FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4064.ptfa, 994 aa vs ./tmplib.26680 library 1768023 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1811+/-0.0066; mu= 3.4360+/- 0.439 mean_var=235.6441+/-56.887, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0836 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0387 ( 832 res) mid37027 ( 832) 1062 141 4.7e-34 mKIAA4044 ( 1352 res) mpg00593 (1352) 613 88 1.3e-17 mKIAA0283 ( 1054 res) mic41033 (1054) 353 56 2.9e-08 mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 ( 801) 329 53 1.8e-07 >>mKIAA0387 ( 832 res) mid37027 (832 aa) initn: 1182 init1: 576 opt: 1062 Z-score: 703.8 bits: 141.5 E(): 4.7e-34 Smith-Waterman score: 1237; 34.684% identity (38.340% ungapped) in 839 aa overlap (11-794:12-825) 10 20 30 40 50 mKIAA4 RDSGRRESSEPGRMRRPRRPGGSGGSGGSGGLRLLVCLLLLSGRPGGCSA-ISAHG--- :.: :.:... : : ::. ::: : . : ::.: mKIAA0 RRLAKSLSVLAPARPWTERQPAAGMGPP----LPLLLLLLLPPPLPRALPAPASARGRQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 -----CLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQAGVGQARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQG :::. ::. ::.:..::.::.:: . .: .: .:. .:..: : mKIAA0 PGRLGCLFEDGLCGSLETCVNDGVFGRCQKVPVMDTYRYEVPPGALLHLKVTLQKLSRTG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 LSWHDDLTQHVISQEMERIPR--LRPPEPHPRDRS-----------------GLVP--RK ..:.:: ::.::.::. .:. : : :: .:. :. mKIAA0 FTWQDDYTQRVIAQELANLPKAYLWHGEASGPARSLQQNADNEKWFSLEREVALAKTLRR 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 PGPAGELLTQGNPTGSSPAAQGFPRPAGGGDGAGAG--SPLSSLQAELLPPLL-----EH : :::.: ... . ::: : :.. . . .. .: :: .. mKIAA0 YLPYLELLSQTPTANAHSRIDHETRPAKGEDSSPENILTYVAHTSALTYPPATRAKYPDN 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 mKIAA4 LLMPP---QPPHPALTYEPALLQPYLFHQFGSRDGSR-GSESSSGVVGVGHLSKAEGPAL :: : :: . . . . . :. .:. ..: .:.. . : : :..: mKIAA0 LLRPFSRLQPDELSPKVDGDIDKQKLIAALGAYTAQRLPGENDPEPRYLVHGS-ARAPRP 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 mKIAA4 FSRSASKAILGTHSGHSFGDLTGPSPAQLFQDSGLLYMAQELPVP--GRARAPRLPENGG :: .: . : . : . . :.: : : . :. : : . . .: mKIAA0 FSATALSQRWPPPPGDA-KDSPSMDDDTLLQ-SLLKDLQQNSEVDRLGPLKEEKADSVAG 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 NRAEDSSEGHEEEVLGGRGEKSPP--QAAQPELSLQ--RLTAVLAGYGVELRQLTPEQFS : .:: .: ::: .. : :. :: :: ::. : :. .:. :.. mKIAA0 AIQSDPAEGSQES--HGRGAEGQPREQTDAPETMLQDHRLSEVDDPVYKEVNRLS-FQLG 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 mKIAA4 TLLTLL--QLLPKGTGRNLEGAVNVGGADVKKTIQQMQRGDPAEALPPTPSLPG--YLTA :: :::.: :: . ..::. : : :.: : .. . mKIAA0 DLLKDYGSPLLPEGPL--LEKSSR---EEIKKSEQ------PEEVLSSEEETAGVEHVRS 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 SPASSEVQQVLSPGFPEPPHTPSPLGSSSV-LLEKKSPL---GQSQPTVVGRPSARPSAE :... . . :.: . . . . . : : . : .:. :. . ..:: : mKIAA0 RTYSKDLFERKPNSEPQPRRLEDQFQNRAPELWEDEESLKLAAQGPPSGGLQLEVQPSEE 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 EYGYIVTDQKPLSLVAGVRLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPAVTFRIRHNEQNLSLAD . :::.: ..::: : .:.. .:. ... :. : .:.:.::::::.. : ::.. :: mKIAA0 QQGYILTGNNPLSPEKGKQLMDQVAHILRVPSSFFADIKVLGPAVTFKVSANIQNMTTAD 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 VTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAEVLPRQAHGISPMRSVLLTLVALAGVAG : . :. :..:: ::: :::.:. . . ..::.: . . . .:::....: . : mKIAA0 VIKAAADNKDQLEKATGLTILQSGIRPKGKL-KLLPHQEEQEDSTKFILLTFLSIACILG 580 590 600 610 620 630 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 LLVALAVALCMRHHSRQRDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGQP .:.: ..: :.::.:. . :..:..:: . . .:.: ::.::::.:: . .:.:: : mKIAA0 VLLASSLAYCLRHNSHYKLKDKLSGLGADPS-ADATEAYQELCRQRMAIRPQ-DRSEG-P 640 650 660 670 680 690 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 EPSRVSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRL . ::..::::::::. . :::..::: :: :::.:.::::::::::::::::::.:..:: mKIAA0 HTSRINSVSSQFSDGPMPSPSARSSTSSWSEEPVQSNMDISTGHMILAYMEDHLKNKNRL 700 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 AKEWQALCAYQAEPNTCAAAQDESNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASP :::.::::::::::. .:: : : ::: : :::.:: :: ..: . :::::::: mKIAA0 EKEWEALCAYQAEPNSSLVAQREENAPKNRSLAVLTYDHSRILLKSQNSHGSSDYINASP 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 mKIAA4 IIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGS :..::: :. mKIAA0 IMDHDPPHPSAMNKTFE 820 830 >>mKIAA4044 ( 1352 res) mpg00593 (1352 aa) initn: 545 init1: 205 opt: 613 Z-score: 408.7 bits: 87.6 E(): 1.3e-17 Smith-Waterman score: 655; 26.797% identity (29.818% ungapped) in 612 aa overlap (424-983:452-1053) 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 NVGGADVKKTIQQMQRGDPAEALPPTPSLPGYLTASPASSEVQQVLSPGFPEPPHT---P : .. : .. . :: :: : mKIAA4 AVSSFDPEIDLSNQSGRVSKLGNETHFLFFGLYPGTTYSFTIRASTAKGFG-PPATNQFT 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 mKIAA4 SPLGSSSV-LLEKKSPLGQSQPTV--VGRPSARPSAEE--YGYIVTDQKPLSLVAGVRLL . ... :. : ..::.:.. :: . .:. .: : .: ...: ...: mKIAA4 TKISAPSMPAYEFETPLNQTDNTVTVMLKPAQSRGAPVSVYQIVVEEERPRRTKKTTEIL 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 EILAEHVHMSSGSFIN----ISVVGPAVTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTG . .:....:..: ... :: ... : ....: : .. : . . mKIAA4 KCYPVPIHFQNASILNSQYYFAAEFPADSLQA---AQPFTIGDNKTYNGYWNTPLLPHKS 550 560 570 580 590 570 580 590 600 mKIAA4 LQILQTGV----GQRE-EAAEVLPRQAHGISPM---RSVLLTLVALAGV-AGLL----VA .: .. :. . . ..: . : .:. .. : .::: ::.: . mKIAA4 