSAEQKSQEALNGMC 570 580 590 600 610 620 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 ERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCLSEPRGSQELTKFGDAVGSVQLGRETPTQVGNGGDT :::.::::::::::.::.:: :.::.:::::::::: .::.:::.:::::: .: ::::: gi|109 ERDISPRPVSRIAPVDTQAASLFCLAEPRGSQELTKVNDALGSVELGRETPIRVDNGGDT 630 640 650 660 670 680 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 EVLPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLECLDLENTVEVLPSESLQERAE ::::::: ::::. :: :::.: :::::::::: ::: :: :.:::::::::::::::: gi|109 EVLPCVLPPLADRCRGLSTPNFPSLELTLGQEQRAYKSECQGLDNTVEVLPSESLQERAE 690 700 710 720 730 740 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 RILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSREDSSHSLALPVGPKVATDAFYG ::::::::::::::.::::::::::.: .:::.: ::::::. : : : : :::::::: gi|109 RILGIEVAVESLLPGARRTEQSQLPKPGTSACSPRSSREDSQPSSASPEDPTVATDAFYG 750 760 770 780 790 800 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 RRKCGWTESPLFVGERAPQASICSDVDGFPTSQATSPEPGKKDEEAKAPFKSTLFHFMEK ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::: :: .::: :::::::::::: gi|109 RRKCGWTESPLFVGERAPQAAVCSDVDGFPTSQATSPEPEKK-KEAKPPFKSTLFHFMEK 810 820 830 840 850 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 STNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKLVSPPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSV ::::::::::::: :.:.:. : :::: ::.:::..:.:::::::::::::::::::::. gi|109 STNVVGPEKRLRNSSNVIESSQGKLVSLPKRADSARLVRMREVNSLSQMRCLSSKSADSM 860 870 880 890 900 910 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 EEPDPLKVIKSSAWLSEGLTSLGGKDEAWQAGHLPSVSQNENGHPEVPRDKMSDQDLWCA :::::::::::::: :::::: .:::.:::: .:::::::::::::: :.:::::::::: gi|109 EEPDPLKVIKSSAWPSEGLTSPSGKDQAWQAEYLPSVSQNENGHPEVIREKMSDQDLWCA 920 930 940 950 960 970 750 mKIAA1 DSYDPSRVERV ::::::::::: gi|109 DSYDPSRVERV 980 990 >>gi|149032573|gb|EDL87451.1| rCG45278, isoform CRA_a [R (1331 aa) initn: 3208 init1: 1656 opt: 4029 Z-score: 4233.0 bits: 794.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4029; 81.340% identity (90.407% similar) in 761 aa overlap (1-758:573-1331) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::.::.::::: ::::::::::.::::::: gi|149 RDSKVESHASSPQPQSEGTCRTHTKLRKFETGIQSRKSSKK-SNATIFCLVSVPVKSESL 550 560 570 580 590 600 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL : :::::::.:: :::..:: :: ::.:::::::::::::::::::::::::::::: : gi|149 VPDTDTNNNDLKLGADKNHGLYQGPALEEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQVL 610 620 630 640 650 660 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 RESEDGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGEA :::::: :::: ::::::.::.::. ::::::::::::::: ::::::::::::::::: gi|149 GESEDGQTDDPRTLHLIKPRELRASGSWPGHQYRDQQTQTSFPEDSKSSQLLPATKPGEA 670 680 690 700 710 720 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 SNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAINQ ::.: :::::: ::::: ::.::: :: .::::::::.:: :::::::::::::::.::: gi|149 SNAALTPTCPDDTASEVHLHAALASSDPSQKPSVPHLRGQMSLSPSRNSAFSRTSSTINQ 730 740 750 760 770 780 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 ASMSKGTSDQLPGANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWDLISQLESF .:: ::.: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 TSMPKGASGQLPSANPVPKPEVVKGESTVGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWDLISQLESF 790 800 810 820 830 840 280 290 300 310 320 mKIAA1 NKELQEEEESHG---GSGSEDSEAEQPEDCADSRTKSWALQGTRTAQQPAGLALENVASP :::::::::::: :. ::::::::::::::: .:. . : :: :.:: ::: ... : gi|149 NKELQEEEESHGVSSGGDSEDSEAEQPEDCADSSAKTRGHQETRREQRPAELALGEAGPP 850 860 870 880 890 900 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 DRRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWADGSLTAEQKSQEDLNGMC ::..::: ..:::::: .. :.::::::: ::::::::. :.:.::::::: ::::: gi|149 GGRLGESQSRSKEPKPGHPCARSQALGPSQEEDSRGVPVQWGHGNLSAEQKSQEALNGMC 910 920 930 940 950 960 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 ERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCLSEPRGSQELTKFGDAVGSVQLGRETPTQVGNGGDT :::.::::::::::.::.:: :.::.:::::::::: .::.:::.:::::: .: ::::: gi|149 ERDISPRPVSRIAPVDTQAASLFCLAEPRGSQELTKVNDALGSVELGRETPIRVDNGGDT 970 980 990 1000 1010 1020 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 EVLPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLECLDLENTVEVLPSESLQERAE ::::::: ::::. :: :::.: :::::::::: ::: :: :.:::::::::::::::: gi|149 