# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbp01052.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1559.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1559, 504 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7891928 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9104+/-0.000192; mu= 10.0681+/- 0.011 mean_var=75.7416+/-14.819, 0's: 39 Z-trim: 212 B-trim: 1291 in 2/66 Lambda= 0.147369 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|85681855|sp|P10755.2|ZFP14_MOUSE RecName: Full= ( 501) 3562 767.5 0 gi|148692099|gb|EDL24046.1| zinc finger protein 82 (1357) 3535 762.1 0 gi|118764097|gb|AAI28773.1| LOC499124 protein [Rat ( 501) 3366 725.8 6.6e-207 gi|149056371|gb|EDM07802.1| rCG54648 [Rattus norve ( 987) 3352 723.1 8.4e-206 gi|26337507|dbj|BAC32439.1| unnamed protein produc ( 457) 3249 700.9 1.9e-199 gi|194215358|ref|XP_001494637.2| PREDICTED: simila (1539) 3164 683.3 1.3e-193 gi|20140808|sp|Q9HCL3.2|ZFP14_HUMAN RecName: Full= ( 533) 2906 628.0 1.9e-177 gi|158259667|dbj|BAF85792.1| unnamed protein produ ( 533) 2901 627.0 4e-177 gi|194675168|ref|XP_001790692.1| PREDICTED: simila ( 621) 2898 626.4 6.9e-177 gi|114677086|ref|XP_512623.2| PREDICTED: zinc fing ( 660) 2898 626.4 7.2e-177 gi|73947799|ref|XP_867596.1| PREDICTED: similar to (1751) 2417 524.5 8.9e-146 gi|73947805|ref|XP_867624.1| PREDICTED: similar to (1980) 2417 524.6 9.7e-146 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2417 524.7 1.3e-145 gi|22760718|dbj|BAC11308.1| unnamed protein produc ( 532) 2184 474.5 3.1e-131 gi|74762511|sp|Q8N141.1|ZFP82_HUMAN RecName: Full= ( 532) 2174 472.4 1.3e-130 gi|109124516|ref|XP_001112876.1| PREDICTED: simila ( 574) 2162 469.9 8.3e-130 gi|73947801|ref|XP_867605.1| PREDICTED: similar to ( 745) 2160 469.5 1.3e-129 gi|154425583|gb|AAI51290.1| LOC100124429 protein [ ( 534) 2145 466.2 9.6e-129 gi|194675164|ref|XP_001788291.1| PREDICTED: simila ( 548) 2145 466.2 9.8e-129 gi|73947797|ref|XP_867586.1| PREDICTED: similar to ( 939) 2140 465.4 3e-128 gi|194215367|ref|XP_001493771.2| PREDICTED: simila ( 592) 2130 463.1 9.4e-128 gi|81911355|sp|Q6P9Y7.1|ZFP82_MOUSE RecName: Full= ( 530) 2116 460.1 6.9e-127 gi|114676933|ref|XP_001165552.1| PREDICTED: zinc f ( 518) 2064 449.0 1.4e-123 gi|114676931|ref|XP_001165619.1| PREDICTED: zinc f ( 519) 2064 449.0 1.4e-123 gi|6686181|sp|Q9Y2G7.1|ZFP30_HUMAN RecName: Full=Z ( 519) 2063 448.8 1.7e-123 gi|205831220|sp|A2VDQ7.1|ZN420_BOVIN RecName: Full ( 687) 2051 446.3 1.2e-122 gi|75073966|sp|Q9BE27.1|ZFP30_MACFA RecName: Full= ( 519) 2049 445.8 1.3e-122 gi|148692112|gb|EDL24059.1| zinc finger protein 30 ( 486) 2042 444.3 3.5e-122 gi|148692113|gb|EDL24060.1| zinc finger protein 30 ( 548) 2042 444.3 3.8e-122 gi|73948218|ref|XP_855213.1| PREDICTED: similar to ( 650) 2042 444.4 4.3e-122 gi|66773972|sp|Q60585.2|ZFP30_MOUSE RecName: Full= ( 533) 2040 443.9 5e-122 gi|456269|emb|CAA82913.1| zinc finger protein 30 [ ( 548) 2040 443.9 5.1e-122 gi|76634597|ref|XP_596152.2| PREDICTED: similar to ( 612) 1994 434.2 4.9e-119 gi|114676943|ref|XP_524242.2| PREDICTED: zinc fing ( 612) 1986 432.5 1.6e-118 gi|88683007|gb|AAI13871.1| Zinc finger protein 571 ( 609) 1984 432.0 2.1e-118 gi|73909115|gb|AAH40591.1| ZNF571 protein [Homo sa ( 609) 1983 431.8 2.5e-118 gi|31873304|emb|CAD97643.1| hypothetical protein [ ( 609) 1983 431.8 2.5e-118 gi|194378412|dbj|BAG57956.1| unnamed protein produ ( 677) 1982 431.7 3.1e-118 gi|114676937|ref|XP_001165680.1| PREDICTED: zinc f ( 609) 1981 431.4 3.3e-118 gi|149056388|gb|EDM07819.1| rCG54037 [Rattus norve ( 548) 1978 430.7 4.8e-118 gi|134047978|sp|Q7Z3V5.3|ZN571_HUMAN RecName: Full ( 609) 1975 430.1 8e-118 gi|73947795|ref|XP_853558.1| PREDICTED: similar to (1186) 1977 430.8 9.7e-118 gi|7239109|gb|AAF29031.2|AF161544_1 HSPC059 [Homo ( 609) 1971 429.3 1.4e-117 gi|158256262|dbj|BAF84102.1| unnamed protein produ ( 609) 1967 428.4 2.6e-117 gi|75070489|sp|Q5R5Q6.1|ZN571_PONAB RecName: Full= ( 608) 1961 427.2 6.3e-117 gi|62901485|sp|Q6JLC9.1|ZN331_CANFA RecName: Full= ( 490) 1927 419.8 8.1e-115 gi|194215369|ref|XP_001493793.2| PREDICTED: simila ( 609) 1896 413.3 9.1e-113 gi|194215567|ref|XP_001500075.2| PREDICTED: simila ( 552) 1891 412.2 1.8e-112 gi|194675378|ref|XP_001789849.1| PREDICTED: simila ( 532) 1872 408.2 2.8e-111 gi|151555919|gb|AAI49663.1| ZNF404 protein [Bos ta ( 497) 1840 401.3 3e-109 >>gi|85681855|sp|P10755.2|ZFP14_MOUSE RecName: Full=Zinc (501 aa) initn: 3562 init1: 3562 opt: 3562 Z-score: 4096.2 bits: 767.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 3562; 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