YRIYYQAASRANGETKIDCVRVATKGAVTPKPVPEPEKQTDHTVKIAGVIAGILLFVIIF 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 mKIAA4 LAVALCMRHHS-RQRDKERLAALGPEGA----HGDTTFEYQDL-CRQ---HMATKSLFNR :.:.: :.... .. :: ... : . : .. : : . :.:..: .: mKIAA4 LGVVLVMKKRKLAKKRKETMSSTRQEMTVMVNSMDKSYAEQGTNCDEAFSFMGTHNLNGR 660 670 680 690 700 710 660 670 680 690 700 710 mKIAA4 AEGQPE--PSRVSSVS-----SQFSDAAQ--ASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMI . ..: .....: : . : .. :: .: . : .. :.. .::.. mKIAA4 SVSSPSSFTMKTNTLSTSVPNSYYPDETHTMASDTSSLAQPHTYKKREAADVPYQTGQLH 720 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 mKIAA4 LAY-MEDHLRNRDRLA--------KEWQALCAYQAEPNTCAAAQDESNIKKNRHPDFLPY : . : :.. .. .:.... :. : .: .::. .: ::. ... : mKIAA4 PAIRVADLLQHITQMKCAEGYGFKEEYESFFEGQSAPWD-SAKKDENRMK-NRYGNIIAY 780 790 800 810 820 830 770 780 790 800 810 820 mKIAA4 DHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVI ::.:..:.. . . :::::.. :. : :::::::...:: :::.:::. . . : mKIAA4 DHSRVRLQMLEGDNNSDYINGN-YIDGYHRPNHYIATQGPMQETIYDFWRMVWHENTASI 840 850 860 870 880 890 830 840 850 860 870 880 mKIAA4 VMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGSSLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTQETRT .:.: ::: : .: .::::. . .:. .:.:.. .. : ...:.: ... .: : mKIAA4 IMVTNLVEVGRVKCCKYWPDD-TEIYKDIKVTLIDTELLAE-YVIRTFAVEKRGIHEIRE 900 910 920 930 940 950 890 900 910 920 930 940 mKIAA4 LTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVL . :::: .:: .:.: . :: : :.:.. . :..:::: :::::: .:.::..: mKIAA4 IRQFHFTGWPDHGVPYHATGLLGFVRQVKSKSPPNAGPLVVHCSAGAGRTGCFIVIDIML 960 970 980 990 1000 1010 950 960 970 980 990 mKIAA4 NRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ . ::. .:: ....:..: ..:....:. : :. : mKIAA4 D-MAEREGVVDIYNCVRELRSRRVNMVQTEEQYVFIHDAILEACLCGDTSIPASQVRSLY 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA4 YDMNKLDPQTNSSQIKEEFRTLNMVTPTLRVEDCSIALLPRNHEKNRCMDILPPDRCLPF 1080 1090 1100 1110 1120 1130 >>mKIAA0283 ( 1054 res) mic41033 (1054 aa) initn: 565 init1: 195 opt: 353 Z-score: 240.6 bits: 56.1 E(): 2.9e-08 Smith-Waterman score: 586; 31.081% identity (34.414% ungapped) in 444 aa overlap (581-993:334-765) 560 570 580 590 600 mKIAA4 LVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAEVLPRQAHGISPMRSVLLTLVALAGV-AGLLVAL .... . : ..: : : .::: ::::. . mKIAA0 SYSIYFQALSKANGETKINCVRLATKGASTQNSNTVEPEKQVDNT-VKMAGVIAGLLMFI 310 320 330 340 350 360 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 AVALCMRHHSRQRDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSL-FNRA-EGQPEPS . : . ..: .:: : : :. . : .: :: :: : mKIAA0 IILLGVMLTIKRR---KLAKKQKETQSGAQR-EMGPVASTDKPTAKLGTNRNDEGFSSSS 370 380 390 400 410 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 