EVLPCVLPPLADRCRGLSTPNFPSLELTLGQEQRAYKSECQGLDNTVEVLPSESLQERAE 1030 1040 1050 1060 1070 1080 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 RILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSREDSSHSLALPVGPKVATDAFYG ::::::::::::::.::::::::::.: .:::.: ::::::. : : : : :::::::: gi|149 RILGIEVAVESLLPGARRTEQSQLPKPGTSACSPRSSREDSQPSSASPEDPTVATDAFYG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 RRKCGWTESPLFVGERAPQASICSDVDGFPTSQATSPEPGKKDEEAKAPFKSTLFHFMEK ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::: :: .::: :::::::::::: gi|149 RRKCGWTESPLFVGERAPQAAVCSDVDGFPTSQATSPEPEKK-KEAKPPFKSTLFHFMEK 1150 1160 1170 1180 1190 1200 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 STNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKLVSPPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSV ::::::::::::: :.:.:. : :::: ::.:::..:.:::::::::::::::::::::. gi|149 STNVVGPEKRLRNSSNVIESSQGKLVSLPKRADSARLVRMREVNSLSQMRCLSSKSADSM 1210 1220 1230 1240 1250 1260 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 EEPDPLKVIKSSAWLSEGLTSLGGKDEAWQAGHLPSVSQNENGHPEVPRDKMSDQDLWCA :::::::::::::: :::::: .:::.:::: .:::::::::::::: :.:::::::::: gi|149 EEPDPLKVIKSSAWPSEGLTSPSGKDQAWQAEYLPSVSQNENGHPEVIREKMSDQDLWCA 1270 1280 1290 1300 1310 1320 750 mKIAA1 DSYDPSRVERV ::::::::::: gi|149 DSYDPSRVERV 1330 >>gi|118085631|ref|XP_418578.2| PREDICTED: hypothetical (1636 aa) initn: 974 init1: 289 opt: 1373 Z-score: 1438.1 bits: 277.9 E(): 2.1e-71 Smith-Waterman score: 1382; 41.944% identity (63.472% similar) in 720 aa overlap (1-697:876-1571) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::.::::::::: : :::::::::::::: gi|118 EYTKGKLLVRNSHMDSTCETVTKVKKFEPGTGMQSKKSSKKKMNETIFCLVSIPVKSESN 850 860 870 880 890 900 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL . :: ::: . ::. :. ...:::::::::::::::::::: :::. . .: : gi|118 LPDTDRNNN-ITQSPDKN-GFDNNGALQEQSLLSMSSTDLELQALTGSMTNKNELQKQEL 910 920 930 940 950 960 100 110 120 130 140 mKIAA1 -RESEDGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGE : : :..: :... : .::. :. ::: ::.:::::::: :. :. :.. .::::. gi|118 WRPEEFKQMNDLRFIQPAKHRELKYSGSWPGDQYKDQQTQTSFSEEPKNPQIFHGTKPGQ 970 980 990 1000 1010 1020 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ASNVAP-TPTCPDTTASEV-CLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSA :. : .: ::: . .:. .:.. . .. ..:: :: : :::::::... gi|118 PSSNKPLSPKQLGCTASTAGSKQTGSPSDDRGCRQGAYGMKGQMYLSQSSNSAFSRTATS 1030 1040 1050 1060 1070 1080 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 INQASMSKGTSDQ-LPG----ANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWD : ::: :: ..: :: :. :. .:::.:. . ::: .:::::::::::::::: gi|118 IPQASSPKGHQSQPLPTQEREAGLPPRADVVKAEAGA-PCNSKELFGQFLLKPVSRRPWD 1090 1100 1110 1120 1130 1140 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 LISQLESFNKELQEEEESHGGSGSEDSEAEQPEDCADSRTKSWALQGTRTAQQPA-GLAL ::.::::::::: .::: .. . .: . .:. :: . .: .:. :.: : : gi|118 AISELESFNKELQGQEESMSSEEDLESAGASPQPCALPQRRS-PRNGN---QEPKRGGKL 1150 1160 1170 1180 1190 330 340 350 360 370 mKIAA1 ENVASPD-------RRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWADGSLT :.:. :. : . :.::. . : : :: :: . :. ::::: gi|118 ETVV-PEVPVFKSGRVKSKSESWSTGIEHGAEMDCVGSQCSSQPGGS-NEGVRPADGSLI 1200 1210 1220 1230 1240 1250 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 AEQKSQEDLNGMCERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCLSEPRGS---QELTKFGDAVGSV .:....: : . : :..:. .... . : ..: .. ::... . . : gi|118 TEMRTEEAKNRANSQPVRPGPIKRF--LSSSPSSSYH-GNPFNNPVLQEMSEDQNYLHFV 1260 1270 1280 1290 1300 1310 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 QLGRETPTQVGNGGDTEVLPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLECLDLE .:.. . : : . : : : :. . .: : ::.:.. : . .: . . . gi|118 KLSKGAAPQ--NDTQLERGSAVCLSLTKRNQGCSEPDLRAVGLDTAPGPGASNSDHSSNA 1320 1330 1340 1350 1360 1370 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 NTVEVLPSESLQERAERILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSREDSSHS :.::. .:::: :: ::::::.::::::: .. :.: : :.:. .: . : gi|118 NSVEIPVNESLQARAARILGIEIAVESLLP-----DDHVGPQPGAR---PASDAHDFGSS 1380 1390 1400 1410 1420 560 570 580 590 600 mKIAA1 LALPV-GPKVATDAFY-GRRKCGWTESPLFVGER--APQASICSDVDGFPTSQATSPEPG : : . :. : :::::::::: :::::: . . :. . .:. : gi|118 AESTVSGKEGKKDSSYEGRRKCGWTESALFVGERDRSLYPDECQTTHQEGSSKMLVKE-- 1430 1440 1450 1460 1470 1480 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 