FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1246.ptfa, 833 aa vs ./tmplib.26680 library 1768184 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3927+/-0.00583; mu= 10.7791+/- 0.388 mean_var=163.0685+/-39.154, 0's: 0 Z-trim: 29 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.1004 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 ( 721) 2375 357 6.3e-99 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 446 77 1.3e-14 mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 ( 785) 323 59 2.1e-09 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 295 55 2.7e-08 mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 ( 837) 296 55 3.3e-08 mKIAA4111 ( 619 res) mid39041 ( 619) 263 50 7.5e-07 mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 ( 839) 247 48 4.6e-06 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 248 49 6.1e-06 mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 243 48 1e-05 mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 ( 760) 237 47 1.2e-05 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 230 46 2.1e-05 mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 ( 663) 226 45 3.2e-05 mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 ( 637) 223 45 4.3e-05 mKIAA1163 ( 638 res) mfj27154 ( 638) 223 45 4.3e-05 mKIAA1497 ( 721 res) mid15001 ( 721) 223 45 4.6e-05 mKIAA4018 ( 606 res) mej02761 ( 606) 198 41 0.00051 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 202 42 0.00066 mKIAA1916 ( 588 res) mbg08812 ( 588) 189 40 0.0012 mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 186 39 0.0017 mKIAA1790 ( 1898 res) mpf00986 (1898) 192 41 0.0019 mKIAA4170 ( 1376 res) mbg21326 (1376) 187 40 0.0026 >>mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 (721 aa) initn: 1745 init1: 1178 opt: 2375 Z-score: 1868.5 bits: 356.5 E(): 6.3e-99 Smith-Waterman score: 2382; 52.235% identity (54.282% ungapped) in 716 aa overlap (45-745:2-705) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 RSPGALRSRPWSLPATGRCRLAQVQRLSDQTMETLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQN ::: .: :. .:.: . . ::: :::: mKIAA4 STMEKFLFYLFLIGIAVRA-QICPKRCVCQI 10 20 30 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 LSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHIGRQDFANMTGLVDLTLSRNTIS :: .:.::: .::::::::.::::::::::. ::. .: :.::::::.:::::::::::: mKIAA4 LSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLADNFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTIS 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 HIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADDAFEDFLL : : .: ::..::.:::.:::: .. .: . :: ::.:::.::::: :.. ::.: .. mKIAA4 FITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFSGLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDD-VF 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 TLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRL .::.::::::::. .:::.:..::.:: ::::::..:.: .:::. :.:..:::.:::.: mKIAA4 ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLDHNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKL 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 QKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPP-LSFSFGGNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSP :::::::.: :.:. : :. ..: ...::::::::::::::::::: :.::::::.:: mKIAA4 QKLPPDPLFQRAQV-LATSGIISPSTFALSFGGNPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASP 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 GSLKGRYFWHIREEEFVCEPPLITQHTHKLLVLEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDR . : ::::: : ::::.:::::::.:::.. ::::: :::.::: ::: : :::..:. . mKIAA4 ALLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVLEGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGK 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 LVGNSSRTAVYDNGTLDILITTSQDSGPFTCIAANAAGEATATVEVSIVQLPHLSNSTSR :..:..:. ::::::::::::: .:.: :::::.: ::::: ::.. :..:::: :::.. mKIAA4 LISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIASNPAGEATQTVDLHIIKLPHLLNSTNH 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 MAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGAGEPPKSTPERAVLVSDVTTTSALVKWSVSKSAPR . : :::. :.:. :...:... : . .. ..:...:...::.:.. ... : mKIAA4 IHEPDPGSSDISTSTKS--GSNASSSNGDTKMSQDK-IVVAEATSSTALLKFNFQRNIPG 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 VKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNNLVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIV ..:.:.::: . :..:.::::: ..:.:.::::.::: :::::::..:: :.:::: .: mKIAA4 IRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNNLASGTMYDLCVLAIYDDGITSLTATRVV 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 GCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGGIIVATLLVFIVILMVRYKVCNHDTPGKM :: :: :. :: .:. :.::.::::::..:::::::..::::.:::.::::::.. :. mKIAA4 GCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGGIIVASVLVFIIILMIRYKVCNNN--GQH 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 660 mKIAA1 AAATVSNVYSQTNGSQPPPLGGIPVGQLPQAPPKVVVRNE--------LMDFSTSLARAC .. ::::::::::.: . : : :::. : .. .: : . . ...: mKIAA4 KVTKVSNVYSQTNGAQ---MQGCSV-TLPQSMSKQAMGHEENAQCCKVASDNAIQSSETC 570 580 590 600 610 670 680 690 700 710 mKIAA1 DSSSSSSLGSG------EAAGLGRGPWRLPPPAPRPKPSLDRLMGAFASLDLKSQRKEEL .:..::. :. .: ... : : .:. . . .. .. ... mKIAA4 SSQDSSTTTSALPPTWTSSAPVSQKQKRKTGTKPSAEPQSEAVTNVESQNTNRNNSTALQ 620 630 640 650 660 670 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 LDSRTPAGRGAGTSSRGHHSDREPLLGPPATRARSLLPLPLEGKAKRSHSFDMGDFAAAA : : : . : .:. :. . :: mKIAA4 LASCPPDSVTEGPTSQRAHTKPNALLTNVDQNVQETQRLESI 680 690 700 710 720 >>mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431 aa) initn: 409 init1: 101 opt: 446 Z-score: 354.4 bits: 77.3 E(): 1.3e-14 Smith-Waterman score: 446; 32.121% identity (35.216% ungapped) in 330 aa overlap (151-469:19-330) 130 140 150 160 170 mKIAA1 TGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDS--NRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNN ::: ::. . ..: : .:. :..:: mKIAA0 ARRQKRQCRESSLPRTQQHLDLRFNRIREIQPGAFRRLRSLNTLLLNN 10 20 30 40 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 NQLGGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTF ::. : . :::: : .:. : : :..... .. . ...:.:: : : .. . .: mKIAA0 NQIKKIPNGAFED-LENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPESF 50 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 ADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPPLSFSFGGNPLHCNCELLWL : :: :: : .::. .: : . :: . . . .: :::.::.::: mKIAA0 QHLPKLERLFLHNNRITHLIPGTF---SQLESMK--------RLRLDSNALHCDCEILWL 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 RRLERD-------DDLETCGSPGSLKGRYFWHIREEEFVCEPPLITQHTHKLLVLEGQAA : . . :: : ..:: : ::. :: : ::.. . : :... mKIAA0 ADLLKTYAQSGNAQAAATCEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSEPQDADVTSGNTV 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 TLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRL-VGNSSRTAVYDNGTLDILITTSQDSGPFTCIAANAA . :.: :.:.: : :. ...: . ..:: . :.::: : : : : . :.: :.: mKIAA0 YFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQEADEGVYQCMAKNVA 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 mKIAA1 GEATATVEVSIVQLPHLSNSTSRMAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGAGEP-PKSTPER ::: : ::.. : . : . : .... ..: : : . :..:.: :. : : mKIAA0 GEAK-TQEVTLRYLGSPARPTFVIQPQNTEV--LVGESVTLEC---SATGHPLPQITWTR 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 AVLVSDVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNNLVSG . mKIAA0 GDRTPLPIDPRVNITPSGGLYIQNVAQSDSGEYTCFASNSVDSIHATAFIIVQALPQFTV 340 350 360 370 380 390 >>mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 (785 aa) initn: 467 init1: 194 opt: 323 Z-score: 261.1 bits: 59.2 E(): 2.1e-09 Smith-Waterman score: 323; 25.275% identity (28.822% ungapped) in 455 