FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1001.ptfa, 512 aa vs ./tmplib.26680 library 1768505 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3871+/-0.00422; mu= 17.8291+/- 0.282 mean_var=81.1445+/-18.211, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1424 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4172 ( 515 res) mbj00115 ( 515) 689 151 1.9e-37 mFLJ00319 ( 537 res) mib36033 ( 537) 574 127 2.5e-30 mKIAA1247 ( 948 res) mpm06364 ( 948) 176 46 1.5e-05 mKIAA1077 ( 1163 res) mpm06017 (1163) 169 45 4.5e-05 >>mKIAA4172 ( 515 res) mbj00115 (515 aa) initn: 784 init1: 269 opt: 689 Z-score: 764.7 bits: 151.1 E(): 1.9e-37 Smith-Waterman score: 950; 36.731% identity (41.164% ungapped) in 520 aa overlap (15-512:21-506) 10 20 30 40 50 mKIAA1 AFSGFFYPLVDFSISGKTRAPQPNIVIILADDMGWGDLGANWAETKDTTNLDKM .: . : :::..:.:::.:.::::. .. : :::.. mKIAA4 GHRPICISVMALGTLFLALAAGLSTASPPNILLIFADDLGYGDLGSYGHPSSTTPNLDQL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 ASEGMRFVDFHAAASTCSPSRASLLTGRLGLRNGVTHN-FAVTSVGGLPVNETTLAEVLR : :.::.::.. .: :.::::.:::::: .:.:. . .. .: ::::..:.:::::: mKIAA4 AEGGLRFTDFYVPVSLCTPSRAALLTGRLPVRSGMYPGVLGPSSQGGLPLEEVTLAEVLA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 mKIAA1 QEGYVTAMIGKWHLG--HHGSYHPNFRGFDYYFGIPYSNDMG-CTDAPGYNYP--PCPA- .::.:.: :::::: .:.. : .:: ..:::::.:.: : . . : :: . mKIAA4 ARGYLTGMAGKWHLGVGPEGAFLPPHQGFHRFLGIPYSHDQGPCQNLTCFP-PDIPCKGG 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 CPQRDGLWRNPGRDCYTDVALPLYENLNIVEQPVNLSGLAQKYAERAVEFIEQASTSGRP : : :: : .:: ::.. :: : :: .:. . ... .:. .::: mKIAA4 CDQ--GL-----------VPIPLLANLTVEAQPPWLPGLEARYVSFSRDLMADAQRQGRP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 FLLYVGLAHMHVPLSVTPPLAHPQRQSLYRASLREMDSLVGQIKDKVDHVAR-ENTLLWF :.:: . : : : ... . .. . :: :.:. :: . : .. :.::. : mKIAA4 FFLYYASHHTHYPQFSGQSFTKRSGRGPFGDSLMELDGAVGALMTTVGDLGLLEETLVIF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 TGDNGPWAQKCELAGSVGPFFGLWQTHQGGSPTKQTTWEGGHRVPALAYWPGRVPANVTS :.:::: .. : : :: . .: ::.::: : :::.::::.. .:: mKIAA4 TADNGPELMRM----SNGGCSGLLRCGKG------TTFEGGVREPALVYWPGHITPGVTH 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 TALLSLLDIFPTVIALAGASLPPNRKFDGRDVSEVLFGKSQMGHR-VLFHPNSGAAGEYG : : ::..::. ::.:: :: : .:: :.: .:.: .. .. :.:.: : mKIAA4 E-LASSLDLLPTLAALTGAPLP-NVTLDGVDISPLLLGTGKSPRKSVFFYPPY--PDEIH 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 mKIAA1 ALQTVRLNHYKAFYITGGAKACDGSVGPEQH-------HVAPLIFNL-EDAADEGMPLQ- .. .:: ..::: ..: :. : . : : : ::...: .: ... :. mKIAA4 GVFAVRNGKYKAHFFTQGSAHSDTTSDPACHAANRLTAHEPPLLYDLSQDPGENYNVLES 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 -KG-SPEYQEVLQ--QVTRALADVLQDIADDNSSRADYTQDPSVIPCCNPYQTTCRCQPV .: ::: ..:. :. .: :. . .. .. .... ::.. ::.: .: .:: mKIAA4 IEGVSPEALQALKHIQLLKAQYDAAMTFGPSQIAKGE---DPALQICCQP---SCTPHPV 460 470 480 490 500 mKIAA4 CCHCPGSQS 510 >>mFLJ00319 ( 537 res) mib36033 (537 aa) initn: 869 init1: 298 opt: 574 Z-score: 636.8 bits: 127.5 E(): 2.5e-30 Smith-Waterman score: 886; 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