FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0593.ptfa, 731 aa vs ./tmplib.26680 library 1768286 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1816+/-0.00599; mu= -1.1310+/- 0.396 mean_var=219.8451+/-51.712, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0865 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1025 ( 1658 res) mbg05022 (1658) 2022 266 2.3e-71 >>mKIAA1025 ( 1658 res) mbg05022 (1658 aa) initn: 2505 init1: 1506 opt: 2022 Z-score: 1373.6 bits: 265.9 E(): 2.3e-71 Smith-Waterman score: 2757; 56.593% identity (59.797% ungapped) in 728 aa overlap (12-728:810-1509) 10 20 30 40 mKIAA0 GTDESAVVPEIHQFHKSLGQPFYETDESPEPLPIPTFLLGY .:::: :. : ..::::::::::.:.:: mKIAA1 LQPFLQDAIQKKRTGRTWENIQHVQGPLTWQQFHKMAGRGTYGSEESPEPLPIPTLLVGY 780 790 800 810 820 830 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 DYDFLVLSPFALPYWEKLMLEPYGSQRDIAYVVLCPENEALLNGARSFFRDLTAIYESCR : .::..:::.::.::.:.:::::..::.::.:.::::::::.::..:::::.:.:: :: mKIAA1 DKEFLTISPFSLPFWERLLLEPYGGHRDVAYIVVCPENEALLEGAKTFFRDLSAVYEMCR 840 850 860 870 880 890 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 LGQHRPISRLLTDGIMKVGATASKKLSEKFVTEWFSQA-ADGNNEAFSKLKLYAQVCRYD ::::.:: ..: ::::.:: :...::.:..:.:::.: .. ... :.:::::::::. mKIAA1 LGQHKPICKVLRDGIMRVGKTVAQKLTEELVSEWFNQPWSSEESDNHSRLKLYAQVCRHH 900 910 920 930 940 950 170 180 190 200 210 mKIAA0 LGPYLASQPLDSSLLSQPNLVAPPNQSLVTAPQMTNTGNANA-PSATLASAASSTMTMTS :.::::. :::.:: :. .:: . : ... :::.. :: . : mKIAA1 LAPYLATLQLDSGLLMPPKHQSPPAE----AQGQATPGNAGSLPSNS-----------GS 960 970 980 990 1000 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 GVPISTSVATANSTLTTTSSSSSSSLSSGVSSNKLPSFPPFGSMNTSGTGSMSAQASTVQ :.: . :. . .:. ... ..:::: ::: ... : : . .:::........ .. : mKIAA1 GAPPAGSAFNPTSSSSANPTTSSSSASSGPPGSSAASAPGITQMNTTSSSGFGGGVGG-Q 1010 1020 1030 1040 1050 1060 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 SGQLGGQQSSSLQAAGISG--ESASLPTQPHPDVSESTMDRDKVGIPTD---GDSHAITY . . ::.... . : : .. :: : ..:. .:...::::. .:::: : mKIAA1 NPSAGGSSTDRTPGNVACGDTEPGQSCTQSSQDGQDSVTERERIGIPTEPDSADSHA--Y 1070 1080 1090 1100 1110 1120 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 PPAIVVYIIDPFTYENKDESTNSSNVWTLGLLRCFLEMVQTLPPHIKSTVSVQIVPCQYL :::.:.:..::::: ...:. :.: : :.:.::. ::.. :: :..:. .:::::::. mKIAA1 PPAVVIYMVDPFTYTAEEDSS-SGNFWLLSLMRCYTEMLDHLPEHMRSSFILQIVPCQYM 1130 1140 1150 1160 1170 1180 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 LQPVKHDDRQIYSQHLKSLAFSVFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGPGLAMETALKSPDRPE :: .: :.. .: :.:::.::::. ::::::::. ..:.::::::. ..: .::.:.:: mKIAA1 LQTMK-DEHVFYIQYLKSMAFSVYCQCRRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPS 1190 1200 1210 1220 1230 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 CIRLYTPPFILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQRWILASCTDLYGELL :.::.:::::::.:::::: :::::::.::::::::::::::::::.:::::::.:::: mKIAA1 PIQLYSPPFILAPIKDKQTEPGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELL 1240 1250 1260 1270 1280 1290 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 ETCIINIDVPNRARRKKGSARRFGLQKLWEWCLGLVQMSSLPWRVVIGRLGRIGHGELKD :::..:: .:.:.:..: :::. :::::::::::.:::.:::::::::::::.::::::: mKIAA1 ETCVVNIALPSRSRKSKVSARKVGLQKLWEWCLGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKD 1300 1310 1320 1330 1340 1350 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 WSCLLSRRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVIMPDSVSTGSV :: ::.. .::..::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:. ::: mKIAA1 WSILLGECSLQTISKQLKDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSV 1360 1370 1380 1390 1400 1410 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 FGRSTTLNMQTPQLNTPQDTSCTHILVFPTSASVQVASATYTTENLDLAFNPNNDGADGM :::::.::::. :::::::.:::::::::::...::: :.: .:. .:.:::: mKIAA1 FGRSTALNMQSSQLNTPQDASCTHILVFPTSSTIQVAPANYPNED---GFSPNNDD---- 1420 1430 1440 1450 1460 1470 700 710 720 730 mKIAA0 GIFDLLDTGDDLDPDI----INILPASPTASPVHSPGSHYP .: : ::.: :: . : .::..::: :::: mKIAA1 -MFVDLPFPDDMDNDIGILMTGNLHSSPNSSPVPSPGSPSGIGVGSHFQHSRSQGERLLS 1480 1490 1500 1510 1520 1530 mKIAA1 REAPEELKQQPLALGYFVSTAKAENLPQWFWSSCPQARNQCPLFLKASLHHHISVAQTDE 1540 1550 1560 1570 1580 1590 731 residues in 1 query sequences 1768286 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:23:52 2006 done: Mon Mar 27 10:23:53 2006 Scan time: 0.900 Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]