KKDEEAKAPFKSTLFHFMEKSTNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKLVSPPKKADSVHLIRM . :. .: .. ... : : :::.:. :::.:.:: ::.:::... .:.:: gi|118 QAFEQPVSPSQGGDQNLVSKPTVCQHSEKRVRSTSKVIETLQGKLTSPPSRTAMDRLVRM 1490 1500 1510 1520 1530 1540 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 REVNSLSQMRCLSSKSADSVEEPDPLKVIKSSAWLSEGLTSLGGKDEAWQAGHLPSVSQN .::.:.:.:: :: ::::: :: : :. : gi|118 KEVDSVSRMRRLSIKSADSGEEVDEEKLSKVHEERGSKLAMSGAVSKRVISLSENGYLGG 1550 1560 1570 1580 1590 1600 >>gi|57997580|emb|CAI46027.1| hypothetical protein [Homo (1041 aa) initn: 1803 init1: 433 opt: 1089 Z-score: 1142.1 bits: 222.5 E(): 6.5e-55 Smith-Waterman score: 2350; 52.618% identity (70.449% similar) in 802 aa overlap (1-758:245-1041) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::...::::::: : :::::::::::::: gi|579 QHGHTGRQVSSPYSQGESTCETQTKLKKFQTGTRTKKSSKKKMNETIFCLVSIPVKSESH 220 230 240 250 260 270 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL . : .:::.: ::. : .. :::::::::::::::::::: :::. : .: : gi|579 LPDRDMDNNDLKPSADQKNGSDKSPALQEQSLLSMSSTDLELQALTGSMGGRTEFQKQDL 280 290 300 310 320 330 100 110 120 130 140 mKIAA1 RESE-DGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGE : : : : .: ..:: : .::. :. ::::.:::::::::: :. .::::::..: : gi|579 GEPEEDRQTNDLSFIHLTKHRELKHSGSWPGHRYRDQQTQTSFSEEPQSSQLLPGAKLGG 340 350 360 370 380 390 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ASNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAIN : .: .: : : .:::. :::. .:..:.::. .:.:. ::::: :::::::: ... gi|579 PSRAALSPKCSDPAASEAQTHTAFPTGDHKQRPSARNLKGHRSLSPSSNSAFSRTSLSVD 400 410 420 430 440 450 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 QASMSKGTSDQLP-------GANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWD :: :. .: : ::.: :: :::::: : : ::: ::::::::::::::::: gi|579 QAPTPKAGRSQ-PCVDVHGLGAHPGPKREVVKGEPT-GPCNSRQLFGQFLLKPVSRRPWD 460 470 480 490 500 510 270 280 290 300 310 mKIAA1 LISQLESFNKELQEEEESHGGSGS-----EDSEAE-QPEDCADSRTKSWALQGT----RT :::::::::::::::::: ..:.: :.:::: : :. : : .. ...:. :. gi|579 LISQLESFNKELQEEEESSSSSSSSSSSSEESEAEPQQENRAHCRQEDVGFRGNSPEMRV 520 530 540 550 560 570 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 AQQPAGLALEN-VASPDRRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWADG :: . :. : : . :.::.:: .::: . : : : . : . :.: ::: gi|579 EPQPRMWVPESPVCRSGRGESKSESWSEELQPGHPRAWPPSPGRFRVEEGGGAPFCSADG 580 590 600 610 620 630 380 390 400 410 420 mKIAA1 SLTAEQKSQEDLNGMCERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCL--SEPRGSQELTKFGDAVG : .::.. : ::: : :: ::.:.. .. : :: .::: :: :. .: . gi|579 STSAEKRHLEVSNGMDELAGSPFPVTRMSSRSSDAKPLPASYPAEPREPQETPKITSAFS 640 650 660 670 680 690 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 SVQLGRETPTQVGNGGDTEV-LPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLE-C ::. .. .: . .::. . :: : :..: :: :.::.::. :: ::::.: .:: gi|579 SVKPSEAVPRKFDSGGERGAGLP---LSLSNKNRGLSAPDLRSVGLTPGQEQGASELEGS 700 710 720 730 740 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 LDLENTVEVLPSESLQERAERILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSRED : .:.:. :.:::: :: ::::::::::::::. ::. :.: :::::::.: : .:. gi|579 LGEASTIEIPPGESLQARAARILGIEVAVESLLPGIRRAGQNQPAEPDASACTPESPQEE 750 760 770 780 790 800 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 SSHSLALPVGPKVATDAFYGRRKCGWTESPLFVGER-----APQASICSDVDGFPTSQAT : :.:.:::::::::::::.::::::.: :::: ::::: :: gi|579 LLSRPAPADVPRVSTDAFYGRRKCGWTKSPLFVGDRDSARRAPQAFEHSDVDGVVTSTDP 810 820 830 840 850 860 610 620 630 640 650 mKIAA1 SPEPG----------KKDEEAKAPFKSTLFHFMEKSTNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKL ::: .:: :.: ::.::::::.:.. .:.: :::::.::::.:.::::: gi|579 VPEPEPSPLESKFFEQKDVETKPPFRSTLFHFVERTPSVAGSEKRLRSPSKVIESLQEKL 870 880 890 900 910 920 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 VSPPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSVEEPDPLKVI-KSSAWLSEGLTSLGG .:::..:: .:.::.::.:.:.:: :: ..::: :. . ::. ...: : ::.: :. gi|579 ASPPRRADPDRLMRMKEVSSVSRMRVLSFRNADSQEDAEELKATTRGQAGLPGGLVSPGS 930 940 950 960 970 980 720 730 740 750 mKIAA1 KDEAWQAGHLPSVSQN-----ENGHPEVPRDKMSDQDLWCADSYDPSRVERV :.: . :: :::.. :. :: . ..: :::.:: ::::::::::: gi|579 GDRAQRLGHSLSVSKDSISREEKEHPAAQKEKSMDQDFWCPDSYDPSRVERV 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>gi|119606423|gb|EAW86017.1| hCG1643737, isoform CRA_b (1221 aa) initn: 1804 init1: 433 opt: 1089 Z-score: 1141.2 bits: 222.6 E(): 7.4e-55 