FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0763.ptfa, 530 aa vs ./tmplib.26680 library 1768487 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7450+/-0.00498; mu= 11.1495+/- 0.333 mean_var=117.0982+/-27.035, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1185 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1110 ( 911 res) mbg05269 ( 911) 1334 239 1e-63 mKIAA0522 ( 646 res) mbp09103 ( 646) 973 177 3.1e-45 mKIAA4240 ( 416 res) mia02001 ( 416) 538 103 5.6e-23 mKIAA4241 ( 453 res) mfj17221 ( 453) 530 101 1.5e-22 mFLJ00017 ( 408 res) msh09230 ( 408) 501 96 4.5e-21 mKIAA0248 ( 1803 res) mbg12530 (1803) 447 88 7.4e-18 mKIAA2011 ( 771 res) mfj31262 ( 771) 302 63 1.2e-10 >>mKIAA1110 ( 911 res) mbg05269 (911 aa) initn: 1789 init1: 1279 opt: 1334 Z-score: 1236.3 bits: 239.2 E(): 1e-63 Smith-Waterman score: 1804; 57.198% identity (59.635% ungapped) in 514 aa overlap (24-528:300-801) 10 20 30 40 50 mKIAA0 EPELRPRPPRPLESHLAINGSANRQSKSESDYSDGDN-DSINSTSNSNDTINC .:. . .. ::: ....:.: :. . . mKIAA1 RAQSAQEPAVAQAVVEEAVATEAEEEEEGAKQAGKGAEAEGGDNSEQLSSSSASTKSAKS 270 280 290 300 310 320 60 70 80 90 100 mKIAA0 SSESS---SRDSLREQTLSKQTYHKETRNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKG :::.: :...:. :: :: :. : ::..:.:..::: ::::::::: .:.:: mKIAA1 SSEASAAASKEALQAVILSLPRYHCENPASCRSPTLSTDTLRKRLYRIGLNLFNINPDKG 330 340 350 360 370 380 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 IQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSAM ::.:: :::.::::.::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::: : mKIAA1 IQFLISRGFIPDTPIGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNSKKQFNRDVLDCVVDEMDFSNM 390 400 410 420 430 440 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 ELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILL ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: ::.::.::::::::::::::: mKIAA1 ELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCMCNPEVVQQFHNPDTIFILAFAIILL 450 460 470 480 490 500 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 NTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPRETLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQV ::::::::.::.::: ::::..:::::::: ::::: ..::::::...:::.:::::. : mKIAA1 NTDMYSPNIKPDRKMMLEDFIRNLRGVDDGADIPRELVVGIYERIQQKELKSNEDHVTYV 510 520 530 540 550 560 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 QKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFQVPDPNKPQKLGLHQREIFLFN :::: ::: : :::.::::::: :::.: : :: :: . ::::.:::: mKIAA1 TKVEKSIVGMKT----------VLSMPHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAAHQREVFLFN 570 580 590 600 610 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 DLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINF ::::. :. :::.: ::.: .. .: ::. ::::.:: .:: :.. . :.. : ...: mKIAA1 DLLVILKLCPKKKSSFTYTFCKAVGLLGMRFHLFENEYYSHGITLATPLSGSEKKQVLHF 620 630 640 650 660 670 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 NAPNPQDRKKFTDDLRESVAEVQEMEKHRIESELEKQKGV----VRPSMSQCSSLKKESG : . .. .::..::.::.::: :.:. ::: :::::.:. :: . .: . .:. : mKIAA1 CALGSDEMQKFVEDLKESIAEVTELEQIRIEWELEKQQGTKTLSVRSAGAQGDPQSKQ-G 680 690 700 710 720 730 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 NGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPFQP-PQ . : .: . :. :. . .. . :. ... : : . .: . . :. : :: mKIAA1 SPTAKREAMAGEKAA-ESSGEVSIHNRLQTSQHSPKLGVERGAPAPSPPTSPPPLPPDPQ 740 750 760 770 780 790 530 mKIAA0 PPVLCS : : mKIAA1 PSPLREQPPPLPLPPPTPPGTLVQCQQIVKVIVLDKPCLARMEPLLSQALSCYASSSSDS 800 810 820 830 840 850 >>mKIAA0522 ( 646 res) mbp09103 (646 aa) initn: 988 init1: 724 opt: 973 Z-score: 904.5 bits: 177.3 E(): 3.1e-45 Smith-Waterman score: 1641; 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