FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1588.ptfa, 617 aa vs ./tmplib.26680 library 1768400 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7618+/-0.0054; mu= 9.6668+/- 0.359 mean_var=157.4195+/-39.167, 0's: 0 Z-trim: 65 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1022 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 1472 230 6.1e-61 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 1445 225 8.3e-60 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 1413 221 3e-58 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 1390 217 2.5e-57 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 1370 215 2.7e-56 mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 1367 214 3.7e-56 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 1321 207 2.8e-54 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 1314 206 5.6e-54 mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 1282 201 1.5e-52 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 1260 198 1.4e-51 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 1222 193 7.2e-50 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 1212 191 2.7e-49 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 1187 188 2.9e-48 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 1165 184 2.7e-47 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 1157 183 6.4e-47 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 1110 176 6.9e-45 mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 932 150 5e-37 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 923 148 1.2e-36 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 920 148 2.1e-36 mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 896 145 2.9e-35 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 825 134 3.1e-32 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 746 123 1.2e-28 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 721 119 1.3e-27 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 698 115 1.3e-26 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 697 115 2e-26 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 637 107 1.1e-23 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 623 104 2.8e-23 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 619 104 4.8e-23 mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 570 97 1.4e-20 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 512 88 3.3e-18 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 420 73 1.1e-14 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 396 71 3.9e-13 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 382 69 1.4e-12 mKIAA0287 ( 1618 res) mbg03130 (1618) 374 68 6.3e-12 mFLJ00107 ( 1371 res) mfj24090 (1371) 365 67 1.4e-11 mKIAA0760 ( 1400 res) mbg03730 (1400) 338 63 2.3e-10 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 317 59 1.1e-09 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 320 60 1.2e-09 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 314 59 1.4e-09 mKIAA0569 ( 1248 res) mbg07960 (1248) 314 59 2.5e-09 mKIAA3011 ( 496 res) mph01327 ( 496) 297 56 8.3e-09 mKIAA1675 ( 707 res) mia50030 ( 707) 289 55 2.3e-08 mKIAA0048 ( 622 res) mid07066 ( 622) 276 53 8.1e-08 mKIAA0414 ( 491 res) mbg10164 ( 491) 260 51 3.6e-07 mKIAA1951 ( 392 res) mid22012 ( 392) 255 50 5.3e-07 mKIAA0296 ( 1541 res) mpf00724 (1541) 252 50 1.6e-06 mKIAA1993 ( 527 res) meh02016 ( 527) 245 49 1.7e-06 mKIAA0352 ( 686 res) meh01314 ( 686) 244 49 2.3e-06 mKIAA1483 ( 492 res) mth00273 ( 492) 241 48 2.5e-06 mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 ( 506) 234 47 5.2e-06 >>mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 (558 aa) initn: 6272 init1: 1424 opt: 1472 Z-score: 1186.5 bits: 229.5 E(): 6.1e-61 Smith-Waterman score: 1612; 43.400% identity (46.875% ungapped) in 553 aa overlap (61-610:4-518) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 QESEFSLPSKYDSCQQSLGLFACHAPEPDTPARVCSQESVTFQDIAVDFTEKEWPLLDSS :. . .: ...:.:.:..:...:: :: . mKIAA1 KKKPGMAVTQGQLSFSDVAIEFSQEEWECLDHA 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 