Smith-Waterman score: 2348; 52.618% identity (70.449% similar) in 802 aa overlap (1-758:425-1221) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::...::::::: : :::::::::::::: gi|119 QHGHTGRQVSSPYSQGESTCETQTKLKKFQTGTRTKKSSKKKMNETIFCLVSIPVKSESH 400 410 420 430 440 450 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL . : .:::.: ::. : .. :::::::::::::::::::: :::. : .: : gi|119 LPDRDMDNNDLKPSADQKNGSDKSPALQEQSLLSMSSTDLELQALTGSMGGRTEFQKQDL 460 470 480 490 500 510 100 110 120 130 140 mKIAA1 RESE-DGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGE : : : : .: ..:: : .::. :. ::::.:::::::::: :. .::::::..: : gi|119 GEPEEDRQTNDLSFIHLTKHRELKHSGSWPGHRYRDQQTQTSFSEEPQSSQLLPGAKLGG 520 530 540 550 560 570 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ASNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAIN : .: .: : : .:::. :::. .:..:.::. .:.:. ::::: :::::::: ... gi|119 PSRAALSPKCSDPAASEAQTHTAFPTGDHKQRPSARNLKGHRSLSPSSNSAFSRTSLSVD 580 590 600 610 620 630 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 QASMSKGTSDQLP-------GANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWD :: :. .: : ::.: :: :::::: : : ::: ::::::::::::::::: gi|119 QAPTPKAGRSQ-PCVDVHGLGAHPGPKREVVKGEPT-GPCNSKQLFGQFLLKPVSRRPWD 640 650 660 670 680 690 270 280 290 300 310 mKIAA1 LISQLESFNKELQEEEESHGGSGS-----EDSEAE-QPEDCADSRTKSWALQGT----RT :::::::::::::::::: ..:.: :.:::: : :. : : .. ...:. :. gi|119 LISQLESFNKELQEEEESSSSSSSSSSSSEESEAEPQQENRAHCRQEDVGFRGNSPEMRV 700 710 720 730 740 750 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 AQQPAGLALEN-VASPDRRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWADG :: . :. : : . :.::.:: .::: . : : : . : . :.: ::: gi|119 EPQPRMWVPESPVCRSGRGESKSESWSEELQPGHPRAWPPSPGRFRVEEGGGAPFCSADG 760 770 780 790 800 810 380 390 400 410 420 mKIAA1 SLTAEQKSQEDLNGMCERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCL--SEPRGSQELTKFGDAVG : .::.. : ::: : :: ::.:.. .. : :: .::: :: :. .: . gi|119 STSAEKRHLEVSNGMDELAGSPFPVTRMSSRSSDAKPLPASYPAEPREPQESPKITSAFS 820 830 840 850 860 870 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 SVQLGRETPTQVGNGGDTEV-LPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLE-C ::. .. .: . .::. . :: : :..: :: :.::.::. :: ::::.: .:: gi|119 SVKPSEAVPRKFDSGGERGAGLP---LSLSNKNRGLSAPDLRSVGLTPGQEQGASELEGS 880 890 900 910 920 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 LDLENTVEVLPSESLQERAERILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSRED : .:.:. :.:::: :: ::::::::::::::. ::. :.: :::::::.: : .:. gi|119 LGEASTIEIPPGESLQARAARILGIEVAVESLLPGIRRAGQNQPAEPDASACTPESPQEE 930 940 950 960 970 980 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 SSHSLALPVGPKVATDAFYGRRKCGWTESPLFVGER-----APQASICSDVDGFPTSQAT : :.:.:::::::::::::.::::::.: :::: ::::: :: gi|119 LLSRPAPADVPRVSTDAFYGRRKCGWTKSPLFVGDRDSARRAPQAFEHSDVDGVVTSTDP 990 1000 1010 1020 1030 1040 610 620 630 640 650 mKIAA1 SPEPG----------KKDEEAKAPFKSTLFHFMEKSTNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKL ::: .:: :.: ::.::::::.:.. .:.: :::::.::::.:.::::: gi|119 VPEPEPSPLESKFFEQKDVETKPPFRSTLFHFVERTPSVAGSEKRLRSPSKVIESLQEKL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 VSPPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSVEEPDPLKVI-KSSAWLSEGLTSLGG .:::..:: .:.::.::.:.:.:: :: ..::: :. . ::. ...: : ::.: :. gi|119 ASPPRRADPDRLMRMKEVSSVSRMRVLSFRNADSQEDAEELKATTRGQAGLPGGLVSPGS 1110 1120 1130 1140 1150 1160 720 730 740 750 mKIAA1 KDEAWQAGHLPSVSQN-----ENGHPEVPRDKMSDQDLWCADSYDPSRVERV :.: . :: :::.. :. :: . ..: :::.:: ::::::::::: gi|119 GDRAQRLGHSLSVSKDSISREEKEHPAAQKEKSMDQDFWCPDSYDPSRVERV 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>gi|114629897|ref|XP_001136194.1| PREDICTED: hypothetic (1217 aa) initn: 2093 init1: 422 opt: 1069 Z-score: 1120.2 bits: 218.7 E(): 1.1e-53 Smith-Waterman score: 2300; 51.806% identity (70.112% similar) in 803 aa overlap (1-758:425-1217) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::...::::::: : :::::::::::::: gi|114 QHGHTGRQVSSPYSQGESTCETQTKLKKFQTGTRTKKSSKKKMNETIFCLVSIPVKSESH 400 410 420 430 440 450 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL . : .:::.: ::. : .. :::::::::::::::::::: :::. : .: : gi|114 LPDRDMDNNDLKPSADQKNGSDKSPALQEQSLLSMSSTDLELQALTGSMGGRTEFQKQDL 460 470 480 490 500 510 100 110 120 130 140 mKIAA1 RESE-DGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGE : : : : .: ..:: : .::. :. ::::.:::::::::: :. .::::::..: : gi|114 