FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4172.ptfa, 515 aa vs ./tmplib.26680 library 1768502 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0519+/-0.00439; mu= 14.6523+/- 0.294 mean_var=95.1077+/-21.964, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 5 in 1/35 Lambda= 0.1315 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00319 ( 537 res) mib36033 ( 537) 958 192 1e-49 mKIAA1001 ( 512 res) mbj00867 ( 512) 689 141 2.3e-34 mKIAA1077 ( 1163 res) mpm06017 (1163) 182 45 3.7e-05 mKIAA1247 ( 948 res) mpm06364 ( 948) 166 42 0.00026 >>mFLJ00319 ( 537 res) mib36033 (537 aa) initn: 722 init1: 304 opt: 958 Z-score: 984.7 bits: 191.9 E(): 1e-49 Smith-Waterman score: 958; 36.138% identity (39.873% ungapped) in 523 aa overlap (9-512:28-520) 10 20 30 40 mKIAA4 GHRPICISVMALGTLFLALAAGLSTASPPNILLIFADDLGY ...:..: : :::: . .::::.:.. ::.:. mFLJ00 AAGLGLGLDSSAGAWFAMAACTAAQQLLLVLSALGL-LAAG--APQPPNIVLLLMDDMGW 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 mKIAA4 GDLGSYGHPSSTTPNLDQLAEGGLRFTDFYVPVSLCTPSRAALLTGRLPVRSGMYP---- :::: :.:: :::::..: :. : .:: ::.::::::::::::.:.:.: mFLJ00 GDLGVNGEPSRETPNLDRMAAEGMLFPSFYSANPLCSPSRAALLTGRLPIRNGFYTTNAH 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 --GVLGPSS-QGGLPLEEVTLAEVLAARGYLTGMAGKWHLGVGPEGAFLPPHQGFHRFLG .. :. .::.: : : :.: :: . ..:::::: :. : : ..:: ...: mFLJ00 ARNAYTPQEIMGGIPNSEHLLPELLKKAGYTNKIVGKWHLGHRPQ--FHPLKHGFDEWFG 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 IPYSHDQGPCQNLTCFPPDIPCKGGCDQGLVPIPLLANLTVEAQPPWLPGLEARYVSFSR : : :: .: . :.:: : .: . .. .. . .: :.. . mFLJ00 SPNCH-FGPYDNKA--KPNIPVYR--DWEMVG-RFYEEFPINRKTGE-ANLTQLYTQEAL 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 DLMADAQRQGRPFFLYYASHHTHYPQFSGQSFTKRSGRGPFGDSLMELDGAVGALMTTVG :.. . . :::::.: :: : .....: : :: .::.. :.: .:: ... . mFLJ00 DFIQTQHARQSPFFLYWAIDATHAPVYASRQFLGTSLRGRYGDAVREIDDSVGKILSLLQ 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 DLGLLEETLVIFTADNGPELMRMSN-GGCSGLLRCGKGTTFEGGVREPALVYWPGHITPG .::. ..:.:.::.::: :. : :: .: . ::: ::::::.::::...:::::. : mFLJ00 NLGISKNTFVFFTSDNGAALISAPNEGGSNGPFLCGKQTTFEGGMREPAIAWWPGHIAAG 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 -VTHELASSLDLLPTLAALTG-APLPNVTLDGVDISPLLLGTGKSPRKSVFFYPPYPDEI :.:.:.: .::. : .:.: : . ..::.:. : .: :. . .:.: . mFLJ00 QVSHQLGSIMDLFTTSLSLAGLKPPSDRVIDGLDLLPTML-KGQMMDRPIFYY-----RG 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 mKIAA4 HGVFAVRNGKYKAHFFTQGSAHSD-TTSDPACHAAN--RLTAH------EPPLLYDLSQD . ..:: :.::::..: .. . : . : . : .:.: : ::.. :..: mFLJ00 NTLMAVTLGQYKAHLWTWTNSWEEFTQGTDFCPGQNVSGVTTHTQEEHTELPLIFHLGRD 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 PGENYNVLESIEGVSPEALQALKHIQLLKAQYDAAMTFGPSQIAKGEDPALQICCQPSCT ::: . . :.. : : .::.. . ... ... :.: : :..: : . mFLJ00 PGERFPL--SFH--SDEYQDALSRTTQVVQEHQKSLV--PGQ------PQLNVCNQAVMN 470 480 490 500 510 510 mKIAA4 PHPVCCHCPGSQS : :. :. mFLJ00 WAPPGCEKLGKCLTPPESVPEKCFWAH 520 530 >>mKIAA1001 ( 512 res) mbj00867 (512 aa) initn: 784 init1: 269 opt: 689 Z-score: 709.2 bits: 140.8 E(): 2.3e-34 Smith-Waterman score: 950; 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