# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbh02656.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0172.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0172, 934 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7906867 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6827+/-0.000189; mu= 11.0896+/- 0.011 mean_var=88.8804+/-17.131, 0's: 40 Z-trim: 113 B-trim: 63 in 1/66 Lambda= 0.136041 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|50925388|gb|AAH79563.1| Kank1 protein [Mus musc (1202) 4297 854.2 0 gi|75677563|ref|NP_852069.4| KN motif and ankyrin (1360) 4297 854.2 0 gi|109463727|ref|XP_001080106.1| PREDICTED: simila (1358) 4007 797.3 0 gi|198442871|ref|NP_001032274.2| ankyrin repeat do (1360) 4007 797.3 0 gi|55727298|emb|CAH90405.1| hypothetical protein [ (1176) 3826 761.8 0 gi|126334845|ref|XP_001374130.1| PREDICTED: simila (1396) 3764 749.6 2.2e-213 gi|168274436|dbj|BAG09638.1| ankyrin repeat domain (1352) 3738 744.5 7.5e-212 gi|122889158|emb|CAM13084.1| KN motif and ankyrin (1194) 3736 744.1 8.9e-212 gi|73920184|sp|Q14678.3|KANK1_HUMAN RecName: Full= (1352) 3736 744.1 9.8e-212 gi|158261079|dbj|BAF82717.1| unnamed protein produ (1194) 3734 743.7 1.2e-211 gi|23337043|gb|AAH37495.1| KANK1 protein [Homo sap (1352) 3734 743.7 1.3e-211 gi|119579225|gb|EAW58821.1| ankyrin repeat domain (1352) 3734 743.7 1.3e-211 gi|34785011|gb|AAH38116.1| KN motif and ankyrin re (1194) 3731 743.1 1.8e-211 gi|109111694|ref|XP_001090427.1| PREDICTED: simila (1352) 3729 742.8 2.6e-211 gi|158259439|dbj|BAF85678.1| unnamed protein produ (1352) 3724 741.8 5e-211 gi|18042980|gb|AAH20040.1| KANK1 protein [Homo sap ( 784) 3709 738.7 2.5e-210 gi|73946601|ref|XP_859615.1| PREDICTED: similar to (1172) 3651 727.4 9.3e-207 gi|73946603|ref|XP_859647.1| PREDICTED: similar to (1190) 3651 727.4 9.4e-207 gi|73946595|ref|XP_859517.1| PREDICTED: similar to (1765) 3636 724.6 9.8e-206 gi|109111704|ref|XP_001090315.1| PREDICTED: simila (1364) 3592 715.9 3.2e-203 gi|73946597|ref|XP_859550.1| PREDICTED: similar to ( 571) 3145 627.9 4.2e-177 gi|118103962|ref|XP_424927.2| PREDICTED: ankyrin r (1419) 2894 578.9 5.7e-162 gi|114623614|ref|XP_001134710.1| PREDICTED: ankyri ( 474) 2602 521.2 4.4e-145 gi|189442017|gb|AAI67678.1| Kank1.2 protein [Xenop (1344) 2461 493.9 2.1e-136 gi|141795206|gb|AAI39494.1| LOC446299 protein [Xen (1342) 2414 484.7 1.3e-133 gi|224091323|ref|XP_002194599.1| PREDICTED: simila (1032) 2337 469.5 3.6e-129 gi|148709682|gb|EDL41628.1| ankyrin repeat domain (1297) 2166 436.0 5.5e-119 gi|26351201|dbj|BAC39237.1| unnamed protein produc ( 314) 2074 417.5 5e-114 gi|29571127|gb|AAH50250.1| Kank1 protein [Mus musc ( 307) 2013 405.5 2e-110 gi|35192972|gb|AAH58673.1| Kank1 protein [Mus musc ( 611) 1991 401.4 6.7e-109 gi|149062625|gb|EDM13048.1| rCG47218 [Rattus norve (1293) 1718 348.1 1.6e-92 gi|47221529|emb|CAG08191.1| unnamed protein produc (1325) 1717 347.9 1.9e-92 gi|73946599|ref|XP_859583.1| PREDICTED: similar to ( 707) 1691 342.6 4e-91 gi|156229900|gb|AAI52401.1| Unknown (protein for I ( 322) 1664 337.0 8.5e-90 gi|114627831|ref|XP_001141520.1| PREDICTED: hypoth ( 874) 1656 335.8 5.5e-89 gi|55662012|emb|CAH70389.1| KN motif and ankyrin r ( 330) 1547 314.0 7.1e-83 gi|52545773|emb|CAH56292.1| hypothetical protein [ ( 352) 1547 314.1 7.4e-83 gi|114628076|ref|XP_001153440.1| PREDICTED: ankyri ( 796) 1531 311.2 1.2e-81 gi|55662013|emb|CAH70390.1| KN motif and ankyrin r ( 276) 1524 309.5 1.4e-81 gi|31873509|emb|CAD90003.2| hypothetical protein [ ( 966) 1522 309.5 4.9e-81 gi|55662010|emb|CAH70387.1| KN motif and ankyrin r ( 978) 1522 309.5 4.9e-81 gi|122891265|emb|CAM14466.1| novel protein similar (1335) 1421 289.8 5.8e-75 gi|194034171|ref|XP_001924327.1| PREDICTED: simila ( 196) 1265 258.5 2.2e-66 gi|189522980|ref|XP_001919098.1| PREDICTED: simila ( 914) 1258 257.7 1.8e-65 gi|47217426|emb|CAG00786.1| unnamed protein produc ( 376) 1240 253.8 1.1e-64 gi|169145227|emb|CAQ14986.1| novel protein similar ( 345) 1145 235.2 4.1e-59 gi|77567610|gb|AAI07447.1| Ankrd15 protein [Rattus ( 188) 1118 229.7 1e-57 gi|126323805|ref|XP_001376400.1| PREDICTED: simila ( 952) 1099 226.5 4.7e-56 gi|114628047|ref|XP_001152207.1| PREDICTED: simila ( 237) 1087 223.7 8.3e-56 gi|224087235|ref|XP_002189673.1| PREDICTED: hypoth ( 933) 1094 225.5 9.2e-56 >>gi|50925388|gb|AAH79563.1| Kank1 protein [Mus musculus (1202 aa) initn: 5667 init1: 4280 opt: 4297 Z-score: 4553.4 bits: 854.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 6055; 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