FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0769.ptfa, 769 aa vs ./tmplib.26680 library 1768248 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3969+/-0.00762; mu= -4.8647+/- 0.506 mean_var=309.3169+/-74.891, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0729 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00007 ( 687 res) mfj33016 ( 687) 672 85 3.9e-17 >>mFLJ00007 ( 687 res) mfj33016 (687 aa) initn: 1364 init1: 288 opt: 672 Z-score: 400.0 bits: 84.6 E(): 3.9e-17 Smith-Waterman score: 1434; 36.521% identity (41.106% ungapped) in 753 aa overlap (7-752:1-676) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 CPFSIMQPPPRKVKVTQELRNIQGEQMTKLQAKHQAECDLLEDMRTFSQKKAAIEREYAQ :::::::: .::.. ::.. ::...: : :::::.:..:...:::::::.: mFLJ00 QPPPRKVKPAQEVKLRFLEQLSILQTRQQREADLLEDIRSYSKQRAAIEREYGQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 GIQKLASQYLKRDWPGIKTDDRNDYRSMYPVWKSFLEGTMQVAQSRINICENYKNFISEP ..::::. .:::. : .. . : :... .:. .:..:. .:.:.. . :... . mFLJ00 ALQKLAGPFLKRE--GQRSGE-ADSRTVFGAWRCLLDATVAGGQTRLQASDRYRDLAGGT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 mKIAA0 ARAVRSLKEQQLKRCVDQLTKIQTELQETVKDLVKGKKKYFETEQMAHAVREKA-DIEAK .: : ::: :.. ...: . :.:. ..:..: ...: : . ... ..::: :..:. mFLJ00 GR---SAKEQVLRKGTESLQQAQAEVLQSVRELSRSRKLYGQRQRVWALAQEKAADVQAR 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 ---SKLSLFQSRISLQKASVKLKARRSECNTKATHARNDYLLTLAAANAHQDRYYQTDLV : ..:.:: :::: :.::.:. .. . . :::.:::.:.:.::: .::: .: mFLJ00 LNRSDHGIFHSRTSLQKLSTKLSAQSAQYSQQLRAARNEYLLNLVATNAHLAHYYQEELP 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 NIMKALDGNVYDHLKDYLIAFSRTELETCQAIQNTFQFLLENSSKVVRDYNLQLFLQENA ..:.: ... ..:.: : ...::::. . : . . . .:.: . ...:::: . mFLJ00 ALLKVLVSELSEYLRDPLTLLGHTELEAAEMILEHARHGGKATSQVNWEQDVKLFLQGPG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 VFHKPQPFQFQPCDSDTSLKAAQLVDIELSPVSALRMTIAESRQLESETGTTEEHSLNKE :: : :::: .: :. .: . : . : .:.:: mFLJ00 VFSPTPPQQFQPAGAD------QVCGLEWGA-----------------GGMAGESGLEKE 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 ARKWATRVAREHKNIVHQQRVLNELECHGVALSEQSRAELEQKIDEARESIRKAEIIKLK ...:..:.::..: : .:::..:: . . .::...:.::.::.:.. ..: mFLJ00 VQRWTSRAARDYKIQHHGHRVLQRLEQRRQQAPGREAPGVEQRLQEVRENIRRAQVSQVK 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 AEARLDLLKQIGVSVDTWLKSAMNQVMEELENERWARPPAVTSNGTLHSLNADAEREEGE . ::: ::.. :..:. ::: ::.:...:.:.:: : :. : ::: . . mFLJ00 GAARLALLQEAGLDVQRWLKPAMTQAQDEVEQERRLSE-ARLSQRDLSPTAEDAELSDFD 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 EFEDNMDVFDDSSSSPSGTLRNYPLTCKVVYSYKASQPDELTIEEHEVLEVIEDGDMEDW : :. ..:.. . :. . : : .::..:.:.. ::::: : : :::::.:: ..: mFLJ00 ECEEAGELFEEPAP-PALATRPLPCPAHVVFGYQAGREDELTITEGEWLEVIEEGDADEW 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 VKARNKVGQVGYVPEKYLQFPTSNSLLSMLQSLAALDSRSHTSSNSTEAELVSGSLNGDA :::::. :..:.:::.::.:: ::. .: ..:. : .:. mFLJ00 VKARNQHGEAGFVPERYLNFPD----LSLPESCHGIDNPS----------------GGEP 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 SVCFVKALYDYEGQTDDELSFPEGAIIRILNKENQD--DDGFWEGEFSGRIGVFPSVLVE .. ...:::.: ::...::::::::.::.: . :: :::::.:::.:..:::::.::: mFLJ00 TAFLARALYSYTGQSEEELSFPEGALIRLLPRA-QDGVDDGFWRGEFGGHVGVFPSLLVE 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 ELSASENGDTPWTREIQISPSPKPHTSLPPLPLYDQPPSSPYPSPDKRSSQFFPRSPSAN :: . : . :. :::.: . :: : :. : :: mFLJ00 ELLGPP-GPPELSDPEQMLPSPSPPSFSPPAPTCALDGSTA------------PALPS-- 610 620 630 640 720 730 740 750 760 mKIAA0 ENSLHAESPGFSQASRQTP-DTSYGKLRPVRAAPPPPTQNHRRTTEKMEDVEITLV .. : . :: : : .:::.: ::::.. mFLJ00 DKVL--DCPG--------PLDMMVPRLRPMRPPPPPPAKAPDPGHPDPLT 650 660 670 680 769 residues in 1 query sequences 1768248 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:28:16 2006 done: Mon Mar 27 10:28:17 2006 Scan time: 0.870 Display time: 0.050 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]