R-VSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANM--DISTGHMILAYMEDHLRNRDRL . :.. ... .. .: . . .. :. :.. .. : . .: . .:. . : mKIAA0 QDVNGFNGSRGELSQPTLTIQTHPYRTCD-PVEMSYPRDQFQPAIRVADLLQHITQMKR- 420 430 440 450 460 470 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 AKEWQALCAYQAEPNTCAA----AQDESNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYI .. . :.: :. .: :... : .:::. ... :::.:..: : .. .:::: mKIAA0 GQGYGFKEEYEALPEGQTASWDTAKEDENRNKNRYGNIISYDHSRVRLLVLDGDPHSDYI 480 490 500 510 520 530 790 800 810 820 mKIAA4 NASPII-EHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVE---------- ::. : : :: :::::::...:. :::.:.:. . . :::.: ::: mKIAA0 NANYIDGYHRPRH--YIATQGPMQETVKDFWRMIWQENSASIVMVTNLVEVGRHPAEHTV 540 550 560 570 580 590 830 840 850 860 870 mKIAA4 ----------DGVKQCDRYWPDEGSSLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTQET :. .: :::::. . .: .:.:. . : ...:.: ... .: mKIAA0 GTATLGRAASPGMVKCVRYWPDD-TEVYGDIKVTLIETEPLAE-YVIRTFTVQKKGYHEI 600 610 620 630 640 650 880 890 900 910 920 930 mKIAA4 RTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDM : : ::: ::: .:.: . :: : :.:. .. ::.:::: :::::: .: :: mKIAA0 RELRLFHFTSWPDHGVPCYATGLLGFVRQVKFLNPPEAGPIVVHCSAGAGRTGCFIAIDT 660 670 680 690 700 710 940 950 960 970 980 990 mKIAA4 VLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ .:. ::.. .:: ....: :: .::....:. :. :. : :.: mKIAA0 MLD-MAENEGVVDIFNCVRELRAQRVNLVQTEEQYVFVHDAILEACLCGNTAIPVCEFRS 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 LYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQTLNIVTPRVRPEDCSIGLLPRNHDKNRSMDVLPLDRCL 780 790 800 810 820 830 >>mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 (801 aa) initn: 378 init1: 179 opt: 329 Z-score: 226.5 bits: 53.1 E(): 1.8e-07 Smith-Waterman score: 390; 23.957% identity (27.917% ungapped) in 839 aa overlap (146-913:6-796) 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 DLTQHVISQEMERIPRLRPPEPHPRDRSGLVPRKPGPAGELLTQGN-PTGSSPAAQGFPR :::. : .: ::. :.:.. . :: mKIAA1 GPDEEVPRRQGLLCRLGKQGSYPSGTGTIHLSCPR 10 20 30 180 190 200 210 mKIAA4 ---PAGGGD-GA--------GAGSPLSSLQAELLPPL----LEHLLMPPQP--PHPALTY ::. :. :. . :.: . . ::: : :.. ::.: :.: :. mKIAA1 GRSPAAPGQVGVVFRLHCRLSPGQP-DLWRLALLPCLSLRELKKKAPPPRPTAPKPLLSR 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 mKIAA4 EP------ALLQPYLFHQFGSR--DGSRGSESSSGVVGVGHLSKAEGPALFSRSASKAIL . : : .... : : . :... :.: :: : :.. : mKIAA1 REEGEAVEAGDTPEELRSLPPDMMVGPRLPDPFLGTTAPLHFSP--GP--FPSSTGPATH 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 GTHSGHSFGDLTGPSPAQLFQDSGLLYMAQEL---PVPGRAR----APRL-PENGGNRAE . : .::. ::.: . . :: :.:. . .:: :..: . mKIAA1 YLSGPLPPGTYSGPT--QLMQPRAAVPMAPATVLYPAPAYTSELGLVPRSSPQHGIVSSP 160 170 180 190 200 330 340 350 360 370 mKIAA4 