GEPEEDRQTNDLSFIHLTKHRELKHSGSWPGHRYRDQQTQTSFSEEPQSSQLLPGAKLGG 520 530 540 550 560 570 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ASNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAIN : .: .: : : .:: . :::. .:..:.::. .:.:. ::.:: :::::::: ... gi|114 PSRAALSPKCSDPAASAAQTHTAFPTGDHKQRPSARNLKGHRSLNPSSNSAFSRTSLSVD 580 590 600 610 620 630 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 QASMSKGTSDQLP-------GANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWD :: :. .: : ::.: :: :::::: : : ::: ::::::::::::::::: gi|114 QAPTPKAGRSQ-PCVDVHGLGAHPGPKREVVKGEPT-GPCNSKQLFGQFLLKPVSRRPWD 640 650 660 670 680 690 270 280 290 300 310 mKIAA1 LISQLESFNKELQEEEESHGGSGS------EDSEAE-QPEDCADSRTKSWALQGT----R :::::::::::::::::: ..:.: :.::.: : :. : : .. ...:. : gi|114 LISQLESFNKELQEEEESSSSSSSSSSSSSEESEVEPQQENRAHCRQEDVGFRGNSPEMR 700 710 720 730 740 750 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 TAQQPAGLALEN-VASPDRRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWAD . :: . :. : : . :.::.:: .::: . : : : . : . : :: gi|114 VEPQPRMWVPESPVCRSGRGESKSESWSEELQPGHPRAWPPSPGRFRLEEGGG-----AD 760 770 780 790 800 380 390 400 410 420 mKIAA1 GSLTAEQKSQEDLNGMCERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCL--SEPRGSQELTKFGDAV :: .::.. : ::: : :: ::.:.. .. : :: .::: :: :. .: gi|114 GSTSAEKRHLEVSNGMDELAGSPFPVTRMSSRSSDAKPLPTSYPAEPREPQESPKITSAF 810 820 830 840 850 860 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 GSVQLGRETPTQVGNGGDTEV-LPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLE- .::. .. .: . .::. . :: : :..: :: :.::.::. :: ::::.: .:: gi|114 SSVKPSEAVPRKFDSGGERAAGLP---LSLSNKNRGLSAPDLRSVGLTPGQEQGASELEG 870 880 890 900 910 920 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 CLDLENTVEVLPSESLQERAERILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSRE : .:.:. :.:::: :: ::::::::::::::..::. :.: :::::::.: : .: gi|114 SLGEASTIEIPPGESLQARAARILGIEVAVESLLPGTRRAGQNQPAEPDASACTPESPQE 930 940 950 960 970 980 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 DSSHSLALPVGPKVATDAFYGRRKCGWTESPLFVGER-----APQASICSDVDGFPTSQA . : :.:..::::::::::::.::::::.: :::: ::::: :: gi|114 ELPSRPAPADVPRVSSDAFYGRRKCGWTKSPLFVGDRDSARRAPQAFEHSDVDGVVTSTD 990 1000 1010 1020 1030 1040 610 620 630 640 650 mKIAA1 TSPEPG----------KKDEEAKAPFKSTLFHFMEKSTNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEK ::: .:: :.: ::.::::::.:.. .:.: :::::.::::.:.:::: gi|114 PVPEPEPSPLESKFFEQKDVETKPPFRSTLFHFVERTPSVAGSEKRLRSPSKVIESLQEK 1050 1060 1070 1080 1090 1100 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 LVSPPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSVEEPDPLKVI-KSSAWLSEGLTSLG :.:::..:: .:.::.::.:.:.:: :: ..::: :. . ::. ...: : ::.: : gi|114 LASPPRRADPDRLMRMKEVSSVSRMRVLSFRNADSQEDAEELKATTRGQAGLPGGLVSPG 1110 1120 1130 1140 1150 1160 720 730 740 750 mKIAA1 GKDEAWQAGHLPSVSQN-----ENGHPEVPRDKMSDQDLWCADSYDPSRVERV . :.: . :. :::.. :. :: . ..: :::.:: ::::::::::: gi|114 SGDRAQRLGRSLSVSKDSISREEKEHPAAQKEKSMDQDFWCPDSYDPSRVERV 1170 1180 1190 1200 1210 >>gi|114629895|ref|XP_001136276.1| PREDICTED: hypothetic (1355 aa) initn: 2093 init1: 422 opt: 1069 Z-score: 1119.5 bits: 218.7 E(): 1.2e-53 Smith-Waterman score: 2300; 51.806% identity (70.112% similar) in 803 aa overlap (1-758:563-1355) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::...::::::: : :::::::::::::: gi|114 QHGHTGRQVSSPYSQGESTCETQTKLKKFQTGTRTKKSSKKKMNETIFCLVSIPVKSESH 540 550 560 570 580 590 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL . : .:::.: ::. : .. :::::::::::::::::::: :::. : .: : gi|114 LPDRDMDNNDLKPSADQKNGSDKSPALQEQSLLSMSSTDLELQALTGSMGGRTEFQKQDL 600 610 620 630 640 650 100 110 120 130 140 mKIAA1 RESE-DGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGE : : : : .: ..:: : .::. :. ::::.:::::::::: :. .::::::..: : gi|114 GEPEEDRQTNDLSFIHLTKHRELKHSGSWPGHRYRDQQTQTSFSEEPQSSQLLPGAKLGG 660 670 680 690 700 710 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ASNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAIN : .: .: : : .:: . :::. .:..:.::. .:.:. ::.:: :::::::: ... gi|114 PSRAALSPKCSDPAASAAQTHTAFPTGDHKQRPSARNLKGHRSLNPSSNSAFSRTSLSVD 720 730 740 750 760 770 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 QASMSKGTSDQLP-------GANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWD :: :. .: : ::.: :: :::::: : : ::: ::::::::::::::::: gi|114 QAPTPKAGRSQ-PCVDVHGLGAHPGPKREVVKGEPT-GPCNSKQLFGQFLLKPVSRRPWD 780 790 800 810 820 830 270 