FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0854.ptfa, 719 aa vs ./tmplib.26680 library 1768298 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9596+/-0.0056; mu= 0.8639+/- 0.369 mean_var=166.5126+/-40.704, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 153 in 1/35 Lambda= 0.0994 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4149 ( 906 res) mfj00914 ( 906) 822 130 9.6e-31 mKIAA0395 ( 198 res) mbg08208 ( 198) 244 47 2.6e-06 mKIAA1443 ( 564 res) mpg01109 ( 564) 214 43 0.00012 >>mKIAA4149 ( 906 res) mfj00914 (906 aa) initn: 1382 init1: 405 opt: 822 Z-score: 644.3 bits: 130.1 E(): 9.6e-31 Smith-Waterman score: 1472; 38.132% identity (44.144% ungapped) in 771 aa overlap (2-690:144-891) 10 20 30 mKIAA0 TTKKYDSLSDHNSKFHPGETNFKLKLIKRNN ::.::.::.:: :.:::: :::: ..:::: mKIAA4 DLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTKRYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNN 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 mKIAA0 QTVLEQSIEATNH---VVPITASGPGSS-D-NDPGVSVGKTPMTKTGKLKADAKKVPKKP ::..::.:. . : . : : : .. :.:..:::. : : :.. :.. . mKIAA4 QTIFEQTINDLTFDGSFVKEENTEQGESIDVSSSGISISKTPIMKMMKNKVENKRITVHH 180 190 200 210 220 230 90 100 110 120 mKIAA0 DEA-----APENHM----EGTARLVTDTA-EILARLGSVELLQDS--------------L . : :: . : .:. :...: : . .... .. : : mKIAA4 NSAEGTSEEKENGVKASQEENAESVSSSALESNTSTSTINRVHPSPASTVVTPTAVLPGL 240 250 260 270 280 290 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 GHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAA ..:. .:. : ::.::: .:.:. ::.:::.: ..:..:::::::..:.. :.: mKIAA4 AQVITAVSAQQNSNLLPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQ 300 310 320 330 340 350 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 SKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLTPTKVS .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::.:.::::...:: ::::.:.... . . mKIAA4 AKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNG 360 370 380 390 400 410 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 QP-ILQTALPCQILGQPSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPE : :::: :::.:::.::::::.. .: .::.:.:::: :. . . .: : : mKIAA4 LPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPVTAPIALTVAGVPNQTNVQKSQVPAAQPA 420 430 440 450 460 470 310 320 330 340 350 mKIAA0 PK-RPHIAQVPEPP---PKVA-NTPLTPASDRKKTKLQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRL .: : :: : :..: .: . . :::: :.:.::.:.:..::: :.:. :: mKIAA4 TDTKPATAAVPSSPSVRPEAALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRL 480 490 500 510 520 530 360 370 380 390 400 mKIAA0 IEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IVHITSESLA------KDQM----AITGTR ...:::...:::::::: :: ::. .:....: : .:. : .... mKIAA4 MKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCLHLNNDSSATIIIDSSDETPEPPAAAASQ 540 550 560 570 580 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 HGRTYHVYPDFAPQKFKEKSQGQLKTLEDSFLKSSFPTQAEVERLRVETKLSRREIDSWF . .... .:::::::::::. ::..:. :::.:: :. ::.:::..:::.:::::.:: mKIAA4 QKQSWNPFPDFAPQKFKEKTAEQLRALQASFLNSSVLTDEEVNRLRAQTKLTRREIDAWF 590 600 610 620 630 640 470 480 490 500 510 mKIAA0 SERRK---LRDSMEQAVLDSMGSGKKGSDAVAPNGALSRLDQLSGAQLAGSLPSPSSAIV .:. : :.: .. ...::.:. .:. :. . . .:. .. mKIAA4 TEKNKTKALKDEKIEVDESNVGSSKEEPGESSPG------DETVAPKSGGT----GKICK 650 660 670 680 690 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 QNQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTLSWLEQY .. ::.:.:.:.:.:::::. .:::.:: ..::.::.:: :: ..: :.:.:.: : mKIAA4 KTPEQLHMLKSAFVRTQWPSAEEYDKLAEESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYY 700 710 720 730 740 750 580 590 600 610 mKIAA0 QRHHMSD------------------DRGRDAVSRKVAKQVA---ESP-----KNGSEAAH : . :. ::: . .:.. . : :.:. . mKIAA4 QSSNSSSLNGLSSLRRRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGGKRMNTWDRVPSLIKFKTGTAILK 760 770 780 790 800 810 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 QYAKDPKALSEEDSEKLVPRMKVGGDPTKDCLAGKPSEATSDRSEGSRDG-QGSEENEES .: : :.:.: ..:: : ..: . ... .: .:.. :. : . ::::: mKIAA4 DYYLKHKFLNEQDLDELVNRSHMGYEQVREWFA--------ERQRRSELGIELFEENEEE 820 830 840 850 860 870 680 690 700 710 mKIAA0 G-IVDFVEVTVGEEDAISEKWGSWSRRVAEGTVERADSDSDSTPAEAGQA .:: : : : :. : mKIAA4 DEVVDDQEEDEEETDD-SDTWEPPRHVKRKLSKSDD 880 890 900 >>mKIAA0395 ( 198 res) mbg08208 (198 aa) initn: 353 init1: 234 opt: 244 Z-score: 205.8 bits: 46.8 E(): 2.6e-06 Smith-Waterman score: 298; 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