FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0088.ptfa, 775 aa vs ./tmplib.26680 library 1768242 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6521+/-0.00419; mu= 11.3874+/- 0.279 mean_var=100.5681+/-23.618, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1279 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00088 ( 904 res) mfj58158 ( 904) 2938 553 4.7e-158 mKIAA1161 ( 718 res) mbh03358 ( 718) 238 55 3.7e-08 >>mFLJ00088 ( 904 res) mfj58158 (904 aa) initn: 2889 init1: 2831 opt: 2938 Z-score: 2930.0 bits: 553.1 E(): 4.7e-158 Smith-Waterman score: 2938; 55.764% identity (55.989% ungapped) in 746 aa overlap (31-774:159-903) 10 20 30 40 50 mKIAA0 PLVPAPSGLEQTALLPSRQESKDPAEGNGAQPEATPGDG-DKPEETQEKAEKDEPGAWEE . .:: :.: . : :... ..: : ::: mFLJ00 FKIDLLSKNEAVISINSLGQLYFEHLQVPHKQRATKGNGQNTPAATSQENQEDL-GLWEE 130 140 150 160 170 180 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 TFKTHSDSKPYGPTSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADSLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYE : : : ::.:::::::: :.::.::::.::.: .:: :. :. ::::::::. :. mFLJ00 KFGKFVDVKANGPSSVGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTRDGDAYRLYNLDVYGYQ 190 200 210 220 230 240 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 LNNPMALYGSVPVLLAHSFHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMLDYLQGSGET ... :..::::: ::::. : .:::::::.:: :.:... : . . .: . mFLJ00 VHDKMGIYGSVPYLLAHKQGRTVGIFWLNASETLVEINTEPAVEYTMTQMGPAAAKQKVR 250 260 270 280 290 300 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 PQTDIRWMSESGIIDVFLMLGPSVFDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEAD .::..::::::::::::. ::. :::.::. .:::::.:::::::::: ::::.:: : mFLJ00 CRTDVHWMSESGIIDVFLLTGPTPADVFKQYSYITGTQAMPPLFSLGYHQCRWNYEDEQD 310 320 330 340 350 360 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 VLEVDQGFDDHNMPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPTRFPQPLNMLEHLASKRRKLVAIVD : :: :::.:..: :::::::::.. :.::::: :: .: : : : ::.::::.: : mFLJ00 VKAVDAGFDEHDIPYDVIWLDIEHTEDKKYFTWDKKRFANPKRMQELLRSKKRKLVVISD 370 380 390 400 410 420 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 PHIKVDSGYRVHEELRNHGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSASYPDFTNPRMRAWWSNMFSFD :::::: : :. . ...:..::. .:.:.:: :::: .:: :::::..: :.:..:.: mFLJ00 PHIKVDPDYTVYAQAKEQGFFVKNPEGGDFEGVCWPGLSSYLDFTNPKVREWYSSLFAFP 430 440 450 460 470 480 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 NYEGSAPNLYVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAVHYGGWEHRDIHNIYGLYVHMATADGLI :.::. :..:::::::::: :::.:: :.::::: ::::..:::::.: .::::.::: mFLJ00 VYQGSTDILFLWNDMNEPSVFRGPELTMHKSAVHYGDWEHRELHNIYGFYQQMATAEGLI 490 500 510 520 530 540 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 QRSGGIERPFVLSRAFFSGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLALVGLSFCGADV ::: : ::::::::.::.:::..:::::::: :::..::::::: :.:.. :.::::::: mFLJ00 QRSKGKERPFVLSRSFFAGSQKYGAVWTGDNKAEWSYLKISIPMLLTLSVSGISFCGADV 550 560 570 580 590 600 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 GGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLASQYQDAIRDALFQRYSLL :::. ::: :::::::: ::::::::.:: ..: ::::::.. .: . ::.:. :::.:: mFLJ00 GGFIGNPEAELLVRWYQAGAYQPFFRGHATMNTKRREPWLFGEEYTQLIREAIRQRYALL 610 620 630 640 650 660 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 PFWYTLFYQAHKEGFPVMRPLWVQYPEDMSTFSIEDQFMLGDALLIHPVSDAGAHGVQVY :. :.:::.:: . ::::::::.::.:. ::..::..:::.:::.:::.: . ..:. mFLJ00 PYLYSLFYHAHVSSQPVMRPLWVEYPDDLETFAVEDEYMLGSALLVHPVTDPQTATIDVF 670 680 690 700 710 720 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 LPGQEEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSDCMKDDPI :::..::::: ... .: :. .::::..::::::::..:: : :. : :.: mFLJ00 LPGSDEVWYDSKTFAYWKGGCTVKIPVTLDTIPVFQRGGSVVPVKTTVGTSTGWMADSPY 730 740 750 760 770 780 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 TLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQTRHEFLLRRFSFSGSTLVSSSADPKGHLETPIW : :::::::.: :::.:::::.:.: . .:: :.: : .:.:.. :. ::: . mFLJ00 GLRVALSPQGSAVGELYLDDGHSFQYLHQDQFLYRKFLFCSSVLTNRCANEKGHYPSKCI 790 800 810 820 830 840 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 IERVVIMG-AGKPAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLILRKPGVSVASDWSIHLR .:.....: ::..:. . . . . .: . :::.: :.: .. :. :: ... mFLJ00 VEQILVLGLKKKPSSVTTHLSDGRAQPAAFTYCAETSTLRLEKLSLRVGEDWEVRVG 850 860 870 880 890 900 >>mKIAA1161 ( 718 res) mbh03358 (718 aa) initn: 237 init1: 155 opt: 238 Z-score: 238.9 bits: 54.9 E(): 3.7e-08 Smith-Waterman score: 313; 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