280 290 300 310 mKIAA1 LISQLESFNKELQEEEESHGGSGS------EDSEAE-QPEDCADSRTKSWALQGT----R :::::::::::::::::: ..:.: :.::.: : :. : : .. ...:. : gi|114 LISQLESFNKELQEEEESSSSSSSSSSSSSEESEVEPQQENRAHCRQEDVGFRGNSPEMR 840 850 860 870 880 890 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 TAQQPAGLALEN-VASPDRRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWAD . :: . :. : : . :.::.:: .::: . : : : . : . : :: gi|114 VEPQPRMWVPESPVCRSGRGESKSESWSEELQPGHPRAWPPSPGRFRLEEGGG-----AD 900 910 920 930 940 380 390 400 410 420 mKIAA1 GSLTAEQKSQEDLNGMCERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCL--SEPRGSQELTKFGDAV :: .::.. : ::: : :: ::.:.. .. : :: .::: :: :. .: gi|114 GSTSAEKRHLEVSNGMDELAGSPFPVTRMSSRSSDAKPLPTSYPAEPREPQESPKITSAF 950 960 970 980 990 1000 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 GSVQLGRETPTQVGNGGDTEV-LPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLE- .::. .. .: . .::. . :: : :..: :: :.::.::. :: ::::.: .:: gi|114 SSVKPSEAVPRKFDSGGERAAGLP---LSLSNKNRGLSAPDLRSVGLTPGQEQGASELEG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 CLDLENTVEVLPSESLQERAERILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSRE : .:.:. :.:::: :: ::::::::::::::..::. :.: :::::::.: : .: gi|114 SLGEASTIEIPPGESLQARAARILGIEVAVESLLPGTRRAGQNQPAEPDASACTPESPQE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 DSSHSLALPVGPKVATDAFYGRRKCGWTESPLFVGER-----APQASICSDVDGFPTSQA . : :.:..::::::::::::.::::::.: :::: ::::: :: gi|114 ELPSRPAPADVPRVSSDAFYGRRKCGWTKSPLFVGDRDSARRAPQAFEHSDVDGVVTSTD 1130 1140 1150 1160 1170 1180 610 620 630 640 650 mKIAA1 TSPEPG----------KKDEEAKAPFKSTLFHFMEKSTNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEK ::: .:: :.: ::.::::::.:.. .:.: :::::.::::.:.:::: gi|114 PVPEPEPSPLESKFFEQKDVETKPPFRSTLFHFVERTPSVAGSEKRLRSPSKVIESLQEK 1190 1200 1210 1220 1230 1240 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 LVSPPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSVEEPDPLKVI-KSSAWLSEGLTSLG :.:::..:: .:.::.::.:.:.:: :: ..::: :. . ::. ...: : ::.: : gi|114 LASPPRRADPDRLMRMKEVSSVSRMRVLSFRNADSQEDAEELKATTRGQAGLPGGLVSPG 1250 1260 1270 1280 1290 1300 720 730 740 750 mKIAA1 GKDEAWQAGHLPSVSQN-----ENGHPEVPRDKMSDQDLWCADSYDPSRVERV . :.: . :. :::.. :. :: . ..: :::.:: ::::::::::: gi|114 SGDRAQRLGRSLSVSKDSISREEKEHPAAQKEKSMDQDFWCPDSYDPSRVERV 1310 1320 1330 1340 1350 >>gi|109088603|ref|XP_001082542.1| PREDICTED: hypothetic (1356 aa) initn: 1959 init1: 464 opt: 831 Z-score: 869.2 bits: 172.4 E(): 1e-39 Smith-Waterman score: 2304; 52.375% identity (70.125% similar) in 800 aa overlap (1-758:563-1356) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL ::...::::: : : :::::::::::::: gi|109 QHGHTGRQVSSPYSQGESTCETQTKLKKFQTGTRTKKSSKTKMNETIFCLVSIPVKSESH 540 550 560 570 580 590 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL . : .:::.: ::. : .. :::::::::::::::::::: :::. : .: : gi|109 LPDRDMDNNDLKPSADQKNGSDKSPALQEQSLLSMSSTDLELQALTGSMGGRTEFQKQDL 600 610 620 630 640 650 100 110 120 130 140 mKIAA1 RESE-DGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGE : : : : .: ..:: : .::. :. ::::.:::::::::: :. .::::::..::: gi|109 GEPEEDRQTNDLSFIHLTKHRELKHSGSWPGHRYRDQQTQTSFSEEPQSSQLLPGAKPGG 660 670 680 690 700 710 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ASNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAIN : .: .: : .:::. :::. .:..:.::. .:.:. ::::: :::::::: ... gi|109 PSCAALSPKRSDPAASEAQAHTAFPSGDHKQRPSARNLKGHRSLSPSSNSAFSRTSLSVD 720 730 740 750 760 770 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 QASMSKGTSDQLP-------GANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWD :: : :. .: : ::.: :: :::::: : : ::: ::::::::::::::::: gi|109 QAPMPKAGRSQ-PCVDVHGLGAHPGPKREVVKGEPT-GPCNSKQLFGQFLLKPVSRRPWD 780 790 800 810 820 830 270 280 290 300 310 mKIAA1 LISQLESFNKELQEEEESHGGSGS---EDSEAE-QPED---CA--DSRTKSWALQGTRTA :::::::::::::::::: ..:.: :.:::: : :. :. : . .:. :. gi|109 LISQLESFNKELQEEEESSSSSSSSSSEESEAEPQQENRAHCTQEDVGFRRNSLE-MRAE 840 850 860 870 880 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 QQPAGLALEN-VASPDRRLNDSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWADGS :: . :. : : . :.::.:: .::: . : : : : : :.:. :::: gi|109 PQPRVWVPESPVCRSGRGKSKSESWSEELQPGHPRAWPPSPGRFCMEDSGGAPLWSADGS 890 900 910 920 930 940 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 LTAEQKSQEDLNGMCERDFSPRPVSRIA-PIDTKAAPLYCLSEPRGSQELTKFGDAVGSV ..::.. : ::: : :: :: :.. :.: : .::: :: : .: .:: gi|109 