DSSEGHEEEVLGGRGEKSPPQAAQPELSL---------QRLTAVLAGYGVELRQLTPEQ- .. : . :.: ::: . :::.. . . : .... . . :: mKIAA1 YAGVGPPQPVVG-LPSAPPPQLSGPELAMTVRPATTTVDSVQAPISSHTAPRPNPTPALP 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 mKIAA4 ---FSTLLTLLQLLPKGTGRNLEGAVNVGGADVKKTIQQMQRGDPAEALPPTPSL---PG : . . : .:. . . ..: . . .. : . : :. :: mKIAA1 QPCFPVPQPVPQSVPQPQPLPVPYTYSIGTKQPLPAPYTYSIGTKQHLTGPLPQHQFPPG 270 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 YLTASPASSEVQQVLSPGFPEPPHTPSPLGSSSVLLEKKSPLGQSQPTVVGRPSARPSAE :. :. :. . :.: :.: . . . .: .:::: .:. .:. mKIAA1 IPTGFPVPRTGPQAQAQPQPQPQPQPQPQPQPQ---PQPQPQSQSQPQ--PQPQPQPQRP 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 EYGYIVTDQKPLSLVAGVRLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPAVTFRIRHNEQNLSLAD .: : :.:: . .: :. .. .: : . ... . :. mKIAA1 AFGPQPT-QQPLPF-----------QHPHLFPSQAPGILPPPPPTPYHFTPQPGVLGQPP 390 400 410 420 430 550 560 570 580 590 mKIAA4 VTQQAGLV----KSELEAQTG-LQILQTGVGQREEAAEVLPRQAHGISPMRSVLLTLVAL : .. : .. : ..: : . . : . . : :.: .: : .. mKIAA1 PTLHTQLYPGPSQDPLPPHSGALPFPSPGPPHPH------PTLAYGPAPSPRPLGPQATP 440 450 460 470 480 600 610 620 630 640 650 mKIAA4 AGVAGLLVALAVALCMRHHSRQRDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNR ... : : : . :: .. :. : : :. : . mKIAA1 VSIRG--PPPASQPTPSPHLVPSPAPSPGP-GPVPSRPPTAEPPPCLRRGAAAADLLSSS 490 500 510 520 530 540 660 670 680 690 700 mKIAA4 AE-----------GQP--EPSRVSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDIST : ::: .:..:... .. .: . .. : .. : ... mKIAA1 PESQHGGTQPPGGGQPLLQPTKVDAAEGRRPQALRLIEQDPYEHPERLQQ-LQQELEAFR 550 560 570 580 590 600 710 720 730 740 750 760 mKIAA4 GHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCAAAQDESNIKKNRHPDFLPYDHARI :.. : : . .: : ..:. . : :. : :::: : .::: :. mKIAA1 GQLGDAGALDAIW------RELQEAQEHDARGRSIAIARCYS--LKNRHQDVMPYDSNRV 610 620 630 640 650 770 780 790 800 810 820 mKIAA4 KLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTP :. ...:::::: . .: : .:::.:: : :::: :: :. .:::::. mKIAA1 VLR----SGKDDYINASCVEGLSPYCPPLVATQAPLPGTAADFWLMVHEQKVSVIVMLVS 660 670 680 690 700 830 840 850 860 870 880 mKIAA4 LVEDGVKQCDRYWPDE-GSSLYH-VYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTQETRTLTQ .: .. ::.: : :. . : . : : : . : . : . :. . . :.:.. mKIAA1 EAEMEKQKVARYFPTERGQPMVHGALSVALSSIRT-TETHVERVLSLQFRDQSLKRSLVH 710 720 730 740 750 760 890 900 910 920 930 940 mKIAA4 FHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRM .:: .:: : : : :: : ..:. : mKIAA1 LHFPTWPELGLPDSPGNLLRFIQEVHAHYLHQRP 770 780 790 800 994 residues in 1 query sequences 1768023 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:00:48 2006 done: Mon Mar 27 11:00:50 2006 Scan time: 1.060 Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]