QRKLYKDVMLENYSNLSSLGYQVGKPRLISHLEQEEDLRMEERGIQQGPSPDWGTTSKVK :: :..:::::::::: ::: . . .:.::: .:: : . :. mKIAA1 QRALHRDVMLENYSNLLSLGVTLPNLNAMSKLEQ-----------YKGP---WTVESE-- 40 50 60 70 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 WSILLEDIFGKEASDDVRLETSHLLETSSEFSHLCEVFDIGPHLAQPVGRPTGKRPYHHH .: . ::: . .. :.:: : : :: .::. . mKIAA1 -AIRTRKSNGKEYIRAM-FRRSYLL--VHERHH------------------TGAKPYKCN 80 90 100 110 220 230 240 250 260 mKIAA1 SCG--VKNRIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGK :: .. :: .: .. :.: ::..: :::.. ..::.:. ::::.:::.:. ::: mKIAA1 ECGKVFSQNSHLKSHRRIHTGEKPFKCNHCGKAFSVRSNLTHHQVIHTGDKPYKCNECGK 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 AFNDPSALRSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGR .:.. :.: : ::: :::. :..:...: . : :. :. .::::.::::.::::.. . mKIAA1 VFSQTSSLTIHRRTHTGEKPYRCNECGKVFSSHSNLNTHQAIHTGEKPYKCSECGKVFTQ 180 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 SCHLIAHKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNF . :: : : ::::.::.:..:::::. : : : :::::::.:..:::.: .:.. mKIAA1 NSHLANHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVYSSLTTHQAIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHL 240 250 260 270 280 290 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 NLHKKNHMVEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHM :. : :: :.:.:::: ::. . .: :.: .:: .: .:::.: .: : .:. mKIAA1 ASHRGVHSGEKPYKCEECGKLFSQTSNLARHWRVHTGEKPYKCSECGKAFSVRSSLIAHQ 300 310 320 330 340 350 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 NSHTGERPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHL ::::.:: : :::.:: .:.:. :..::: :. :.:. :::.:... . :. :: mKIAA1 VIHTGEKPYKCTECGKVFSQTSSLSIHQRIHTGEKPYRCNECGKAFNSHSNLNTHQVIHT 360 370 380 390 400 410 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 VKKRVDCRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKP .: : ::::.: ..: : .:.:.:::::::.:..::::::. :.:..:. ::::::: mKIAA1 GQKPYKCMQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYKCNECGKAFSVYSSLTTHQAIHTGEKP 420 430 440 450 460 470 570 580 590 600 610 mKIAA1 YECLICGKAFSDHSSLRSHVKTHRGRSSLR-RLCGKGFSEYSNAEEAWQT :.: :::.:...: : :: .:: :.. . : :.:: :. mKIAA1 YKCNECGKVFTQNSHLASHRRTHTGEKPYQCNKCDKAFSVRSSLTTHQAIHTGEKPYTCS 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 ECGKVFSRSSNLTSHQRLHVGQK 540 550 >>mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 (437 aa) initn: 3914 init1: 1362 opt: 1445 Z-score: 1166.1 bits: 225.4 E(): 8.3e-60 Smith-Waterman score: 1445; 46.698% identity (47.031% ungapped) in 424 aa overlap (193-613:4-427) 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 ASDDVRLETSHLLETSSEFSHLCEVFDIGPHLAQPVGRPTGKRPYHHHSCG--VKNRIHL .:.. . ::..:.. . :. .: : mKIAA4 SFAQLTEHIKTHTGEKPFRCKVCARTFRNSSCL 10 20 30 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 TQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFNDPSALRSHT :. .. : : .::. : ::::. ..::.: ::.:::::::. :::::. :.: : mKIAA4 KTHFRIHTGIKPYKCNYCGKAFTARSGLTKHVLIHNGEKPYECKECGKAFSTSSGLVEHI 40 50 60 70 80 90 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 RTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCHLIAHKRTHT : : ::::.: ::..:. :.: :.:.::::.:..:..: :.. :: .: : :::: mKIAA4 RIHTGEKPFECYQCGKALAHSSSLVGHLRTHTGEKPFECNQCDKTFTRSSYLRIHMRTHT 100 110 120 130 140 150 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 GERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKT ::.::::..:::.: . : : .:.:.::::.:::: .:::.: .....: :.: :. mKIAA4 GEKPYECKECGKTFPERSCLTKHIRTHTGERPYECKECGKGFISFAQLTVHIKTHSSERP 160 170 180 190 200 210 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 YECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGERPYGCD ..:: : ::: . : . :.::: :: .: :::.: .: : :. .::::. :.:. mKIAA4 FQCKVCTKSFRNSSSLETHFRIHTGVKPYKCSYCGKAFTARSGLTIHLRNHTGEKSYACQ 220 230 240 250 260 270 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 LCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHLVKKRVDCRQCGK ::::::.::.: :: . : :. .:: :::.:.. :..:: .: .: ::: mKIAA4 ECGKAFSTSSGLIAHIRSHKGEKPFECDHCGKAFASSSYLNVHLKIHTGEKPFQCTVCGK 280 