# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbh02904.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1707.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1707, 1051 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917227 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4514+/-0.000192; mu= 12.7941+/- 0.011 mean_var=88.3480+/-16.993, 0's: 31 Z-trim: 39 B-trim: 581 in 1/66 Lambda= 0.136451 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81897571|sp|Q8BUH8.1|SENP7_MOUSE RecName: Full= (1037) 6899 1369.0 0 gi|51593105|ref|NP_001003971.1| SUMO1/sentrin spec (1010) 6527 1295.8 0 gi|149060337|gb|EDM11051.1| SUMO1/sentrin specific (1037) 6105 1212.7 0 gi|194222899|ref|XP_001502134.2| PREDICTED: SUMO1/ (1047) 4575 911.5 0 gi|154425521|gb|AAI51591.1| SENP7 protein [Bos tau (1047) 4520 900.7 0 gi|74002566|ref|XP_545077.2| PREDICTED: similar to (1042) 4512 899.1 0 gi|114588227|ref|XP_001146607.1| PREDICTED: sentri (1050) 4426 882.2 0 gi|114588237|ref|XP_001146469.1| PREDICTED: sentri (1017) 4416 880.2 0 gi|116174746|ref|NP_065705.3| sentrin/SUMO-specifi (1050) 4410 879.1 0 gi|120538355|gb|AAI29989.1| SUMO1/sentrin specific (1050) 4406 878.3 0 gi|119600207|gb|EAW79801.1| SUMO1/sentrin specific (1050) 4404 877.9 0 gi|168275524|dbj|BAG10482.1| sentrin-specific prot (1017) 4399 876.9 0 gi|119600204|gb|EAW79798.1| SUMO1/sentrin specific (1017) 4393 875.7 0 gi|109032814|ref|XP_001096443.1| PREDICTED: sentri (1018) 4388 874.7 0 gi|16550940|gb|AAL25651.1|AF199458_1 SUMO-1 specif (1017) 4385 874.1 0 gi|114588231|ref|XP_001146320.1| PREDICTED: sentri ( 984) 4028 803.8 0 gi|119370527|sp|Q9BQF6.3|SENP7_HUMAN RecName: Full ( 984) 4021 802.5 0 gi|119600206|gb|EAW79800.1| SUMO1/sentrin specific ( 984) 4015 801.3 0 gi|13276699|emb|CAB66534.1| hypothetical protein [ ( 984) 4009 800.1 0 gi|109032810|ref|XP_001096321.1| PREDICTED: sentri ( 984) 4000 798.3 0 gi|114588229|ref|XP_001146543.1| PREDICTED: sentri ( 985) 3892 777.1 0 gi|116174736|ref|NP_001070671.1| sentrin/SUMO-spec ( 985) 3875 773.7 0 gi|119600205|gb|EAW79799.1| SUMO1/sentrin specific ( 985) 3869 772.5 0 gi|109032807|ref|XP_001096201.1| PREDICTED: sentri ( 985) 3864 771.6 0 gi|117646766|emb|CAL37498.1| hypothetical protein ( 985) 3847 768.2 0 gi|114588239|ref|XP_001146245.1| PREDICTED: hypoth ( 886) 3739 746.9 1.1e-212 gi|114588235|ref|XP_001145850.1| PREDICTED: sentri ( 919) 3739 746.9 1.1e-212 gi|31873982|emb|CAD97911.1| hypothetical protein [ ( 886) 3732 745.5 2.8e-212 gi|119600208|gb|EAW79802.1| SUMO1/sentrin specific ( 886) 3726 744.3 6.3e-212 gi|109032817|ref|XP_001095984.1| PREDICTED: sentri ( 887) 3711 741.4 4.9e-211 gi|194386876|dbj|BAG59804.1| unnamed protein produ ( 998) 3125 626.1 2.8e-176 gi|126325648|ref|XP_001370470.1| PREDICTED: simila ( 992) 2856 573.1 2.5e-160 gi|118083584|ref|XP_001232523.1| PREDICTED: simila (1002) 2292 462.1 6.5e-127 gi|119600202|gb|EAW79796.1| SUMO1/sentrin specific ( 807) 2232 450.2 2e-123 gi|203282535|pdb|3EAY|A Chain A, Crystal Structure ( 323) 2008 405.8 1.9e-110 gi|74216653|dbj|BAE37755.1| unnamed protein produc ( 326) 1725 350.1 1.1e-93 gi|12849685|dbj|BAB28441.1| unnamed protein produc ( 254) 1442 294.3 5.5e-77 gi|9963808|gb|AAG09703.1|AF217504_1 sentrin/SUMO-s ( 238) 1387 283.4 9.6e-74 gi|149060338|gb|EDM11052.1| SUMO1/sentrin specific ( 237) 1307 267.7 5.3e-69 gi|148665736|gb|EDK98152.1| SUMO1/sentrin specific ( 199) 1287 263.7 7.1e-68 gi|12846517|dbj|BAB27198.1| unnamed protein produc ( 211) 1207 247.9 4.1e-63 gi|224044423|ref|XP_002190059.1| PREDICTED: simila ( 843) 1182 243.5 3.4e-61 gi|213390019|gb|ACJ46050.1| sentrin/SUMO-specific ( 901) 1160 239.2 7.3e-60 gi|126632593|emb|CAM56615.1| novel protein similar ( 535) 1100 227.2 1.8e-56 gi|189535449|ref|XP_001923282.1| PREDICTED: hypoth ( 865) 1100 227.4 2.5e-56 gi|148725664|emb|CAK04674.2| novel protein [Danio ( 879) 1100 227.4 2.6e-56 gi|12860535|dbj|BAB31982.1| unnamed protein produc ( 227) 1070 221.0 5.6e-55 gi|110768293|ref|XP_001121142.1| PREDICTED: simila ( 555) 819 171.9 8.2e-40 gi|189523581|ref|XP_700046.3| PREDICTED: hypotheti ( 892) 814 171.1 2.3e-39 gi|126631458|gb|AAI34235.1| LOC571373 protein [Dan ( 421) 764 161.0 1.2e-36 >>gi|81897571|sp|Q8BUH8.1|SENP7_MOUSE RecName: Full=Sent (1037 aa) initn: 6899 init1: 6899 opt: 6899 Z-score: 7336.0 bits: 1369.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6899; 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