FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1891.ptfa, 1086 aa vs ./tmplib.26680 library 1767931 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3202+/-0.00476; mu= 16.1468+/- 0.317 mean_var=111.0404+/-25.873, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1217 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1372 ( 173 res) mie23079 ( 173) 580 113 5.4e-26 mKIAA1097 ( 838 res) mbg07126 ( 838) 208 48 6.9e-06 mKIAA1003 ( 961 res) mfj10286 ( 961) 196 46 3.2e-05 mKIAA1594 ( 907 res) mib19004 ( 907) 183 44 0.00015 mKIAA4202 ( 520 res) mpj00623 ( 520) 173 42 0.00036 mKIAA1063 ( 570 res) mfj05092 ( 570) 148 37 0.0079 mKIAA0055 ( 1108 res) mbh03469 (1108) 151 38 0.0085 mKIAA0891 ( 1362 res) mfj56010 (1362) 151 38 0.0097 >>mKIAA1372 ( 173 res) mie23079 (173 aa) initn: 580 init1: 580 opt: 580 Z-score: 559.1 bits: 112.5 E(): 5.4e-26 Smith-Waterman score: 580; 60.606% identity (60.606% ungapped) in 132 aa overlap (316-447:5-136) 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 QHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAVQ ::::::.::::....: :.::::::::::. mKIAA1 VFQECRMIDWVSWPLGKNIDKWIIALLKGLAAVK 10 20 30 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 KFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHVIVPHIVNLVHS ::.:::.:.: ::: ::..: .:.:: .::.::..:::.:::: ::::...::: .: : mKIAA1 KFSILIEVSLAKIEKVFSKLLYPIVRGAALSVLKYMLLTFQHSHEAFHLLLPHIPAMVAS 40 50 60 70 80 90 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 FRSDGLPSSTAFLVQLTELVHCMMYHYSGFPDLYEPILEAVKDFPKPSEEKIKLILNQSA . .. :.:. : ::.::::::.... ::::::::..::.: mKIAA1 LVKEDSNSGTSCLEQLAELVHCMVFRFPGFPDLYEPVMEAIKGLSVASAAPALCHMLTPC 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 WTSQSNALASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVLQALFMATEFRRQVLSLNLNGC mKIAA1 VLSSPEHERRLAHRTRLVS 160 170 >>mKIAA1097 ( 838 res) mbg07126 (838 aa) initn: 364 init1: 107 opt: 208 Z-score: 198.1 bits: 48.0 E(): 6.9e-06 Smith-Waterman score: 320; 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