FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4051.ptfa, 721 aa vs ./tmplib.26680 library 1768296 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3819+/-0.0068; mu= -0.7256+/- 0.451 mean_var=257.2860+/-62.092, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0800 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0307 ( 725 res) mbg05988 ( 725) 2197 267 4.8e-72 mKIAA0334 ( 857 res) mbf01556 ( 857) 294 48 6.6e-06 mKIAA0347 ( 1267 res) mbg06119 (1267) 212 38 0.006 >>mKIAA0307 ( 725 res) mbg05988 (725 aa) initn: 2703 init1: 2158 opt: 2197 Z-score: 1385.7 bits: 267.0 E(): 4.8e-72 Smith-Waterman score: 2774; 60.972% identity (67.331% ungapped) in 720 aa overlap (10-721:66-725) 10 20 30 mKIAA4 FINSVFRSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAY :.... ...:::::::::::::::: : mKIAA0 PVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSKFSRENHSEIERRRRNKMTQY 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 ITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLI :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::: mKIAA0 ITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLI 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 LEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTS :::::::::.:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: :: mKIAA0 LEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTS 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 ENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGTSSVDPVSMNRLSFLRNR ::..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: mKIAA0 ENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKR 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 CRNGLGSVKEGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSS ::::: ::::: ...:::::::::::::::...:..: ..:::::.::::::::::::: mKIAA0 FRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSS 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 PNCTDMSNICQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLL : : :::.. ::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. : mKIAA0 PVCMDMSGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHL 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 RDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKTREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSS :.::::::::::::::::.:::.:.:::: .:::::::::::::::::.:::::::: mKIAA0 RESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWLLIRTSSFTFQNPYSDEIEYVICTNTNVK--- 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 QEPRPTLSNTIPRSQLGPTANLSLEMGTGQLPSRQQQQQHTELDMVPGRDGLASYNHSQV : :::..::. : ::::.::. ::: mKIAA0 ----------------------------------QLQQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQV 460 470 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 SVQPVASAGSEHSKPLEKSEGLFAQDRDPRFPEIYPSITADQSKGISSSTVPATQQLFSQ : . .. : .: .::....:.:.::::: :.. .:.:...: .::... ..::..:: mKIAA0 PVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASASGSQQIYSQ 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 GSSFPPNPRPAENFRNSGL-TPPVTIVQPSSSAGQILAQISRHSNPAQGSAPTWTSSSRP :: :: . . .. : .: . .: :. .: :::.:: ..::::. : ::.. .::.: :: mKIAA0 GSPFPAG-HSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNISQISRQLN--QGQV-AWTGS-RP 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 GFAAQVPTQATAKTRSSQFGVNNFQ----TSSSFSAMSLPGAPTASSGTAAYPALPNRGS : .: :. ::.:: ::... . ::.: .: :.: . :.. :::.: :: mKIAA0 PFPGQ-PS----KTQSSAFGIGSSHPYPADPSSYSPLSSPAASSPSGN--AYPSLANRTP 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 NFPPETGQTTGQFQARTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQTQAQAPSQPEVFQEM .: :.::. ::::.: .: :: :::.: :: ..:.::: .: :.: ::::.: mKIAA0 GFA-ESGQSGGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQQ----PGQTEVFQDM 650 660 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 LSMLGDQSN---TYNNEEFPDLTMFPPFSE : : :: .. .:: :.: :: ::::::: mKIAA0 LPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE 700 710 720 >>mKIAA0334 ( 857 res) mbf01556 (857 aa) initn: 263 init1: 117 opt: 294 Z-score: 198.5 bits: 47.5 E(): 6.6e-06 Smith-Waterman score: 537; 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