FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1603.ptfa, 871 aa vs ./tmplib.26680 library 1768146 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.2705+/-0.00391; mu= 24.8384+/- 0.262 mean_var=73.4125+/-16.618, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1497 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1697 ( 814 res) mbp07135 ( 814) 1182 265 1.9e-71 mKIAA1997 ( 1226 res) mtj02423 (1226) 922 210 1.9e-54 mKIAA3028 ( 1661 res) mtg01195 (1661) 497 118 9.3e-27 mKIAA0325 ( 1999 res) mbg00515 (1999) 362 89 6.1e-18 >>mKIAA1697 ( 814 res) mbp07135 (814 aa) initn: 1035 init1: 216 opt: 1182 Z-score: 1375.0 bits: 265.4 E(): 1.9e-71 Smith-Waterman score: 1415; 29.044% identity (31.642% ungapped) in 816 aa overlap (113-870:6-812) 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 VNEMYQTSLRQFLGLFDLSLARSVKSPITSKRIANIIEHMTYEVFKYAARGLYEEHKFLF .:. .... .. ..:::.:.::... mKIAA1 SDNLHERLKILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIY 10 20 30 150 160 170 180 190 mKIAA1 TLLLTLKIDIQRNLVKHEEFLTLIKGGASLDLKACPPKP-SKWILDMTWLNLVELSK--- ...: . : ... . . :. ...:.:... : :::: . :. . :.. .: . mKIAA1 SFMLCVDIMREHEQLTEAEWNFFLRGSAGME-KERPPKPEAPWLPIQMWFSCCDLEESFP 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 mKIAA1 ----------LKQFSDILDQISR--NEKMWRVWFDKENPEEEPLPNAYDKSLDCFRRLLL :. .: : .. : .:. . :. ::: ... ... :..:.: mKIAA1 IFEGLTKHILLRPISIKLGSFETYINPPVWE-GYPKQRHEEEK-DHVWGLDFSSFHKLIL 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 IRSWCPDRTIAQARKYIMDSMGENYAEGVILDLEKTWEESDPRTPLICLLSMGSDPTDSI .. .... ......:... : .:: ... . :::. .:: :::: .. mKIAA1 VKCCKEEKVVFALTDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQDMSNSTPLVFILSTGSDPMGAF 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 IALGKRLKIETRY--VSMGQGQEVHARKLLHQTMANGGWVLLQNCHLGLDFL---DELMD .... : .:.:::: :.:.....: .:.::.::::::..... .::. mKIAA1 QRFARESGYAERVQSISLGQGQGPIAEKMIKDAMKTGNWVFLQNCHLAVSWMLAMEELIK 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 VVTE-TETVHDTFRLWITTEVHKQFPITLLQMSIKFANEPPQGLRAGLRRTYGGVSQDLL . :. ..:..:::::.... . ::.:.:: :.: .::::.::::..::.. .. ... mKIAA1 TFTDPNQTIKDTFRLFLSSMPCSTFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSFF 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 mKIAA1 DVSV-GAQWKPMLYAVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNQADFNATVQFIQNHLDDMD . .. : .:. ..... :.:. .:::.::::::::: ::::..: . .. . .. mKIAA1 EENILGMKWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALLNL-----NLY 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 VKKG-VSWTTVRYMIGEIQYGGRVTDDYDKRLLNTFAKVWFSENMFGPDFTFYQG--YNI ..: . : .. :. ::: ::::::: .:.: : : : .:: . . :.:. .. : mKIAA1 CHEGKIPWDALIYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFFSPETLDDDYTYSDSGIYFA 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 PKCSTVDGYLQYIQSLPAYDSPEVFGLHPNADITYQSKLAKDVLDTILGIQPKDSSGGGD : .... . .::..:: :.::.::.: ::....: : .. .. ::: .::..:::: mKIAA1 PLADSLQDFKEYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLVFQYKETNTLITTILEVQPRSSSGGQG 450 460 470 480 490 500 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 ETREAVVARLADDMLEKLPEDYSPFEVKERL---QKMGPFQPMNIFLRQEIDRMQRVLSL .. . .: .:. .. ..::. . ..: : . .: .. .. : ::.::.. .:.: mKIAA1 KSNDEIVQELVASIQTRVPESLQMEGASESLFVKDPQGRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKL 510 520 530 540 550 560 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 VRSTLTELKLAVDGTIIMSENLRDALDCMFDARIPARWKKASWVS-STLGFWFTELLERN .. .: :. :. : ..:::... . . ... ..:. :..... : . :: : .:. :. mKIAA1 IHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTAYPSLKPLGSWVKDLILRT 570 580 590 600 610 620 720 730 740 750 760 mKIAA1 CQFTSWVSNGRPHCFWMTGFFNPQGFLTAMRQEITRANKGWALD------NMVLC----N :.. :.:. ::..::: ::::::. :. .: . . .: ::. mKIAA1 AFVDLWLKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHAR-KYNLPIDELSFKYNMIPVYRDQA 630 640 650 660 670 680 770 780 790 800 810 mKIAA1 EVTKFMKD---------DISAP-PTEGVYVYGLYLEGAGWDKRNMKLIESKPKVLFELMP : . :: : : : .:: :.:...... :: ..: . .. : . ..: mKIAA1 AVIESAKDIQFGTELPMDKELPSPEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMVIEDALPGQMNPMLP 690 700 710 720 730 740 820 830 840 850 860 mKIAA1 VIRIFAENNTARDPRLYCCPIYKKPVRT--------DLNYIAAVDLKTAQAPEHWVLRGV :... ..: :: :.:: .:. . :....: : . . ..:. .: mKIAA1 VVHFEPKQNYEPVHTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRISDYWISKGS 750 760 770 780 790 800 870 mKIAA1 ALLCDVK ::::... mKIAA1 ALLCQLSE 810 >>mKIAA1997 ( 1226 res) mtj02423 (1226 aa) initn: 748 init1: 274 opt: 922 Z-score: 1069.9 bits: 209.6 E(): 1.9e-54 Smith-Waterman score: 995; 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