# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbp06179.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0703.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0703, 810 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7911474 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1418+/-0.000182; mu= 13.6364+/- 0.010 mean_var=76.4178+/-15.319, 0's: 31 Z-trim: 103 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.146716 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|218563486|sp|A7L9Z8.1|AT2C2_MOUSE RecName: Full ( 944) 5229 1116.8 0 gi|148679667|gb|EDL11614.1| mCG129284 [Mus musculu ( 947) 5213 1113.5 0 gi|81915060|sp|Q8R4C1.1|AT2C2_RAT RecName: Full=Ca ( 944) 5045 1077.9 0 gi|114663938|ref|XP_511142.2| PREDICTED: hypotheti (1080) 4670 998.6 0 gi|51491244|emb|CAH18686.1| hypothetical protein [ ( 946) 4668 998.1 0 gi|194208853|ref|XP_001499882.2| PREDICTED: ATPase ( 918) 4667 997.9 0 gi|218511924|sp|O75185.2|AT2C2_HUMAN RecName: Full ( 946) 4666 997.7 0 gi|194373851|dbj|BAG62238.1| unnamed protein produ ( 946) 4664 997.2 0 gi|221045644|dbj|BAH14499.1| unnamed protein produ ( 946) 4640 992.2 0 gi|194674763|ref|XP_587457.4| PREDICTED: similar t (1086) 4639 992.0 0 gi|149640236|ref|XP_001509562.1| PREDICTED: hypoth ( 925) 4563 975.9 0 gi|126304922|ref|XP_001374939.1| PREDICTED: hypoth (1012) 4547 972.5 0 gi|109129353|ref|XP_001112571.1| PREDICTED: calciu ( 947) 4524 967.6 0 gi|224063719|ref|XP_002194501.1| PREDICTED: hypoth ( 943) 4361 933.1 0 gi|112418546|gb|AAI21975.1| Calcium-transporting A (1017) 4175 893.8 0 gi|193786946|dbj|BAG52269.1| unnamed protein produ ( 795) 4146 887.5 0 gi|90819879|gb|ABD98688.1| secretory pathway Ca,Mn ( 916) 4140 886.3 0 gi|27769092|gb|AAH42772.1| Atp2c2 protein [Mus mus ( 668) 3978 851.9 0 gi|57997567|emb|CAI46049.1| hypothetical protein [ ( 975) 3968 849.9 0 gi|118085978|ref|XP_426010.2| PREDICTED: similar t ( 921) 3710 795.3 0 gi|74204840|dbj|BAE35481.1| unnamed protein produc ( 917) 3708 794.9 0 gi|74227444|dbj|BAE21790.1| unnamed protein produc ( 952) 3708 794.9 0 gi|56270316|gb|AAH86994.1| ATPase, Ca++ transporti ( 919) 3702 793.6 0 gi|149018702|gb|EDL77343.1| ATPase, Ca++-sequester ( 953) 3702 793.6 0 gi|73990062|ref|XP_863719.1| PREDICTED: similar to ( 884) 3701 793.4 0 gi|73990064|ref|XP_863744.1| PREDICTED: similar to ( 888) 3701 793.4 0 gi|73990058|ref|XP_863679.1| PREDICTED: similar to ( 919) 3701 793.4 0 gi|73990066|ref|XP_863766.1| PREDICTED: similar to ( 939) 3701 793.4 0 gi|73990054|ref|XP_534262.2| PREDICTED: similar to ( 949) 3701 793.4 0 gi|73990074|ref|XP_851493.1| PREDICTED: similar to ( 953) 3701 793.4 0 gi|73990070|ref|XP_863813.1| PREDICTED: similar to ( 917) 3698 792.8 0 gi|20380103|gb|AAH28139.1| ATPase, Ca++ transporti ( 888) 3697 792.5 0 gi|6826914|gb|AAF27813.2|AF189723_1 calcium transp ( 903) 3697 792.5 0 gi|68068024|sp|P98194.3|AT2C1_HUMAN RecName: Full= ( 919) 3697 792.6 0 gi|119599623|gb|EAW79217.1| ATPase, Ca++ transport ( 922) 3697 792.6 0 gi|30407993|gb|AAP30008.1| secretory pathway Ca2+/ ( 939) 3697 792.6 0 gi|30407995|gb|AAP30009.1| secretory pathway Ca2+/ ( 949) 3697 792.6 0 gi|119599626|gb|EAW79220.1| ATPase, Ca++ transport ( 953) 3697 792.6 0 gi|119599624|gb|EAW79218.1| ATPase, Ca++ transport ( 973) 3697 792.6 0 gi|8134332|sp|Q64566.1|AT2C1_RAT RecName: Full=Cal ( 919) 3695 792.1 0 gi|114589163|ref|XP_001145478.1| PREDICTED: calciu ( 888) 3693 791.7 0 gi|114589167|ref|XP_516748.2| PREDICTED: calcium-t ( 919) 3693 791.7 0 gi|114589155|ref|XP_001146321.1| PREDICTED: calciu ( 919) 3693 791.7 0 gi|114589169|ref|XP_001145322.1| PREDICTED: calciu ( 923) 3693 791.7 0 gi|114589153|ref|XP_001145637.1| PREDICTED: calciu ( 939) 3693 791.7 0 gi|114589151|ref|XP_001145788.1| PREDICTED: calciu ( 949) 3693 791.7 0 gi|114589149|ref|XP_001146246.1| PREDICTED: simila ( 953) 3693 791.7 0 gi|224045467|ref|XP_002196418.1| PREDICTED: simila (1004) 3693 791.7 0 gi|7021497|gb|AAF35375.1|AF225981_1 calcium transp ( 923) 3692 791.5 0 gi|221041376|dbj|BAH12365.1| unnamed protein produ ( 973) 3692 791.5 0 >>gi|218563486|sp|A7L9Z8.1|AT2C2_MOUSE RecName: Full=Cal (944 aa) initn: 5229 init1: 5229 opt: 5229 Z-score: 5975.8 bits: 1116.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5229; 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