290 300 310 320 330 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 AFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLICGKAFSD .: .: : .:::.::::::..: :::.: .: : :: ::::::::: : :::::.. mKIAA4 TFTCSSYLPVHMRTHTGEKPFQCIICGKSFLWSSYLRVHMRIHTGEKPYVCQYCGKAFTE 340 350 360 370 380 390 590 600 610 mKIAA1 HSSLRSHVKTHRGRSSLR-RLCGKGFSEYSNAEEAWQT ::.: .:.. : :.. . . ::..:. ..:.: mKIAA4 HSGLNKHLRKHTGEKPYEYKECGENFTTSADANEHETPHWGENL 400 410 420 430 >>mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 (736 aa) initn: 2654 init1: 1361 opt: 1413 Z-score: 1138.2 bits: 221.0 E(): 3e-58 Smith-Waterman score: 1413; 45.585% identity (45.803% ungapped) in 419 aa overlap (175-591:313-731) 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 TTSKVKWSILLEDIFGKEASDDVRLETSHLLETSSEFSHLCEVFDIGPHLAQPVGRPTGK .: . .... .:: :.: .. :.. mKIAA1 QIGGNQYEKYKEYENIFYFSSFMEHQKIGSVEKTYKYNEWEKVFGYDSLLTQHTSTYTAE 290 300 310 320 330 340 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 RPYHHHSCGVKN--RIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYE .::. ..::.. .: :: . . :.: ..: .: :.: . ..::.:.: ::: :::: mKIAA1 KPYEFNKCGTSFIWSSYLIQHKKTHPGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGVKPYE 350 360 370 380 390 400 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 CSSCGKAFNDPSALRSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDEC :..:::::. : : ::: : :::. :..:...: : : :.:.::::.:..: :: mKIAA1 CNKCGKAFSWNSHLIVHTRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTEC 410 420 430 440 450 460 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 GKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAF ::... : ::::: : ::::.:..:..: :::. : :..: :.:.: :::.::.:::.: mKIAA1 GKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSF 470 480 490 500 510 520 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 RWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQS :.:.. :...: :: :.:.::::.: . . :: :: :: ::..:::. ... mKIAA1 SWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMA 530 540 550 560 570 580 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 ILKTHMNSHTGERPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRR : :. .::::.:: :. :::.:: : .:.:::.::: :. :.:..: . :. mKIAA1 HLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIA 590 600 610 620 630 640 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 HMSIHLVKKRVDCRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRI : : .: : .::::: ..:.: .:.:.:::::::.:.:: ::: .:.: .:.:. mKIAA1 HRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRM 650 660 670 680 690 700 570 580 590 600 610 mKIAA1 HTGEKPYECLICGKAFSDHSSLRSHVKTHRGRSSLRRLCGKGFSEYSNAEEAWQT :.::: . : ::.::: ::.: .: :.: mKIAA1 HSGEKRFICNQCGRAFSGHSALLQHQKNHSEEKL 710 720 730 >>mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 (504 aa) initn: 2486 init1: 1254 opt: 1390 Z-score: 1121.6 bits: 217.4 E(): 2.5e-57 Smith-Waterman score: 1455; 43.182% identity (45.875% ungapped) in 528 aa overlap (66-593:7-503) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 SLPSKYDSCQQSLGLFACHAPEPDTPARVCSQESVTFQDIAVDFTEKEWPLLDSSQRKLY .: ::: :.::::...:: .:: .:..:: mKIAA1 SNTMALAQGLVTFGDVAVDFSQEEWEFLDPAQKNLY 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 KDVMLENYSNLSSLGYQVGKPRLISHLEQEEDLRMEERGIQQGPSPDWGTTSKVKWSILL .::: :.:::. :: . :. . : ..:: . : .: :.: .. mKIAA1 RDVMWETYSNFISLDLE---SRF------KTDTSSSDKGICEVYSLQWELIEKIK-NLSP 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 EDIFGKEASDDVRLETSHLLETSSEFSHLCEVFDIGPHLAQPVGRPTGKRPYHHHSCGVK . :. ::: : .: ..: .. : ...: . . : :..:: mKIAA1 Q---GSGLSDD--QECKHKTGLQKEPQE-------G-YFGQ-LKITSEKVTYEKHS---- 90 100 110 120 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 NRIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFNDPSA :.... ... .:...:..:.:.: ..:..: :::::::::.:. ::. : . . mKIAA1 ---FLSEYQRVQNEEKFYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQPFRQRAH 130 140 150 160 170 180 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 LRSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCHLIAH : : . : :::..:..:..:: .:. : :.:.::::.::.: :::::. .: : mKIAA1 LIRHHKLHTGEKPYECKDCGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARH 190 200 210 220 230 240 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 KRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLHKKNH .: ::::.::::..:::.:.. .:: .: : ::.:: ::: .::::: .. .:.: : mKIAA1 QRIHTGEKPYECKECGKTFRQCTHLTRHQRLHTSEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIH 250 260 270 280 290 300 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 MVEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGER . :: : ::.::::: . :. :: .:: ::..:::::: .. : :. :: :: mKIAA1 FGEKPYACKDCGKSFRICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTHER 310 320 330 340 350 360 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 PYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHLVKKRVDC :: : : :.::. :.: .:..::. :: ::: :::.: . .:.::: .: .: mKIAA1 PYECLECWKTFSSYSQLISHQSIHVGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYEC 370 380 390 400 410 420 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 RQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLICG ..: : :: : : : ::::::::: ::::: . : :. :.:::::::::.: : mKIAA1 QECRKPFRLLSQLTQHRSIHTGEKPYECKDCGKAFRLYSFLSQHQRIHTGEKPYKCKECK 430 440 450 460 470 480 580 590 600 610 mKIAA1 KAFSDHSSLRSHVKTHRGRSSLRRLCGKGFSEYSNAEEAWQT ::: .:: : .: : : : mKIAA1 KAFRQHSHLTQHQKIHSGT 490 500 >>mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 (885 aa) initn: 3484 init1: 1248 opt: 1370 Z-score: 1103.1 bits: 214.7 E(): 2.7e-56 Smith-Waterman score: 1370; 46.698% identity (47.596% ungapped) in 424 aa overlap (192-607:150-573) 170 180 190 200 210 mKIAA1 EASDDVRLETSHLLETSSEFSHLCEVFDIGPHLAQPV-GRPTG-KRPYHHHSCG--VKNR : : . : :::.: ..:: . :: .. mKIAA0 PSEWTKACETNWQWGTLTPWNSTPVVTASEPSLRELVQGRPSGAEKPYICNECGKSFSQW 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 IHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFNDPSALR .: .:. .. :.. . : .: :.:: :. :..:.: :::::::.: .::: :. : : mKIAA0 SKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLV 180 190 200 210 220 230 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 SHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCHLIAHKR .: ::: :::. :..: .:: . : :.: ::::.:::: :: .:. :: :: :. mKIAA0 QHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQA 240 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 THTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMV :::::.::.: .::: : . .: .: . :.:::::.::.:::.: .:... :...: mKIAA0 THTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTG 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 EKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGERPY :: ::: ::::::. . ::.: :. . : .: ::::: .. : :. .::::::: mKIAA0 EKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPY 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 GCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHLVKKRVDCRQ : :::.::.:::: :..:: :: : :..::: : . ::. :: .: : . mKIAA0 KCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSD 420 430 440 450 460 470 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 CGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLICGKA :::.: .: : : :.:::::::.: .:::.:: .::: .: : : :. . : :::: mKIAA0 CGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKA 480 490 500 510 520 530 580 590 600 610 mKIAA1 FSDHSSLRSHVKTH-RGRSSLRRLCGK---GFSEYSNAEEAWQT : . . :..: : ::.. :: : ::.. mKIAA0 FLEAQELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGFGDPALMTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEG 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 IFMQHQRIHIGENPYKNADGLITHPAPKPQQLRPSRLPFGGNSHPGASESRADPPGQPSK 600 610 620 630 640 650 >>mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 (919 aa) initn: 8402 init1: 1266 opt: 1367 Z-score: 1100.5 bits: 214.3 E(): 3.7e-56 Smith-Waterman score: 1367; 43.833% identity (44.820% ungapped) in 454 aa overlap (160-605:341-792) 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 MEERGIQQGPSPDWGTTSKVKWSILLEDIFGKEASDDVRLETSHLLETSSEFSHLCE--- :: . . : .: . . : . :: mKIAA4 