FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0703.ptfa, 810 aa vs ./tmplib.26680 library 1768207 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.4671+/-0.00394; mu= 23.3570+/- 0.264 mean_var=73.8136+/-17.212, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1493 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1347 ( 915 res) mtj01524 ( 915) 3708 809 0 mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061) 675 156 2.5e-38 mKIAA0778 ( 1022 res) mph00577 (1022) 512 121 9.2e-28 mKIAA4139 ( 1059 res) mfj21022 (1059) 499 118 6.5e-27 mKIAA1825 ( 1100 res) mfj34163 (1100) 171 47 1.2e-05 mKIAA0611 ( 1093 res) mbh02036 (1093) 137 40 0.002 >>mKIAA1347 ( 915 res) mtj01524 (915 aa) initn: 1920 init1: 1920 opt: 3708 Z-score: 4311.2 bits: 808.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 3708; 67.980% identity (68.401% ungapped) in 812 aa overlap (1-810:56-864) 10 20 30 mKIAA0 GWNEFVTDNAEPVWKKYLDQFRNPLILLLL ::::: .. ::.::::..::.::::.::: mKIAA1 LAVSEVAGLLQADLQNGLNKSEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWKKYISQFKNPLIMLLL 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 GSSVVSVLTKEYEDAVSIALAVLIVVTVGFIQEYRSEKSLEELTKLVPPECNCLRDGKLR .:.:.:.: ....:::::..:..:::::.:.::::::::::::.:::::::.:.:.:::. mKIAA1 ASAVISILMRQFDDAVSITVAIVIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLE 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 mKIAA0 HMLARDLVPGDIVSLSMGDRIPADIRLTEVTDLLVDESSFTGEVEPCGKTDSPL-ADGGD : ::::::::: : ::.:::.:::.:: :..:: :::::.:::. ::.:. .: : .:: mKIAA1 HTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSVDESSLTGETAPCSKVTAPQPAANGD 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 LSTLSNVVFMGTLVQCGKGQGVVIGTGEQSQFGEVFKMMRAEETPKTPLQKSMDKLGKQL :.. ::..::::::.:::..:.::::::.:.::::::::.:::.:::::::::: ::::: mKIAA1 LASRSNIAFMGTLVRCGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQL 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 TIFSFGIIGLLMLVGWVQGKPFLSMFTVGVSLAVAAIPEGLPIVVMVTLVLGVLRMAKKR ...::::::..:::::. :: .: :::..:::::::::::::::: :::.:::.::.::: mKIAA1 SFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKR 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 VIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTANEMTATQLVTSDGFHAEVSGVGYSGEGTVCLL .:::::::::::::::::::::::::: ::::.:...::::.::::.::::. : : . mKIAA1 AIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHILTSDGLHAEVTGVGYNQFGEVIV- 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 PSKEVIKGFDNVSVGKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALVVLAMKMNLGSIKDSYV . .:..:: : .:...:::::: :.::::.:..::.::::::..:::::.: .....:. mKIAA1 -DGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQQDYI 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 RKKEIPFSSEQKWMAVRCGPKSE-DGEDIYFMKGAFEEVIHHCSMYNNGGIPLPLTPQQK :: : :::::::::::.: ... : .: :::::.:.::..:. ::. : : :: ::. mKIAA1 RKAEYPFSSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYNSKGQTLALTQQQR 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 SYCQQEEKKMGSLGLRVLALASGPELGRLTFLGLVGIIDPPRAGVKEAVQVLSESGVSVK . :::. .::: ::::::::::::::.::::::::::::::.:::::: .: ::::.: mKIAA1 DLYQQEKARMGSAGLRVLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGVKEAVTTLIASGVSIK 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 MVTGDALETALAIGRTIGLCNEKLKAMSGEEVEGTEQGALAARVRQVSVFFRTSPKHKVK :.:::. :::.::. .:: .. ...:::::. : :. : .:.::.:.::.::.: mKIAA1 MITGDSQETAIAIASRLGLYSKTSQSVSGEEVDTMEVQHLSQIVPKVAVFYRASPRHKMK 570 580 590 600 610 620 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 IIKALQESGAIVAMTGDGVNDSVALKSADIGIAMGQTGTDVSKEAANMILVDDDFSAIMS :::.::..::.::::::::::.::::.::::.::::::::: ::::.::::::::..::: mKIAA1 IIKSLQKNGAVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMS 630 640 650 660 670 680 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 AVEEGKGIFYNIKNFVRFQLSTSIAALSLITLSTVCNLPSPLNAMQILWVNIIMDGPPAQ :.::::::. :::::::::::::::::.::.:.:. :.:.:::::::::.:::::::::: mKIAA1 AIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQ 690 700 710 720 730 740 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 SLGVEPVDRDALRRPPRSVGDTILNRALILRVLMSAAVIIGGTLFIFWREIPANGTSTPR ::::::::.:..:.:::. :.::.. :::..:.:. .:. ::::.::::. : . ::: mKIAA1 SLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDN-VITPR 750 760 770 780 790 800 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 TTTMAFTCFVFFDLFNALSCRSQTKLIFEIGFFRNRMFLYSVLGSLLGQLAVIYAPPLQK :::.::::::::.::::: ::::: .::::. :.:: :.::::..::: ::: ::::: mKIAA1 DTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQK 810 820 830 840 850 860 810 mKIAA0 VF :: mKIAA1 VFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVSEIIKKVERSREKVQKNAGSASSSFLEV 870 880 890 900 910 >>mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061 aa) initn: 1327 init1: 324 opt: 675 Z-score: 780.4 bits: 155.7 E(): 2.5e-38 Smith-Waterman score: 1450; 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