FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0422.ptfa, 391 aa vs ./tmplib.26680 library 1768626 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.4960+/-0.00425; mu= 20.0838+/- 0.286 mean_var=72.6050+/-15.403, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1505 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4070 ( 645 res) mbg13014 ( 645) 1030 233 3.5e-62 mKIAA1060 ( 1115 res) mbh01281 (1115) 1011 229 8.2e-61 mKIAA0520 ( 1334 res) mbg16592 (1334) 658 153 1.1e-37 mKIAA0511 ( 1150 res) mbg03508 (1150) 551 130 9.8e-31 mKIAA4084 ( 626 res) mfj00113 ( 626) 314 78 2.2e-15 mKIAA4004 ( 422 res) mfj25198 ( 422) 127 37 0.003 >>mKIAA4070 ( 645 res) mbg13014 (645 aa) initn: 1012 init1: 548 opt: 1030 Z-score: 1208.7 bits: 233.2 E(): 3.5e-62 Smith-Waterman score: 1030; 46.438% identity (48.485% ungapped) in 379 aa overlap (21-387:208-582) 10 20 30 40 mKIAA0 RWWKGGIVRQGSRALPALHALVFAVTQRCLC-CPPSPQYFVGNVLLSLLA :...:.: :. : : .: : .:: mKIAA4 TLYLHITRVQCFPGCLTIQIRTALCVFIVVLIYSVAQGCVVGCLPWAWSSQSNSSLVVLA 180 190 200 210 220 230 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 SSVFLHISSIGKLAMTFILGFTYLVLLLLGP-PAAIF---DNYDLLLGVHGLASSN---E .. . :. . :. :.: : ::: .. .. . ::..: mKIAA4 AGGRRTVLP----ALPCESAHHALLCCLVGTLPLAIFLRVSSLPKMILLSGLTTSYILVL 240 250 260 270 280 290 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 TFDGLDCPAVGRVALKYMTPVI-LLVFALALYLHAQQVESTARLDFLWKLQATGEKEEME ..: . : .. . . :.. .:.:. .: :::.::. :::.:: :: :...:: mKIAA4 ELSGYTKVGGGALSGRSYEPIMAILLFSCTLALHARQVDVRLRLDYLWAAQAEEERDDME 300 310 320 330 340 350 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 ELQAYNRRLLHNILPKDVAAHFLARERRNDELYYQSCECVAVMFASIANFSEFYVELEAN ... :.:.: :.:: :: ::: . :: .::::: :.:::::: ::..::.::..: mKIAA4 RVKLDNKRILFNLLPAHVAQHFLMSNPRNMDLYYQSYSQVGVMFASIPNFNDFYIELDGN 360 370 380 390 400 410 230 240 250 260 270 mKIAA0 NEGVECLRLLNEIIADFDEIISEERFRQLEKIKTIGSTYMAASGLNASTYDQVGRS---H : :::::::::::::::::..... ...:::::::::::::: :: .. .. .: : mKIAA4 NMGVECLRLLNEIIADFDELMDKDFYKDLEKIKTIGSTYMAAVGLAPTAGTRAKKSISSH 420 430 440 450 460 470 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 ITALADYAMRLMEQMKHINEHSFNNFQMKIGLNMGPVVAGVIGARKPQYDIWGNTVNVSS . .:::.:. ... . .:: .:.:.: ...:.:.:::::::::::.::::::::::::.: mKIAA4 LCTLADFAIDMFDVLDEINYQSYNDFVLRVGINVGPVVAGVIGARRPQYDIWGNTVNVAS 480 490 500 510 520 530 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 RMDSTGVPDRIQVTTDLYQVLAAKGYQLECRGVVKVKGKGEMTTYFLNGGPSS ::::::: ::::: .....: .::. ::: :.::::::: ::::.: mKIAA4 RMDSTGVQGRIQVTEEVHRLLKRCSYQFVCRGKVSVKGKGEMLTYFLEGRTDGNSSHGRT 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 FRLERRMCPYGRGGGQARRPPLCPAAGPPVRPGLPPAPTSQYLSSTAAGKEA 600 610 620 630 640 >>mKIAA1060 ( 1115 res) mbh01281 (1115 aa) initn: 1036 init1: 526 opt: 1011 Z-score: 1184.1 bits: 229.4 E(): 8.2e-61 Smith-Waterman score: 1041; 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