aa overlap (28-450:18-448) 10 20 30 40 50 mKIAA1 REPVSGQEGCVAEPRSPGALRSRPWSLPATGRCRLA--QVQRLSDQTMETLLGGLLAFGM : .: ::: : . :... . .: . :. . mKIAA1 AGRAREATDARSSLRLSPESGD-RLAAPQHHTASQRAAGVTMGPFGALCL 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 AFA---VVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHIGRQ :.: :: :::. :.: . . : : : :: . .. : :..: : . : mKIAA1 AWALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 DFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLI :.:.: ...: :... . .. .. : .:..: :. : . .. . ::.: :: : mKIAA1 AFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQLLK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 VNNNQLGGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAE .:.:.::.. ::. : :..: .. : :. : . . : .:.: :: . : . mKIAA1 MNHNRLGSLPRDAL-GALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYHNPF-HCSC 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 mKIAA1 GTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASL-------LTATPFAPP-LSFSF--- : .. :: : .:.:.. :: : : : : : : ::: . .: mKIAA1 G-LVWLQAWA----ASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPALPCAPPSVRLSAEPP 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 ---GGNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGSLKGRYFWHIREE--EFVCEPPLITQH :.::. . .. : . : : :... : ::..... mKIAA1 PEAPGTPLRAGLAFML-----------HCVAEGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLVPPVLSKE 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 TH---KLLVLEGQA-ATLKCKA-IGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDILIT :. ::.. : .. :.: : :: . : . ::.: . . mKIAA1 EDGGDKVEDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPP-----ATPRFLALANGSLLVPLL 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 mKIAA1 TSQDSGPFTCIAANAAGEATATVEVSIV------QLPHLSNSTSRMAPPKSRLSDITGSS .....: .:: : : : .....:... . : .. . ..: . : . : : mKIAA1 SAKEAGIYTCRAHNELGTNSTSLRVTVAAAGPPKHAPGTGEEPDAQVPTSERKATTKGRS 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 KTSRGGGGSGAGEPPKSTPERAVLVSDVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEV .. mKIAA1 NSVLPFKPEGKTKGQGLARVSVLGEIEAELEETDEGEQMEGQIPADPMGEKHCDHGDPSR 450 460 470 480 490 500 >>mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 (528 aa) initn: 299 init1: 164 opt: 295 Z-score: 241.2 bits: 55.0 E(): 2.7e-08 Smith-Waterman score: 302; 34.722% identity (38.071% ungapped) in 216 aa overlap (46-257:33-233) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 SPGALRSRPWSLPATGRCRLAQVQRLSDQTMETLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNL : ..: : :.::: :: : : mKIAA0 RLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSVVLKMLPALGMA------CPPKCRC--- 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 SESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHIGRQDFANMTGLVDLTLSRNTISH :.: : :.:. :: :. .. : : : : . :..::... :. : :..: :: mKIAA0 -EKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITALERDQFASFSQLTWLHLDHNQIST 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 IQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADDAFEDFLLT .. .: : .:. : :.::.. : . :. :.:::.: .. :::... . : : mKIAA0 VKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYG-LRK 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 LEDLDLSYNNLHGLP----WDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTS :. : : :.:. .: :: .:. :.:. : : .:.. :: : :: .: : mKIAA0 LQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCR----SLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEH 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 NRLQKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPPLSFSFGGNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCG :.: :. mKIAA0 NQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMDWTWSTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFE 230 240 250 260 270 280 >>mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 (837 aa) initn: 304 init1: 161 opt: 296 Z-score: 239.7 bits: 55.3 E(): 3.3e-08 Smith-Waterman score: 300; 31.056% identity (34.602% ungapped) in 322 aa overlap (8-308:35-344) 10 20 30 mKIAA1 REPVSGQEGCVAEPRSPGALRS-RPWSLPATGRCRLA :: . : .: : .. :: .:: : mKIAA0 TRASHRDKEEGLDGAPAKYERGLFSDSGPAEGNAEETQSRPAQKTIRPQR---AGR---A 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 QVQRLSDQTMETLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDID .. .. . .. : ::: : ::. : ::. .. :: ..:: :: . mKIAA0 AMEGVGAVRFWLVVCGCLAFPPRAESV--CPERCDCQHPQH---LLCTNRGLRAVPKTSS 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 ----RRTVELRLGGNFIIHIGRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHL . .. :::::: .: :: . : : :. : : ..: .: : :. :.: mKIAA0 LPSPQDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 DSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWD .: : .: :: : .:. : .:.:..: .. .:: : .: : :. : : .:: mKIAA0 GNNLLQALVPGTLAPLRKLRILYANGNEIGRLSRGSFEG-LESLVKLRLDGNVLGALPDA 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 mKIAA1 SVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQ-KLPPDPIFA--RSQAS . :: : :. : . .....:..: :: :.:..:.:: .: :. :: .. mKIAA0 VFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFSQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFVPLRSLST 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 mKIAA1 L-LTATPFA----------PPLSF-SFGGNPL-HCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGSL : :.:. . : :.. :..:: : : : .: . :. :: mKIAA0 LILSANSLQHLGPRVFQHLPRLGLLSLSGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLNQLP 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 KGRYFWHIREEEFVCEPPLITQHTHKLLVLEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVG mKIAA0 LTLLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHQGRLRELSLRDNALSALSGDIFAASPALYR 360 370 380 390 400 410 >>mKIAA4111 ( 619 res) mid39041 (619 aa) initn: 376 init1: 162 opt: 263 Z-score: 215.3 bits: 50.4 E(): 7.5e-07 Smith-Waterman score: 309; 30.328% identity (32.174% ungapped) in 244 aa overlap (27-257:7-249) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 REPVSGQEGCVAEPRSPGALRSRPWSLPATGRCRLAQVQRLSDQTMETLLGGLLAFGMAF :::.. . ... : .. .. .::. .:.: . mKIAA4 TALAHCLPAASSVQGTMALRTGSPALVVLLAFWVALGPCY 10 20 30 40 70 80 90 100 mKIAA1 -------AVVDA----CPKYCVCQ--NLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGN : .:: :: :.:. . .. :...: :..: .: .: : : : :: mKIAA4 LQGTDPGASADAEGPQCPVTCTCSYDDYTDELSVFCSSRNLTQLPDSIPVSTRALWLDGN 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 FIIHIGRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRG . : : :...: :.:. . . ..: ..: :..: :::. : : ::. .: mKIAA4 NLSSIPSAAFQNLSSLDFLNLQGSWLRSLEPQALLGLQNLYHLHLERNLLRSLAAGLFRH 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 LVNLQHLIVNNNQLGGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDH .: : ..:: :: . . :. : : ::.:..:.: :: . . :::.: : mKIAA4 TPSLASLSLGNNLLGRLEEGLFRG-LSHLWDLNLGWNSLVVLPDTVFQGLGNLHELVLAG 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 NLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPPLSFSFGGN : : .. . . : .: .:::. : :... mKIAA4 NKLTYLQPALLCGLGELRELDLSRNALRSVKANVFIHLPRLQKLYLDRNLITAVAPRAFL 220 230 240 250 260 270 >>mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 (839 aa) initn: 273 init1: 149 opt: 247 Z-score: 201.3 bits: 48.2 E(): 4.6e-06 Smith-Waterman score: 263; 23.890% identity (28.535% ungapped) in 473 aa overlap (28-483:219-631) 10 20 30 40 50 mKIAA1 REPVSGQEGCVAEPRSPGALRSRPWSLPATGRCRLAQVQRLSDQTMETLLGGLLAFG : : : .. : .: . . : .:. mKIAA0 HTTPASVNSVATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSRQPSKDLGYSNY-GPSIAYQ 190 200 210 220 230 240 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 MAFAVVDACPKYCVCQ-NLSE-SLGTLCPSKGLLFV----PPDIDRRTVELRLGGNFIIH : :: :.:. ..:. .:.. : . . . : . . .. : :.: mKIAA0 TKSPVPLECPTACTCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPK--KMYLTENYITV 