FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4143.ptfa, 1016 aa vs ./tmplib.26680 library 1768001 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1511+/-0.00426; mu= 16.6591+/- 0.284 mean_var=101.8145+/-23.581, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 91 in 1/35 Lambda= 0.1271 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0826 ( 1481 res) mbg02580 (1481) 2232 421 7.4e-118 >>mKIAA0826 ( 1481 res) mbg02580 (1481 aa) initn: 3284 init1: 1267 opt: 2232 Z-score: 2208.2 bits: 420.7 E(): 7.4e-118 Smith-Waterman score: 3449; 52.836% identity (56.408% ungapped) in 1058 aa overlap (6-1016:444-1481) 10 20 30 mKIAA4 IQACTQQGLSSKTRSNSSLKES-LTDPSHVSHPTN ..: ..::: :::.:. . : . ..:.: mKIAA0 SNSLRLSLVGDRRGDRRRSNTLDITDGRINHSGSLARTRSLSSLREKGVYDTQPPTEPSN 420 430 440 450 460 470 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 LLATIFWVTVALMESDFEFEYLMALRLLNRLLAHMPLEKAENREKLEKLQAQLKWADFPG 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