FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1930.ptfa, 1262 aa vs ./tmplib.26680 library 1767755 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5269+/-0.00888; mu= -18.4935+/- 0.585 mean_var=543.5065+/-131.365, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0550 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0386 ( 1135 res) mbg08552 (1135) 1411 128 1.1e-29 >>mKIAA0386 ( 1135 res) mbg08552 (1135 aa) initn: 2040 init1: 889 opt: 1411 Z-score: 625.4 bits: 127.7 E(): 1.1e-29 Smith-Waterman score: 1780; 34.217% identity (42.955% ungapped) in 1283 aa overlap (9-1243:46-1115) 10 20 30 mKIAA1 PAAATAAAAARAGRATPR--VPTARGPCSPAQPWS--- :::.: .:: .: . .: mKIAA0 RALGPRLLPSDLSLLAGRNEHRCPRSRRCTAARGGAWVPRWYMPPGTKRLRALGAFSAGL 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 PARTHSMMSLSVRPQRRLLSARVSRSQSFAGVLGSHERGPRSFTVFSPPGPPRKPLVLSR :.: .: .. . . ::::::: : .:: : . . . .:: .. mKIAA0 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