250 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 IGRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNL . : :: . ::: : :. : :: :: .: :: .:: :.:..::. :. . . :: .: mKIAA0 VRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLGNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSL 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 QHLIVNNNQLGGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLD :.:... : . : .:. .: ::. : :..: :. mKIAA0 QYLFLQYNLIREIQAGTFDP-----------------VP--------NLQLLFLNNNQLQ 370 380 390 400 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 HIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPPLSFSFGGNPLHC . :.:. : : ::.: .: . .:: . .. .: . : ..... :: : mKIAA0 AMPSGVFSGLT-LLRLNLRGNSFTSLPVSGVL--DQLTSL--------IQIDLHDNPWDC 410 420 430 440 300 310 320 330 340 mKIAA1 NCEL----LWLRRLERD--DDLETCGSPGSLKGRYFWHIREEEFVCEPPLITQHTHKLLV .:.. ::...:. : : .: .. :. :. : ..: : .. ..: mKIAA0 TCDVVGMKLWIEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETYMRSIKSE-LLC--PDYSD----VVV 450 460 470 480 490 500 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDILITTSQDSGPFTCI .... :: . ..: :: ::. : . . :. .: :.. . mKIAA0 STPTPSSIQV-----PSRT-NAATPAVRL--NSTGTPA------GLGAGTGASSVPLSVL 510 520 530 540 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 AANAAGEATATVEVS-----IVQLPHLSNSTSRMAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGAG . .: :. .:. . .:.... . .: .:... . .. ::::.:.: mKIAA0 ILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGGGGG 550 560 570 580 590 600 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 EPPKSTPERAVLVSDVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKA .: . .:. . : : .. : mKIAA0 HPHAHVHHRGPALPKVKTPAGHVYEYIPHPLGHMCKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVT 610 620 630 640 650 660 >>mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557 aa) initn: 290 init1: 203 opt: 248 Z-score: 199.0 bits: 48.7 E(): 6.1e-06 Smith-Waterman score: 352; 29.141% identity (34.420% ungapped) in 326 aa overlap (14-331:6-289) 10 20 30 40 50 mKIAA1 REPVSGQEGCVAEPRSPGALRSRP-WSLPATGRCRLAQV-QRLSDQTMETLLGGLLAFGM : . : : :: . . :. .: . :: :.. . :: .. mKIAA0 HLELAPDGDGQ-RLRPSGTRTGHGEGTMALTPQRGSSSGLSRPELWLLLWAA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 AFAV-VDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHIGRQDF :. . . ::: :.: . . . : . :: .: .: : : .:.:.:: : .: ..:: mKIAA0 AWRLGATACPALCTCTGTTVD----CHGTGLQAIPKNIPRNTERLELNGNNITRIHKNDF 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 ANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVN :.. : : : .: :. .. .: :.. :. :.:. :.: : : :. . mKIAA0 AGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQLQVLPE-----------LLFQ 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 NNQLGGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGT ::: .: :::: : :...: . : ..:..:.::.: .. : ::. mKIAA0 NNQ--------------ALSRLDLSENFLQAVPRKAFRGATDLKNLQLDKNRISCIEEGA 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 FADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPPL-SFSFGGNPLHCNCELL : :. : : :..: . .: ... : : .: . .: : :.:.: mKIAA0 FRALRGLEVLTLNNNNITTIP------------VSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLA 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 WLRRLERDDD----LETCGSPGSLKGRYFWHIREEEFVCEPPLITQHTHKLLVLEGQAAT :: . :. . :..:.::.: .... :: : mKIAA0 WLSQWLRQRPTIGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKGEFSCSGQGEAAGAPACTLSSGSCPA 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 LKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDILITTSQDSGPFTCIAANAAGE mKIAA0 MCSCSSGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQ 320 330 340 350 360 370 >>mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593 aa) initn: 453 init1: 204 opt: 243 Z-score: 194.9 bits: 48.0 E(): 1e-05 Smith-Waterman score: 343; 28.399% identity (33.571% ungapped) in 