EECGNAFCTLHSVSKMKIHYEVKSYKCEECGKAFATHLSL-IQHKIGHTREKPYQCEECG 320 330 340 350 360 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 -VFDIGPHLAQPVGRPTGKRPYHHHSCGVKNRI--HLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFT .: . .: : . ..::. . :: : .:..:. ...:.: .::..: ::: mKIAA4 KMFYCSSNLKQHQITHSQEKPYKCEVCGKVFRTCWQLSKHLRIHSGEKPYKCEECGKAFY 370 380 390 400 410 420 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 TSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFNDPSALRSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSA : . ::.:. :::::::.: :::.: ::.:. : : :::. :..:.. : : :. mKIAA4 TLSYLTQHKLGHTGEKPYKCEECGKTFYYPSVLKEHLAIHSGEKPYRCDECGKDFCTRSG 430 440 450 460 470 480 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 LKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEH . :.:.::::.::::..::::.. .: :: .:::..::.:..::: : .::.:::: mKIAA4 RSRHQRIHTGEKPYKCEQCGKAFSTHSYLSHHKIVHTGHKPYKCEECGKKFYYPSRLKEH 490 500 510 520 530 540 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 VRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIH : :. :.::.: ::::: .: :. :: .: :: :.:.::::.: ..:. :: mKIAA4 QRIHSQENPYKCEICGKAFYTHSYFTQHKLGHTGEKPYKCEECGKTFYYPSILKEHLAIH 550 560 570 580 590 600 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 IVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGERPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQER ::: .:..::: : ..: . :. ::::.:. :. :::.::. : :: :. .:. :. mKIAA4 SGKKPYRCEECGKDFCTRSGRSRHQRIHTGEKPHKCEECGKVFSTHSYLTQHKVVHSGEK 610 620 630 640 650 660 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 HYECTSCGKVFGDYLSR-RRHMSIHLVKKRVDCRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYE :.: ::: : : :: ..:. :: .. :. ::..: . . :. :.: :::::::. mKIAA4 PYKCEECGKKFY-YPSRLKEHQRIHSQENPYKCEICGNVFCTPKGLSKHQRFHTGEKPYK 670 680 690 700 710 720 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 CDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLICGKAFSDHSSLRSHVKTHRGRSSLR-RLC :..::: : : :. :.:::. :.::.: :::::: :: : .: : :.. . . : mKIAA4 CEECGKMFYYPSRLKEHQRIHSQENPYKCEICGKAFYTHSYLTQHKLGHTGEKPYKCEEC 730 740 750 760 770 780 610 mKIAA1 GKGFSEYSNAEEAWQT :: : mKIAA4 GKTFYYPSILKEHLAIHSGKKPYRCEECGKDFCTRSGRSRHQRIHTGEKPYKCEQCGKAF 790 800 810 820 830 840 >>mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 (481 aa) initn: 2201 init1: 1167 opt: 1321 Z-score: 1066.8 bits: 207.2 E(): 2.8e-54 Smith-Waterman score: 1321; 41.004% identity (42.241% ungapped) in 478 aa overlap (67-539:12-480) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 LPSKYDSCQQSLGLFACHAPEPDTPARVCSQESVTFQDIAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYK ::.:::.:.:.::. .:: :. .::.::. mKIAA1 DMTVELMKAMLQEAVTFNDVAIDFSPEEWDWLNPAQRSLYR 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 DVMLENYSNLSSLGYQVGKPRLISHLEQEEDLRMEERGIQQGPSPD-WGTTSKVKWSILL :.:::: :: :.: :: .: . ..: .:. .... : . :: : . mKIAA1 TVVLENYRNLVSVG---GKSVQKTHELSLRQLVFEDVAVENTTSLGCESLTSGRKQKC-- 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 EDIFGKEASDDVRLETSHLLET-SSEFSHLCEV-FDIGPHLAQPVGRPTGKRPYHHHSC- .:.. .. :... .: :: . . .: :. . : . . . : :.: mKIAA1 KDLLDRQMSQEIF----NLKETVTHKGTHTKEIGYKHTESLKSAHLDSVEENIYTHKSNK 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 -GVKNRIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFN . .. .. .. .. :. ::..:.:.:: :...: :.:::::::::.:. :::::. mKIAA1 KSFSKNPKVWKYKKIWAGKTIFKCNECEKTFTHSSAVTVHQRIHTGEKPYQCTVCGKAFK 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 DPSALRSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCH . : .: :: .:: :.: .:..:: : : .: :.::::.:::: ::.:.. . : mKIAA1 QSHHLAQHHTTHTHEKLFQCEECKKAFSQNSYLTVHRRIHTGEKPYKCKECAKSFRQPAH 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 LIAHKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLH : :.: ::::.::.:. :::::.: : : : :.:::::.: .:::::: . .. .: mKIAA1 LAQHHRIHTGEKPYKCEICGKAFNHSMSLTGHQRVHSGEKPYKCKDCGKAFRQSIHLVVH 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 KKNHMVEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSH .. : :. :::.::::.: . . :.: : .:: ::.:::: : .. : :.. : mKIAA1 