FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0583.ptfa, 582 aa vs ./tmplib.26680 library 1768435 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0336+/-0.00536; mu= 10.0877+/- 0.358 mean_var=143.0035+/-33.387, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1073 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1232 ( 950 res) mbg05359 ( 950) 238 49 2.5e-06 mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 ( 562) 191 41 0.00027 mFLJ00120 ( 1173 res) mtj01003 (1173) 183 40 0.001 mKIAA4052 ( 1046 res) mbg11557 (1046) 179 40 0.0015 >>mKIAA1232 ( 950 res) mbg05359 (950 aa) initn: 586 init1: 127 opt: 238 Z-score: 206.0 bits: 48.8 E(): 2.5e-06 Smith-Waterman score: 639; 25.592% identity (29.779% ungapped) in 633 aa overlap (1-579:349-946) 10 20 mKIAA0 KDRPFVEEPRHVKVQKGSEPLGISIVSG-- . .: : .:.. :: . ::.::..: mKIAA1 VNEVDVSEVVHSRAVEALKEAGPVVRLVVRRRQPPPETIMEVNLLKGPKGLGFSIAGGIG 320 330 340 350 360 370 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 -----EKGGVYVSKVTLGSIAHQAG-LEYGDQLLEFNGINLRSATEQQARLIIGQQCDTI ...:..:. :. :.. : :. ::.:: :. ::... ...: . . : . mKIAA1 NQHIPGDNSIYITKIIEGGAAQKDGRLQIGDRLLAVNNTNLQDVRHEEAVASLKNTSDMV 380 390 400 410 420 430 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 TI-LAQYNP-HIHQLNSHSRSSSHLDPAATPHSTLQGSSAGTPEHPSVIDPLMEQDEGPG . .:. . :.... . .: . : : . ..:: : . .... . : mKIAA1 YLKVAKPGSIHLNDMYAPPDYASTFTALADNHIS-HNSSLG---YLGAVESKVTYPAPPQ 440 450 460 470 480 490 150 160 170 180 190 mKIAA0 TPPAKQSASSTRSVGDTTKKTPDPRIVFIKKSQLDLGVHLCGG-NLHGVFVAEVEDDSPA .::.. : . ... : .:: ....:.. :: .. :: . .:.::. . .:: mKIAA1 VPPTRYSPIPRHMLAEEDF-TREPRKIILHKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPA 500 510 520 530 540 550 200 210 220 230 240 250 mKIAA0 KGPDGLVPGDLILEYGSLDMRSRTVEDVYVEMLKPKDSLRLKVQYRHEEFTRVKGLPGD- : :: :: .....:. : :.. . . . .:. . .::: ::..: .. : mKIAA1 DLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAAAALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDL 560 570 580 590 600 610 260 270 280 290 mKIAA0 ----------------------SFYIRAL--YDRLAE-VEPE--LSFKKDDILYVDDTLP :.:.::: ::: . : :::. :::.: .. mKIAA1 REQMMNSSMSSGSGSLRTSEKRSLYVRALFDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASD 620 630 640 650 660 670 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 QGVFGSWMAWQLDENAQKIQRGQIPSKYVMDQEFSRRLSMSEVKDDNTAKTLSAAARRSF . :.: . .... : : :::: .... ::. . . :.: . :.: mKIAA1 DEW---WQARLVTPHGESEQIGVIPSKKRVEKKERARLKTVKFH----ARTGMIESNRDF 680 690 700 710 720 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 FRRKHKHKRSGSKDGKDLLALDTFSNDSIPLFEDSVSLAYQRVQKVDCTSLRPVLLLGPL : .: : .. .. ::.. :.:. : . . :::..:::. mKIAA1 ---------PGLSD-------DYYGAKNLKGQEDAI-LSYEPVTRQEIHYARPVIILGPM 730 740 750 760 420 430 440 450 mKIAA0 LDVVKEMLVNEAPGKFCRC------PL---EV------MKASQQAIERGVKDCLFVDYKR : :.. :..: : :: : : :: . .:.. .:. ..: :.. . mKIAA1 KDRVNDDLISEFPHKFGSCVPHTTRPRRDNEVDGQDYHFVVSREQMEKDIQDNKFIEAGQ 770 780 790 800 810 820 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 RSGHFDVTTVASIKEITEKNRHCLLDIAPHAIERLHHMHIYPIVIFIRYKSAKHIKEQRD . .. :.. :.. ..:...::.::.. .::.::.. ..:::.:::. :: . . : mKIAA1 FNDNLYGTSIQSVRAVAERGKHCILDVSGNAIKRLQQAQLYPIAIFIKPKSIEALME--- 830 840 850 860 870 880 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 PVYLRDKVTQRHSKEQFETAQKIDQEYSRYFTGVVQGGALSSICTQILAMVSQEQSKVLW . . : ..... :. :.:..::...:::..::: .: : ..: .. ..... .: mKIAA1 ---MNRRQTYEQANKIFDKAMKLEQEFGEYFTAIVQGDSLEEIYNKIKQIIEDQSGHYIW 890 900 910 920 930 940 580 mKIAA0 IPACPP .:. mKIAA1 VPSPEKL 950 >>mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 (562 aa) initn: 314 init1: 125 opt: 191 Z-score: 169.3 bits: 41.2 E(): 0.00027 Smith-Waterman score: 272; 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