FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0736.ptfa, 747 aa vs ./tmplib.26680 library 1768270 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5462+/-0.00468; mu= 10.9712+/- 0.313 mean_var=101.6277+/-23.238, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1272 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1054 ( 752 res) mfj42114 ( 752) 2827 530 3.3e-151 mKIAA0735 ( 588 res) mbg06312 ( 588) 2813 527 1.7e-150 >>mKIAA1054 ( 752 res) mfj42114 (752 aa) initn: 3149 init1: 2145 opt: 2827 Z-score: 2807.0 bits: 530.1 E(): 3.3e-151 Smith-Waterman score: 3182; 63.108% identity (64.325% ungapped) in 740 aa overlap (7-746:26-751) 10 20 30 40 mKIAA0 SAPSPIMEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLD ::....::.....:::::::::::...::: ...: mKIAA1 CCCSRAAEHSPWTLPCHTLPISRDKMEDSYKDRTSLMKGAKDIAKEVKKQTVKKVNQAVD 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 RVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDPCPCGRLLPRRRGQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEG :.::::..::::::..:.:::: : :. . ..:: .::.:::::::.:::::: mKIAA1 RAQDEYTQRSYSRFQDEEDDDDYYPPGETYSGEVNDDE----GSSEATEGHDEEDEIYEG 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 EYQGIPRAESGGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKDREELAQQYETIL :::::: ...: : .. : : .: : . :..:: :.:::::::: :. mKIAA1 EYQGIPSTNQG-KDSIVSVGQP----KGD----EYKDRRELESERRADEEELAQQYELII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 RECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMM .:::::::::.:.::::.:::::::::::::::::::: :.:. .:..: :: ::::::: mKIAA1 QECGHGRFQWALFFVLGMALMADGVEVFVVGFVLPSAETDLCIPNSGSGWLGSIVYLGMM 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 VGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIV ::::.::::::..::.: ::: .:::. :::.:::::::: :: :::::: ::::.:: : mKIAA1 VGAFFWGGLADKVGRKQSLLICMSVNGFFAFLSSFVQGYGFFLVCRLLSGFGIGGAIPTV 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 FSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVF ::::.: ::.::::::::::::::::::.::.::::::::::::::.::::::::::::: mKIAA1 FSYFAEVLAREKRGEHLSWLCMFWMIGGIYASAMAWAIIPHYGWSFSMGSAYQFHSWRVF 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 VLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTH :.:::.: : .. ::: .::::::.:: ::::::::.:: .:::::::.:.::.::.:.. mKIAA1 VIVCALPCVSSVVALTFMPESPRFLLEVGKHDEAWMILKLIHDTNMRARGQPEKVFTVNK 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 IKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLSCFSPEYRRITLMMMGVWFT ::: .: ::::::.:::::::.: :: . .: .:. ::. :. :. . :::: mKIAA1 IKTPKQIDELIEIESDTGTWYRRCFVRIRTELYGIWLTFMRCFNYPVRENTIKLTIVWFT 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 MSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYAARTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKF .::.::::.:::::.:.:::. .:: :. .. . ..:::.::::: : .: : .: mKIAA1 LSFGYYGLSVWFPDVIKHLQSDEYALLTRNVQKDKYANFSINFTMENQIHTGMEYENGRF 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 IGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLVNSTF .:...:::.:.::.:. : :.:::: ::.:.:::::.:.: :::. :::..:.. : .: mKIAA1 LGVKFKSVTFKDSVFKSCTFDDVTSVNTYFKNCTFIDTLFDNTDFEPYKFIDSEFQNCSF 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 LHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVLSC :::: :: . .:: .:::.:::::::::::::::::::.:::: ::.:: ::: mKIAA1 LHNKTGCQITFDDD-YSAYWIYFVNFLGTLAVLPGNIVSALLMDRIGRLTMLGGSMVLSG 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 VSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLA .::::: ::.::: ::..:::..:..:..::.:::.::::::.:.:.:.::::::::: : mKIAA1 ISCFFLWFGTSESMMIGMLCLYNGLTISAWNSLDVVTVELYPTDRRATGFGFLNALCKAA 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 AVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPETRGQVLQ :::: :: :.:.:::: :::.::..:. :. ..:.::.:: :::. mKIAA1 AVLGNLIFGSLVSITKAIPILLASTVLVCGGLVGLRLPDTRTQVLM 710 720 730 740 750 >>mKIAA0735 ( 588 res) mbg06312 (588 aa) initn: 2817 init1: 2162 opt: 2813 Z-score: 2794.4 bits: 527.4 E(): 1.7e-150 Smith-Waterman score: 2813; 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