# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbh04250.fasta.nr -Q ../query/mFLJ00215.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mFLJ00215, 719 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917182 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0972+/-0.000196; mu= 8.9861+/- 0.011 mean_var=105.2362+/-20.132, 0's: 41 Z-trim: 52 B-trim: 386 in 2/62 Lambda= 0.125024 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81899696|sp|Q8CBC4.1|CA071_MOUSE RecName: Full= ( 711) 4761 869.7 0 gi|109498289|ref|XP_573525.2| PREDICTED: hypotheti ( 786) 3916 717.3 5.2e-204 gi|149040854|gb|EDL94811.1| rCG20445 [Rattus norve ( 575) 3168 582.3 1.7e-163 gi|21706685|gb|AAH34107.1| 9630058J23Rik protein [ ( 422) 2832 521.6 2.3e-145 gi|73961455|ref|XP_854662.1| PREDICTED: hypothetic ( 713) 2722 501.9 3.3e-139 gi|55665885|emb|CAH70030.1| chromosome 1 open read ( 725) 2554 471.6 4.4e-130 gi|152125835|sp|Q6PJW8.2|CA071_HUMAN RecName: Full ( 725) 2551 471.1 6.4e-130 gi|117645482|emb|CAL38207.1| hypothetical protein ( 725) 2525 466.4 1.6e-128 gi|30268569|emb|CAD38922.2| hypothetical protein [ ( 795) 2525 466.4 1.8e-128 gi|34189639|gb|AAH10228.1| C1orf71 protein [Homo s ( 616) 2431 449.4 1.8e-123 gi|55665887|emb|CAH70032.1| chromosome 1 open read ( 616) 2428 448.8 2.7e-123 gi|157426911|ref|NP_001098726.1| hypothetical prot ( 721) 2379 440.1 1.4e-120 gi|194227276|ref|XP_001490558.2| PREDICTED: simila ( 829) 2370 438.5 4.8e-120 gi|18676632|dbj|BAB84968.1| FLJ00215 protein [Homo ( 510) 2075 385.1 3.4e-104 gi|126307162|ref|XP_001377325.1| PREDICTED: hypoth ( 721) 1919 357.1 1.3e-95 gi|224047622|ref|XP_002188369.1| PREDICTED: simila ( 719) 1712 319.8 2.3e-84 gi|118088130|ref|XP_419534.2| PREDICTED: hypotheti ( 721) 1472 276.5 2.5e-71 gi|21750181|dbj|BAC03735.1| unnamed protein produc ( 198) 1143 216.7 6.7e-54 gi|90084315|dbj|BAE90999.1| unnamed protein produc ( 198) 1126 213.6 5.6e-53 gi|109019940|ref|XP_001100619.1| PREDICTED: hypoth ( 366) 1126 213.8 8.9e-53 gi|149641643|ref|XP_001513349.1| PREDICTED: hypoth ( 710) 1082 206.1 3.6e-50 gi|23274136|gb|AAH36200.1| C1orf71 protein [Homo s ( 263) 1026 195.7 1.9e-47 gi|119597561|gb|EAW77155.1| chromosome 1 open read ( 275) 1006 192.1 2.4e-46 gi|26333885|dbj|BAC30660.1| unnamed protein produc ( 201) 876 168.5 2.1e-39 gi|109019948|ref|XP_001100886.1| PREDICTED: hypoth ( 236) 807 156.1 1.3e-35 gi|55665886|emb|CAH70031.1| chromosome 1 open read ( 137) 561 111.6 2e-22 gi|154757560|gb|AAI51722.1| LOC541076 protein [Bos ( 130) 515 103.3 6.1e-20 gi|189530660|ref|XP_697901.3| PREDICTED: similar t ( 572) 465 94.8 9.8e-17 gi|92098178|gb|AAI15061.1| Si:dkeyp-8f4.4 [Danio r ( 398) 401 83.1 2.2e-13 gi|56207911|emb|CAI21364.1| novel protein [Danio r ( 398) 400 82.9 2.5e-13 gi|47217191|emb|CAG11027.1| unnamed protein produc ( 390) 377 78.7 4.4e-12 gi|47222710|emb|CAG00144.1| unnamed protein produc ( 138) 261 57.5 3.9e-06 gi|119597560|gb|EAW77154.1| chromosome 1 open read ( 409) 241 54.2 0.00011 gi|124391752|emb|CAK57288.1| unnamed protein produ ( 910) 236 53.6 0.00038 gi|7106671|emb|CAB76073.1| putative nicotinate-nuc (1212) 221 51.0 0.0031 gi|198151215|gb|EDY74106.1| GA28568 [Drosophila ps (1997) 224 51.7 0.0031 gi|114194814|gb|EAU36514.1| predicted protein [Asp (1181) 218 50.4 0.0044 gi|163772818|gb|EDQ86466.1| predicted protein [Mon (1405) 217 50.3 0.0057 gi|149387684|gb|ABN67997.2| hypothetical protein P (1162) 212 49.4 0.0092 >>gi|81899696|sp|Q8CBC4.1|CA071_MOUSE RecName: Full=Unch (711 aa) initn: 4761 init1: 4761 opt: 4761 Z-score: 4643.3 bits: 869.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 4761; 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