# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbh02812.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1682.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1682, 801 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919290 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2744+/-0.000187; mu= 13.6823+/- 0.010 mean_var=86.4093+/-16.706, 0's: 36 Z-trim: 42 B-trim: 9 in 1/65 Lambda= 0.137973 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|166199460|sp|Q80TA6.2|MTMRC_MOUSE RecName: Full ( 747) 5096 1024.7 0 gi|148671323|gb|EDL03270.1| Vmyotubularin related ( 720) 4908 987.3 0 gi|166199454|sp|Q5FVM6.2|MTMRC_RAT RecName: Full=M ( 748) 4867 979.1 0 gi|109076873|ref|XP_001089010.1| PREDICTED: simila ( 840) 4759 957.7 0 gi|166199459|sp|Q9C0I1.2|MTMRC_HUMAN RecName: Full ( 747) 4596 925.2 0 gi|15192141|gb|AAK26171.1| phosphatidylinositol-3 ( 747) 4594 924.8 0 gi|75041695|sp|Q5R989.1|MTMRC_PONAB RecName: Full= ( 747) 4546 915.2 0 gi|73954361|ref|XP_855452.1| PREDICTED: similar to ( 790) 4390 884.2 0 gi|148671321|gb|EDL03268.1| Vmyotubularin related ( 614) 3983 803.1 0 gi|224090276|ref|XP_002191453.1| PREDICTED: myotub ( 774) 3679 742.7 1.3e-211 gi|58476507|gb|AAH89876.1| Myotubularin related pr ( 587) 3633 733.4 6.2e-209 gi|149027295|gb|EDL82962.1| rCG23675 [Rattus norve ( 544) 3589 724.6 2.5e-206 gi|148671322|gb|EDL03269.1| Vmyotubularin related ( 499) 3287 664.5 3e-188 gi|34783714|gb|AAH57393.1| MTMR12 protein [Homo sa ( 693) 3131 633.6 8.4e-179 gi|74002680|ref|XP_849317.1| PREDICTED: similar to ( 736) 3033 614.1 6.5e-173 gi|119913292|ref|XP_614802.3| PREDICTED: similar t ( 470) 2761 559.8 9.4e-157 gi|119631192|gb|EAX10787.1| myotubularin related p ( 637) 2738 555.3 2.8e-155 gi|114600792|ref|XP_001155493.1| PREDICTED: hypoth ( 637) 2732 554.1 6.4e-155 gi|7020602|dbj|BAA91195.1| unnamed protein product ( 637) 2726 552.9 1.5e-154 gi|26345156|dbj|BAC36227.1| unnamed protein produc ( 475) 2649 537.5 4.8e-150 gi|166199425|sp|A2BGG1.1|MTMRC_DANRE RecName: Full ( 736) 2615 530.9 7.3e-148 gi|50949510|emb|CAH10604.1| hypothetical protein [ ( 394) 2456 499.0 1.6e-138 gi|67971600|dbj|BAE02142.1| unnamed protein produc ( 361) 2269 461.7 2.3e-127 gi|82185479|sp|Q6NU08.1|MTRAB_XENLA RecName: Full= ( 764) 1454 299.8 2.8e-78 gi|189442305|gb|AAI67641.1| LOC100170581 protein [ ( 764) 1447 298.4 7.3e-78 gi|194676733|ref|XP_872338.3| PREDICTED: similar t ( 764) 1444 297.8 1.1e-77 gi|149410838|ref|XP_001509867.1| PREDICTED: simila ( 803) 1435 296.0 3.9e-77 gi|82180137|sp|Q5U581.1|MTRAA_XENLA RecName: Full= ( 765) 1413 291.6 7.9e-76 gi|54261517|gb|AAH84670.1| MGC81352 protein [Xenop ( 697) 1335 276.1 3.5e-71 gi|145566797|sp|A0JMF6.1|MTMRA_DANRE RecName: Full ( 752) 1301 269.3 4e-69 gi|73951013|ref|XP_536168.2| PREDICTED: similar to ( 767) 1273 263.8 1.9e-67 gi|73951015|ref|XP_856569.1| PREDICTED: similar to ( 781) 1273 263.8 2e-67 gi|194206364|ref|XP_001917120.1| PREDICTED: myotub ( 768) 1265 262.2 5.9e-67 gi|126277242|ref|XP_001373756.1| PREDICTED: simila ( 767) 1262 261.6 8.9e-67 gi|126326393|ref|XP_001369054.1| PREDICTED: simila ( 769) 1260 261.2 1.2e-66 gi|126343568|ref|XP_001362399.1| PREDICTED: simila ( 769) 1259 261.0 1.3e-66 gi|149057063|gb|EDM08386.1| similar to BB128963 pr ( 771) 1259 261.0 1.3e-66 gi|109458864|ref|XP_219705.4| PREDICTED: similar t ( 861) 1259 261.0 1.5e-66 gi|32967638|gb|AAH55074.1| Mtmr10 protein [Mus mus ( 689) 1257 260.5 1.6e-66 gi|215274100|sp|Q7TPM9.2|MTMRA_MOUSE RecName: Full ( 771) 1257 260.6 1.8e-66 gi|194034536|ref|XP_001927143.1| PREDICTED: simila ( 766) 1254 260.0 2.7e-66 gi|117644504|emb|CAL37747.1| hypothetical protein ( 777) 1240 257.2 1.9e-65 gi|215274131|sp|Q9NXD2.3|MTMRA_HUMAN RecName: Full ( 777) 1232 255.6 5.6e-65 gi|224062323|ref|XP_002194681.1| PREDICTED: myotub ( 755) 1224 254.0 1.7e-64 gi|109080446|ref|XP_001109855.1| PREDICTED: simila ( 775) 1220 253.2 2.9e-64 gi|37194862|gb|AAH58196.1| Mtmr10 protein [Mus mus ( 509) 1111 231.4 7.3e-58 gi|198424041|ref|XP_002126300.1| PREDICTED: simila ( 908) 1090 227.4 2e-56 gi|91077084|ref|XP_969828.1| PREDICTED: similar to ( 639) 1066 222.5 4.3e-55 gi|156547615|ref|XP_001603556.1| PREDICTED: simila ( 665) 1032 215.7 4.8e-53 gi|47230401|emb|CAF99594.1| unnamed protein produc ( 500) 1010 211.2 8.2e-52 >>gi|166199460|sp|Q80TA6.2|MTMRC_MOUSE RecName: Full=Myo (747 aa) initn: 5096 init1: 5096 opt: 5096 Z-score: 5479.9 bits: 1024.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 5096; 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