# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbh04236.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1569.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1569, 1415 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920219 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4969+/-0.000186; mu= 13.8055+/- 0.010 mean_var=81.9386+/-16.089, 0's: 28 Z-trim: 29 B-trim: 104 in 1/64 Lambda= 0.141687 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148677674|gb|EDL09621.1| mCG127903, isoform CRA (1194) 5481 1131.1 0 gi|149064540|gb|EDM14743.1| rCG46902 [Rattus norve (3259) 5451 1125.3 0 gi|73962228|ref|XP_537341.2| PREDICTED: hypothetic (2018) 4685 968.6 0 gi|219520718|gb|AAI44482.1| CEP192 protein [Homo s (2132) 4622 955.7 0 gi|219519127|gb|AAI44481.1| CEP192 protein [Homo s (2062) 4621 955.5 0 gi|119621932|gb|EAX01527.1| hCG38274, isoform CRA_ (1725) 4609 953.0 0 gi|18676496|dbj|BAB84900.1| FLJ00145 protein [Homo (1731) 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