FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0809.ptfa, 1368 aa vs ./tmplib.26680 library 1767649 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8238+/-0.00601; mu= 5.3696+/- 0.398 mean_var=228.1633+/-53.919, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 6 in 1/35 Lambda= 0.0849 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0308 ( 1890 res) mia33045 (1890) 299 51 2.7e-06 mKIAA1259 ( 1196 res) mpm05149 (1196) 294 50 3.1e-06 mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945) 284 49 9.9e-06 mKIAA1122 ( 1071 res) mbh00587 (1071) 245 44 0.00018 >>mKIAA0308 ( 1890 res) mia33045 (1890 aa) initn: 437 init1: 248 opt: 299 Z-score: 205.3 bits: 50.9 E(): 2.7e-06 Smith-Waterman score: 422; 26.535% identity (34.085% ungapped) in 456 aa overlap (361-808:14-376) 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 PVIIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGPDVVICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVV :: ::.::.:: . . ..:: . ...:. mKIAA0 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