SRIHTGEEPYECNECGKTFRESSQLTIHQRNHTGEKPFECKQCGKFFNRSAYLARHQKIH 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 TGERPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHLVKK :::.:: :. :::.:. .. : :...:: :. :.:. :::.::: :: .:. .: .. mKIAA1 TGEKPYECNECGKTFTHAAYLIRHKRVHTGEKPYKCAECGKAFGDGSSRAQHQRLHTGQR 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 RVDCRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYEC :..::.::: .:.:. :.: :::.: mKIAA1 PYVCEKCGRAFRRKSSLNCHQRYHTGKKL 460 470 480 >>mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 (461 aa) initn: 1281 init1: 1281 opt: 1314 Z-score: 1061.4 bits: 206.1 E(): 5.6e-54 Smith-Waterman score: 1396; 42.000% identity (45.952% ungapped) in 500 aa overlap (67-564:2-460) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 LPSKYDSCQQSLGLFACHAPEPDTPARVCSQESVTFQDIAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYK : :::.:.:. .:..:: :: .:: ::. mKIAA1 FQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDPTQRDLYR 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 DVMLENYSNLSSLGYQVGKPRLISHLEQEEDLRMEERGIQQGPSPDWGTTSKVKWSILLE ::: :::.:. :: ... : :. . .:. mKIAA1 DVMQENYGNVVSLDFEI---------------RSEN---EANPK---------------- 40 50 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 DIFGKEASDDVRLET--SHLLETSSEFSHLCEVFDIGPHLAQPVGRPTGKRPYHHHSCGV .: ::::.. : . ::.. . :.:. : . .: : :... : . mKIAA1 ----QEFSDDVEFATMSEEPLENAEKNPGSEEAFESGDQAERPWGDLTAEEWV---SYPL 60 70 80 90 100 110 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 KNRIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFNDPS .. : : . : ..: : :: :::. ..:.::.. :::..::.: :::.:. : mKIAA1 QQVTDLLVHKEAHAGIRYHICSQCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSS 120 130 140 150 160 170 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 ALRSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCHLIA : .: ::: :.:.::..:...: : : :. .::::.:.:: ::::.. : ::: mKIAA1 HLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCTECGKSFCRLSHLIQ 180 190 200 210 220 230 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 HKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLHKKN :.:::.::.::::..:::.:.. ::: .: :.::::::::: .::..: .:.. : . mKIAA1 HQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECHECGRGFSERSDLIKHYRV 240 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 HMVEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGE : :. :.: ::::.::. . .: : : .:: .:..::..: : : :. .:::: mKIAA1 HTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGE 300 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 RPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHLVKKRVD .:: : :::.:: ::.: .:.:::: :. :::. : . ::. . .:. : .: . mKIAA1 KPYECTACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYE 360 370 380 390 400 410 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 CRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLIC : ::::.: ..:.: ::.: ::::::::: .: :.:: .: : :.:.:: mKIAA1 CVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECDKSFSRSSALIKHKRVHTD 420 430 440 450 460 580 590 600 610 mKIAA1 GKAFSDHSSLRSHVKTHRGRSSLRRLCGKGFSEYSNAEEAWQT >>mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 (486 aa) initn: 3411 init1: 1242 opt: 1282 Z-score: 1035.7 bits: 201.4 E(): 1.5e-52 Smith-Waterman score: 1291; 40.719% identity (42.857% ungapped) in 501 aa overlap (69-563:2-483) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 SKYDSCQQSLGLFACHAPEPDTPARVCSQESVTFQDIAVDFTE-KE-WPLLDSSQRKLYK :.. :. . . . :: : .. . .:. . mKIAA0 CSISKPDVITLLEQGKEPWMIVRAEKRRWSR 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 DVMLENYSNLSSLGYQVGKPRLISHLEQEEDL-RMEERGIQQGPSPDWGTTSKVKWSILL : :: : :: : : .: : . :...:: ...: : . : mKIAA0 D--LE--SRYSSNGLLPEKNTYEINLSPWEIMGRIQRRGPEDSP---LGKDFEYK----- 40 50 60 70 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 EDIFGKEASDDVRLETSHLLETSS-EFSHLCEVFDIGPHLAQPVGRPTGKRPYHHHSCG- :: .: .. :. :...:.: . . ... : : . :.:..::. :: mKIAA0 --IF-EEQENSHRVYFRHVIKTTSGKRPPYRKRTSVS--LYQKT--PNGEKPYECGECGK 80 90 100 110 120 130 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 -VKNRIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFND : : .:: :. .. :.: ..:..: ::: : :.::.:::...: :::..:.: :. mKIAA0 AFKVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLNRHQRIHASDKLYECKKCAKIFTC 140 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 PSALRSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCHL : ::.: :.:. :::.::..:..:::. . : .:.:.::::.:: : ::::.. . :: mKIAA0 SSDLRGHQRSHVGEKPYDCKECGKAFRVRGQLMLHQRIHTGEKPYACTECGKSFRQVAHL 200 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 IAHKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLHK :.: ..: .::..::.:: . :. : . :::::::.: .:::::: .....::. mKIAA0 TRHQRLNSGSSRHECKECGRAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYDCKECGKAFRVRQQLTLHE 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 KNHMVEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHT . : :: ..::::::.:: :.::: .:: ::..: : :: : : .:.. : mKIAA0 RIHTGEKPFDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECRKFFRRYSELISHQGIHI 320 330 340 350 360 370 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 GERPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHLVKKR ::.:: : ::::: :.:: :..:: :. :.: : :.: . .:.::: .: mKIAA0 GEKPYDCKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPYKCMECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKP 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 VDCRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECL ::..:::::: .:.: :.: :.:::::.: .: ::: :.:. :.::: mKIAA0 YDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCTECKKAFRQHSHLTYHQRIHKNL 440 450 460 470 480 580 590 600 610 mKIAA1 ICGKAFSDHSSLRSHVKTHRGRSSLRRLCGKGFSEYSNAEEAWQT >>mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 (463 aa) initn: 3574 init1: 1252 opt: 1260 Z-score: 1018.4 bits: 198.1 E(): 1.4e-51 Smith-Waterman score: 1269; 48.219% identity (48.352% ungapped) in 365 aa overlap (247-610:87-451) 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 RIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKPYECSSCGKAFNDPSAL .:: ..::: ::::::. ::::: . : mKIAA1 RKQERQEDPQEGYLSQVRHTSERVSSYEKRALTTRQRIHFVEKPYECNECGKAFRVRQQL 60 70 80 90 100 110 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 RSHTRTHLKEKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDECGKAYGRSCHLIAHK : : : :::..:..:. ::: . : :.:.:.::. :.: :::.:. . .: ::. mKIAA1 TFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGQAFIYGPELRAHQ 120 130 140 150 160 170 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 RTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHM . ::::.:: :..:::::. ..: : : ::::::: : .:::::: .... :.: .. mKIAA1 KLHTGEKPYTCRECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCQECGKAFRQLAHLTRHQKLNV 180 190 200 210 220 230 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 VEKTYECKECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKKPVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGERP :.. ::::::::.: . : : ..: .:: ::..:::.:: .. : :. :::::.: mKIAA1 VDRLYECKECGKDFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKDCGKAFRVRQQLTLHQRSHTGEKP 240 250 260 270 280 290 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 YGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECTSCGKVFGDYLSRRRHMSIHLVKKRVDCR : : :::.:: . .: :..::: :. ::: : :.:. : . :.:::. : ::. mKIAA1 YECTECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGVKPYDCK 300 310 320 330 340 350 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 QCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLICGK .:::::: : : :. :.::::: : .:::.: . ..: .:. :::::::.:: : : mKIAA1 DCGKAFRLLSQLTQHQSVHAGEKPYSCKECGKSFRLRQKLALHQSIHTGEKPFECKECRK 360 370 380 390 400 410 580 590 600 610 mKIAA1 AFSDHSSLRSHVKTHRGRSSLR-RLCGKGFSEYSNAEEAWQT :: .::: .:.. : :.. . . : :.: ..:. mKIAA1 AFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKVHTVKV 420 430 440 450 460 617 residues in 1 query sequences 1768400 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:48:55 2006 done: Mon Mar 27 10:48:56 2006 Scan time: 0.770 Display time: 0.280 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]