331 aa overlap (32-357:63-347) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 EPVSGQEGCVAEPRSPGALRSRPWSLPATGRCRLAQVQRLSDQTMETLLGGLLAFGMAFA : :.... .. ::. :: .:.. . . mKIAA4 CGLQAQRQALGLGHCPVFTQPKAQEKSFKARSLLGKMSGIGWQTLSLSLGLVLSI-LNKV 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 VVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHIGRQDFANMT . .::: : :.. . . : . .: :: .: : : .: :.:: : .: . :::.. mKIAA4 APQACPAQCSCSGSTVD----CHGLALRSVPRNIPRNTERLDLNGNNITRITKIDFAGLR 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 GLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQL : : : .: :: :. .: ::. :. :.:. : : . : . : ..: .: mKIAA4 HLRVLQLMENRISTIERGAFQDLKELERLRLNRNNLQLFPELLFLGTAKLYRL------- 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 GGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADL ::: :.....: . : :....:.::.: .. : .:.: : mKIAA4 ------------------DLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL 210 220 230 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 QKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPPL-SFSFGGNPLHCNCELLWL-- . : : :..: . .: : ::. : : .: . .: :.:.:.: :: mKIAA4 RDLEVLTLNNNNITRL--------SVASF----NHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 --RRLERDDDLETCGSPGSLKGRYFWHIREEEFVCEPPLITQHTHKLLVLEGQAATLKCK :. : : .:. :.:. .....:::: .. :. . . . ..:.: mKIAA4 WLRQRPRVGLYTQCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDE---EEGHQSF-MAPSCSVLHCP 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 AIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDILITTSQDSGPFTCIAANAAGEATAT : mKIAA4 AACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPETITEIRLEQNSIRVIPPGAFSPYKKLRRLDLSNN 350 360 370 380 390 400 >>mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 (760 aa) initn: 390 init1: 158 opt: 237 Z-score: 193.9 bits: 46.7 E(): 1.2e-05 Smith-Waterman score: 267; 26.524% identity (31.985% ungapped) in 328 aa overlap (49-364:71-354) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 ALRSRPWSLPATGRCRLAQVQRLSDQTMETLLGGLLAFGMAFAVVDACP-KYCVCQNLSE :: : :. . .. :.: : : :... mKIAA1 LCLWRAGWLLLLCDEIWDELLALKMLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEG 50 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 SLGTLCPSKGLL----FVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHIGRQDFANMTGLVDLTLSRNTI .: . : .::. :. : . .: : :: . .. ..:::. . :.: . : . mKIAA1 DLHVDCEKKGFTSLQRFTAPT--SQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGL 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 SHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADDAFEDFL .: : .:: :. .. ::...:.. :. ..:. :: .:..: .. : : : ::.: : mKIAA1 HEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQD-L 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 LTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNR :: : :. : . :: :..... ...::: .:: mKIAA1 NKLEVLILNDNLISTLP----------------ANVFQYVP---------ITHLDLRGNR 220 230 240 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 LQKLPPDPIFARSQASLLTATPFAPPLSFSFGGNPLHCNCELL----WLRRLERDDDL-- :. :: . . : : . . :: :.:.:: ::. . .. . mKIAA1 LKTLPYEEV--------LEQIPGIAEILLE--DNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGR 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 ETCGSPGSLKGRYFWHIREEEFVCEPPLITQHTHKLLVLEGQAATLKCKAIGD-PSPLIH .: .: :.:. . . :... : :: .. .: . .: :. : : :.:. mKIAA1 VVCEAPTRLQGKDLNETTEQDL-C--PLKNRVDSSLPAPPAQEETF---APGPLPTPFKT 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 WVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDILITTSQDSGPFTCIAANAAGEATATVEVSIVQLPH mKIAA1 NGQDEHATPGAVPNGGTKIPGNWQLKIKPTPPIATGSARNKPPVHGLPCPGGCSCDHIPG 360 370 380 390 400 410 833 residues in 1 query sequences 1768184 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:39:12 2006 done: Mon Mar 27 10:39:13 2006 Scan time: 0.910 Display time: 0.330 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]