FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1402.ptfa, 804 aa vs ./tmplib.26680 library 1768213 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6374+/-0.00515; mu= 20.3168+/- 0.346 mean_var=122.9368+/-28.169, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1157 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0990 ( 821 res) mpg00916 ( 821) 468 90 1.4e-18 mKIAA4168 ( 887 res) mfj49300 ( 887) 442 85 3e-17 >>mKIAA0990 ( 821 res) mpg00916 (821 aa) initn: 412 init1: 155 opt: 468 Z-score: 425.7 bits: 89.7 E(): 1.4e-18 Smith-Waterman score: 680; 25.864% identity (29.931% ungapped) in 839 aa overlap (26-798:14-804) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 LRVLWVKPWATAGLWPINLLILETVPLGRPVSGPATMRLSSLLALLRPVLPLILGLSLGC : :: .: :. . :..: : :.::. :. mKIAA0 GRAEPAAGTAGQRPGGRRGAGMAARGRRAWLSML---LGLVLGFVLAS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 mKIAA1 SLSLLRVSWIQ--GEGEDPCVEAVGKPGGPQNPDSKNGLDQGDEDFRPRIVPYYRDPNKP : : :.: .. : . : :. .:: . :. : .:: .. : .. mKIAA0 RLVLPRASELKRVGPRRRPSPEGC-RPG---QEASQPGGARGDAR-GAQLWPQ----GSA 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 YKKVLRTRYIQTELGSRERLLVAVLTSRATLSTLAVAVNRTVAHHFPRLLYFTGQRGARA . : : : . :.:.:.:.. :.: :::. :: .. .: . : ...:. . mKIAA0 AEGVPRDRNF---------LFVGVMTAQKYLQTRAVAAYRTWSKTIPGKVEFFSSEGSDT 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 PAGMQVVS-HG--DERPAWLMS-ETLRHLHTHFGADYDWFFIMQDDTYVQAPRLAALAGH . :: .: : : : :...: :. :.::. .::.:... :: .. mKIAA0 SIPIPVVPLRGVDDSYPPQKKSFMMLKYMHDHYLDKYEWFMRADDDVYIKGDRLESFLRS 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 mKIAA1 LSINQDLYLGHAEEFIGTGEQA---------RYCHGGFGYLLSRSLLLRLRPHLDGCRGD :. .. :.::.. .:: :. .: :: : .::: .: :. ::. : . mKIAA0 LNSSEPLFLGQTG--LGTTEEMGKLALEPGENFCMGGPGVILSREVLRRMAPHIGKCLRE 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 ILSARPDEWLGRCLIDTLGIGCVSQHQGQQ--YRSFELAKNRDPEKEESPAFLSAFAVHP . ... : .:::. :. :: ... :: :...: :. . .: . :...:: mKIAA0 MYTTHEDVEVGRCVRRFAGVQCVWSYEMQQLFYENYEQNKKGYIRDLHSSKIHRAITLHP 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 VPEGTLMYRLHKRFSALELERAYSEIEQLQAQIRNLTVLTPEGEAGLSWPVGLPAPFT-- . .::::. . . .. . . ::. .: .. . . .:.: : mKIAA0 NKNPPYQYRLHSYMLSRKIAELRHRTIQLHREIVLMSKYSSTEIQKEDLQLGIPPSFMRF 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 mKIAA1 -PHSRFEVLGWDYFTEQHTFACADGAP-KCPLQGASRADVGDAVDTALEQLNRRYQPRLR ..: :.: :...: .. .. .:: : . ...:.: . : : ..:..: . : : mKIAA0 QARQREEILEWEFLTGKYLYSATDGQPPRRGMDSAQREALDDIVMQVMEMINANAKTRGR 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 FRK-QRLLNGYRRFDPARGMEYTLDLLLEAVTQRGHRRSLA--RRVSLLRPLSRVEILPM . ... :::: .: : :: ::::: ..:.. .. :.. : . .:..... mKIAA0 IIDFKEIQYGYRRVNPMYGAEYILDLLLLYKKHKGKKMTVPVRRHAYLQQTFSKMQFVEH 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 mKIAA1 PYVTE---ATRVQL---VLPLLVAEAPAALAF-LEAFAASVLEPREHALLTLLLVYGPRE . : :.. : .: .:: : . . ::.:. . :. : mKIAA0 EELDAQELADRINQDSGSLSFLSNSLKKLVAFQLPGSKTEHKEPKEKKINILI----PLS 510 520 530 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 GR--------GGPD-----PFLGVK--------------AAAAELER----RYPGARLAW :: :. . : :.:: : .:: : .:: : . mKIAA0 GRFDMFVRFMGNFEKTCLIPNLNVKLVILLFNSDSNPDKAKQVELMRDYRVKYPKADMQV 570 580 590 600 610 620 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 LAVRAEAPSQVRLMDVISKKHPVDTLFFLTTVWTRPGSEVLNRCRMNAISGWQAFFPVHF : : . . :.. ..: :.. ..:.:. : .: :.::: :.. : : .::. : mKIAA0 LPVSG-GFSRALALEVGSSQFNNESLLFFCDVDLVFTAEFLQRCRANTVLGQQIYFPIIF 630 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 QEFNPALS-PQRSPPGVPGADPPSPGVDPSRGAPVGGRFDRQASAEGCFYNADYLAARAR ....: . . : : . : . : . :.:..: . : mKIAA0 SQYDPKIVYSGKVPSDNHFAFTQKTGFWRNYGFGIT-----------CIYKGDLV----R 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 LAG-ELAGQEEEEALEGLEVMDVFLRF--SGLHLFRAVEPGLVQKFSLRDCSPRLSEELY ..: ... : ::: .:.: . .::. ::. : :.:. :.: :. . : mKIAA0 VGGFDVSIQGW-----GLEDVDLFNKVVQAGLKTFRSQEVGVVHIHHPVVCDPNLDPKQY 730 740 750 760 770 780 780 790 800 mKIAA1 HRCRLSNLEGLGARTQLAMALFEQEQANST . : :. .:. ::: .:.. mKIAA0 KMCLGSKASTFGSTQQLAEMWLEKNDPSYSKGGSHGSARTA 790 800 810 820 >>mKIAA4168 ( 887 res) mfj49300 (887 aa) initn: 488 init1: 147 opt: 442 Z-score: 401.9 bits: 85.4 E(): 3e-17 Smith-Waterman score: 709; 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