MSAEKRHLEVSNGMDELAGSPFPVMRMSRSSDAKPLPPSYPAEPREPQESQKTTSAFSSV 950 960 970 980 990 1000 440 450 460 470 480 mKIAA1 QLGRETPTQVGNGGDTEV-LPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLE-CLD . .. .: . .::. . :: : :..: :: :.::.::. :: ::::.: .: : gi|109 KPSEAVPRKGDSGGERSTGLP---LSLSNKNRGLSAPDLRSVGLTPGQEQGASELVGSLG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 LENTVEVLPSESLQERAERILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSREDSS .:.:. :.:::: :: ::::::::::::::...:. :.: :::::: .: : .:. gi|109 EASTIEIPPGESLQARAARILGIEVAVESLLPGTQRVAQNQPAEPDASAYTPESPQEELP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 HSLALPVGPKVATDAFYGRRKCGWTESPLFVGER-----APQASICSDVDGFPTSQATSP : :.:.:::::::::::::.::::::.: :::: ::::: :: : gi|109 SRPAPADVPRVSTDAFYGRRKCGWTKSPLFVGDRDSARRAPQAFEHSDVDGVVTSTDPVP 1130 1140 1150 1160 1170 1180 610 620 630 640 650 mKIAA1 EPG----------KKDEEAKAPFKSTLFHFMEKSTNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKLVS :: .:: :.: ::.::::::.:.. .:.: :::::.::::.:.:::::.: gi|109 EPEPNPLESKVFEQKDVETKPPFRSTLFHFVERTPSVAGSEKRLRSPSKVIESLQEKLAS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 PPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSVEEPDPLKVI-KSSAWLSEGLTSLGGKD ::..:: .:.::.::.:.:.:: :: ..:.: :: . ::. ...: : ::.: :. : gi|109 PPRRADPDRLMRMKEVSSVSRMRFLSFRNANSQEEAEELKATTRGQAGLPGGLVSPGSGD 1250 1260 1270 1280 1290 1300 720 730 740 750 mKIAA1 EAWQAGHL-----PSVSQNENGHPEVPRDKMSDQDLWCADSYDPSRVERV .: ..:: :.:..:. :: . ..: :::.:: ::::::::::: gi|109 QAQRVGHSLSISKGSISREEKEHPAAQKEKSVDQDFWCPDSYDPSRVERV 1310 1320 1330 1340 1350 >>gi|13093785|emb|CAC29500.1| hypothetical protein [Homo (717 aa) initn: 1799 init1: 433 opt: 774 Z-score: 813.1 bits: 161.1 E(): 1.4e-36 Smith-Waterman score: 2028; 50.902% identity (69.209% similar) in 721 aa overlap (82-758:2-717) 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 CQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGLRESE-DGQIDDPRILHLIKPK : .: : : : : : .: ..:: : . gi|130 GRTEFQKQDLGEPEEDRQTNDLSFIHLTKHR 10 20 30 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 ELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGEASNVAPTPTCPDTTASEVCLH ::. :. ::::.:::::::::: :. .::::::..: : : .: .: : : .:::. : gi|130 ELKHSGSWPGHRYRDQQTQTSFSEEPQSSQLLPGAKLGGPSRAALSPKCSDPAASEAQTH 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 mKIAA1 TALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAINQASMSKGTSDQLP-------G ::. .:..:.::. .:.:. ::::: :::::::: ...:: :. .: : : gi|130 TAFPTGDHKQRPSARNLKGHRSLSPSSNSAFSRTSLSVDQAPTPKAGRSQ-PCVDVHGLG 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 ANPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRPWDLISQLESFNKELQEEEESHGG :.: :: :::::: : : ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: .. gi|130 AHPGPKREVVKGEPT-GPCNSKQLFGQFLLKPVSRRPWDLISQLESFNKELQEEEESSSS 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 mKIAA1 SGS-----EDSEAE-QPEDCADSRTKSWALQGT----RTAQQPAGLALEN-VASPDRRLN :.: :.:::: : :. : : .. ...:. :. :: . :. : : . gi|130 SSSSSSSSEESEAEPQQENRAHCRQEDVGFRGNSPEMRVEPQPRMWVPESPVCRSGRGES 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 DSQSWNEEPKPGHSSVHPQSLGPSQEEGSRGVPVQWADGSLTAEQKSQEDLNGMCERDFS :.::.:: .::: . : : : . : . :.: :::: .::. : ::: : : gi|130 KSESWSEELQPGHPRAWPPSPGRFRVEEGGGAPFCSADGSTSAEKGHLEVSNGMDELAGS 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 mKIAA1 PRPVSRIAPIDTKAAPLYCL--SEPRGSQELTKFGDAVGSVQLGRETPTQVGNGGDTEV- : ::.:.. .. : :: .::: :: :. .: .::. .. .: . .::. . gi|130 PFPVTRMSSRSSDAKPLPASYPAEPREPQESPKITSAFSSVKPSEAVPRKFDSGGERGAG 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 LPCVLLPLADKYRGHSTPDFRSLELTLGQEQNAYKLE-CLDLENTVEVLPSESLQERAER :: : :..: :: :.::.::. :: ::::.: .:: : .:.:. :.:::: :: : gi|130 LP---LSLSNKNRGLSAPDLRSVGLTPGQEQGASELEGSLGEASTIEIPPGESLQARAAR 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 ILGIEVAVESLLPSARRTEQSQLPEPDASACNPSSSREDSSHSLALPVGPKVATDAFYGR :::::::::::::. ::. :.: :::::::.: : .:. : :.:.::::::: gi|130 ILGIEVAVESLLPGIRRAGQNQPAEPDASACTPESPQEELLSRPAPADVPRVSTDAFYGR 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 mKIAA1 RKCGWTESPLFVGER-----APQASICSDVDGFPTSQATSPEPG----------KKDEEA ::::::.::::::.: :::: ::::: :: ::: .:: :. gi|130 RKCGWTKSPLFVGDRDSARRAPQAFEHSDVDGVVTSTDPVPEPEPSPLESKFFEQKDVET 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 KAPFKSTLFHFMEKSTNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKLVSPPKKADSVHLIRMREVNSL : ::.::::::.:.. .:.: :::::.::::.:.:::::.:::..:: .:.::.::.:. gi|130 KPPFRSTLFHFVERTPSVAGSEKRLRSPSKVIESLQEKLASPPRRADPDRLMRMKEVSSV 570 580 590 600 610 620 680 690 700 710 720 mKIAA1 SQMRCLSSKSADSVEEPDPLKVI-KSSAWLSEGLTSLGGKDEAWQAGHLPSVSQN----- :.:: :: ..::: :. . ::. ...: : ::.: :. :.: . :: :::.. gi|130 SRMRVLSFRNADSQEDAEELKATTRGQAGLPGGLVSPGSGDRAQRLGHSLSVSKDSISRE 630 640 650 660 670 680 730 740 750 mKIAA1 ENGHPEVPRDKMSDQDLWCADSYDPSRVERV :. :: . ..: :::.:: ::::::::::: gi|130 EKEHPAAQKEKSMDQDFWCPDSYDPSRVERV 690 700 710 >>gi|149634746|ref|XP_001507721.1| PREDICTED: hypothetic (1369 aa) initn: 1145 init1: 292 opt: 553 Z-score: 576.7 bits: 118.3 E(): 2e-23 Smith-Waterman score: 1476; 41.266% identity (60.633% similar) in 790 aa overlap (1-725:556-1335) 10 20 30 mKIAA1 TGVQSKKSSKKKSNATIFCLVSIPVKSESL : .:.:::.:::.: :::::::::: :: gi|149 PNQESVRGQVPSQGDGTCETVAKLKKFELGTRTQNKKSAKKKTNETIFCLVSIPVPSEPH 530 540 550 560 570 580 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VLATDTNNNDFKLVADKTRGLCQGSALQEQSLLSMSSTDLELQALMGSMAWRRTSPRQGL . :: ::::.: .: :. ....:::: :::.:::::::::: ::.: .: : gi|149 LPDTDRNNNDLKQSVDLENGFDKSGVLQEQRLLSLSSTDLELQALTGSIASMTRFQKQEL 590 600 610 620 630 640 100 110 120 130 140 mKIAA1 -RESEDGQIDDPRILHLIKPKELQASSPWPGHQYRDQQTQTSFHEDSKSSQLLPATKPGE : .: : :: . : .::. :. ::: :::::::::.: :. ..: : .::: gi|149 GRPAEYKQTDDLSDSRATKHRELRYSGSWPGDQYRDQQTQTNFPEEPPNTQPPPDAKPGG 650 660 670 680 690 700 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ASNVAPTPTCPDTTASEVCLHTALAFSDQNQKPSVPHLQGQTSLSPSRNSAFSRTSSAIN .:: :: : .. . . .: .::.. .:. . .:: :.:: :::: :: gi|149 TSNGLPTSTALAPSTFDKQRQWGLPLSDRKWRPQGSNPKGQGYLTPSSNSAFLSTSPPAA 710 720 730 740 750 760 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 QASMSKGTSDQLPGA---------NPVPKPEVVKGESTTGQCNSTQLFGQFLLKPVSRRP . :. . : :. .: :: :::::: . :.: .:::::::::::::: gi|149 PGPAPKAYQTQPNGSCGDTRDRTTGPGPKREVVKGEEHPA-CSSKELFGQFLLKPVSRRP 770 780 790 800 810 820 270 280 290 300 mKIAA1 WDLISQLESFNKELQEEEESHGGSGSEDS------------------EAEQPEDCADSRT :: :::::::::::: .::: :::.. .: : ..:.: . .: gi|149 WDAISQLESFNKELQSQEESTGGSSGSSSGSSSRRNSSSSNGESVERERKEPKDGTYTRR 830 840 850 860 870 880 310 320 330 340 350 mKIAA1 KSWALQGTRT---AQQPAGL--ALENVASPDRRLNDSQSWNEEPKPGHS-----SVHPQS . .: : : :: . : : .: : . :.::. : :: : ..:: : gi|149 GTVLPDGPRQEARAGQPPRMVGAGGPVFKPGRVKSKSESWSVELKPDHPDTHPPNTHPPS 890 900 910 920 930 940 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 LGPSQEEGSRGVPVQWADGSLTAEQKSQEDLNGMCERDFSPRPVSRIAPIDTKAAPLYCL .: : . ::.: . ::: ..:...:: .. .. :: .:. :.:. : . gi|149 QNPLQAKDSRSVSGRPEDGSGVTERRTQEIEKNPNRHPGSPGQEKRV--ISTRLCPAFAT 950 960 970 980 990 1000 420 430 440 450 460 mKIAA1 SEPRGSQELT--KFGDA--VGSVQLGRETPTQVGNGGDT--EVLPCVLLPLADKYRGHST : :: : .. : ... : . . . .:: : : : .:.: .: : gi|149 PPLYRSPSLTGRKVQETRCVDVLKFVRPSKVTTPLRSDTAEERGSVVRLFVANKNQGTSE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 PDFRSLELTLGQEQNAYKLECLDLEN--TVEVLPSESLQERAERILGIEVAVESLLPSAR ::.:.. :. : ...: .:. . ::: ..:. :::: :: ::::::::::::.:. : gi|149 PDLRTVGLSSGLNHTASQLDDF-LENLSAIEIPQHESLQVRAARILGIEVAVESLIPGHR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 RTEQSQLPEPDASACN---PSSSREDSSHSL-ALPVGPKVATDAFYGRRKCGWTESPLFV :: :: : .:: . : : :::. : : : :: .::::::::::::: gi|149 RTGPSQPPGRGGSASDVERPVVSV--SSHAARADAVRPP--RDAHDSRRKCGWTESPLFV 1130 1140 1150 1160 1170 590 600 610 620 mKIAA1 GERAPQASICSDVDGFPT-SQATSPEPGKKDEEAKAPF------------KSTLFHFMEK ::: .. . ..: : :. :::.: . : .: .:.:.: .:. gi|149 GERDTCSGRVNHASGHPDPSRDTSPHPHVPEAEPLSPVLDQKELKANQLCRSSLLHVVER 1180 1190 1200 1210 1220 1230 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 STNVVGPEKRLRNPSKVVENLQEKLVSPPKKADSVHLIRMREVNSLSQMRCLSSKSADSV .: . : :::.:. :::.:.:: ::.:::.. .:.::.::.:.:.:: :::::.:: gi|149 TTWLPGAEKRFRSASKVIETLQGKLASPPSRMVMDRLVRMKEVDSVSRMRRLSSKSTDSG 1240 1250 1260 1270 1280 1290 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 EEPDPLKVIKSSAWL--SEGLTSLGGKDEAWQAGHLPSVSQNENGHPEVPRDKMSDQDLW .: . : .... :.:: : : : : . : .:: gi|149 DEAEEGKPPRGQGEQRGSHGLPS--GPDLAPKLGPEGAVSTRVLTLGKNGPLTAGVVEEK 1300 1310 1320 1330 1340 1350 750 mKIAA1 CADSYDPSRVERV gi|149 VGGDTFGLGKKLHH 1360 758 residues in 1 query sequences 2727779818 residues in 7921681 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Sat Mar 14 09:41:15 2009 done: Sat Mar 14 09:49:29 2009 Total Scan time: 1085.970 Total Display time: 0.410 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]