# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbh02561.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1274.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1274, 864 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7921143 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0997+/-0.000182; mu= 14.1986+/- 0.010 mean_var=70.6234+/-13.786, 0's: 36 Z-trim: 43 B-trim: 3 in 1/65 Lambda= 0.152616 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|26353606|dbj|BAC40433.1| unnamed protein produc ( 859) 5760 1277.8 0 gi|219518419|gb|AAI44848.1| CDNA sequence X99384 [ ( 859) 5749 1275.4 0 gi|187951755|gb|AAI37696.1| X99384 protein [Mus mu ( 857) 5736 1272.6 0 gi|219518417|gb|AAI44847.1| X99384 protein [Mus mu ( 860) 5735 1272.3 0 gi|81886938|sp|P70261.1|PALD_MOUSE RecName: Full=P ( 859) 5720 1269.0 0 gi|197313711|ref|NP_001029300.2| paladin [Rattus n ( 857) 5304 1177.4 0 gi|149038738|gb|EDL93027.1| rCG21974, isoform CRA_ ( 786) 4667 1037.2 0 gi|194679333|ref|XP_603024.4| PREDICTED: similar t ( 856) 4491 998.4 0 gi|148700199|gb|EDL32146.1| cDNA sequence X99384, ( 451) 2966 662.5 1.2e-187 gi|149038737|gb|EDL93026.1| rCG21974, isoform CRA_ ( 449) 2676 598.6 1.9e-168 gi|146325027|sp|Q8JHZ8.2|PALD_CHICK RecName: Full= ( 868) 2358 528.8 3.9e-147 gi|53131194|emb|CAG31799.1| hypothetical protein [ ( 843) 2286 512.9 2.2e-142 gi|82236012|sp|Q6DIR8.1|PALD_XENTR RecName: Full=P ( 872) 2244 503.7 1.4e-139 gi|149440485|ref|XP_001505981.1| PREDICTED: simila ( 652) 2187 491.1 6.7e-136 gi|45219820|gb|AAH66756.1| Paladin [Danio rerio] ( 860) 1985 446.7 2e-122 gi|82177028|sp|Q803E0.1|PALD_DANRE RecName: Full=P ( 860) 1973 444.0 1.3e-121 gi|220678151|emb|CAX14786.1| novel protein (zgc:16 ( 883) 1841 415.0 7.2e-113 gi|141795817|gb|AAI39565.1| Zgc:162303 protein [Da ( 863) 1838 414.3 1.1e-112 gi|51593737|gb|AAH80827.1| X99384 protein [Mus mus ( 257) 1703 384.2 3.9e-104 gi|47216063|emb|CAG04802.1| unnamed protein produc ( 865) 1097 251.2 1.5e-63 gi|115675639|ref|XP_791972.2| PREDICTED: similar t ( 819) 913 210.6 2.2e-51 gi|156218844|gb|EDO39735.1| predicted protein [Nem ( 330) 802 185.9 2.5e-44 gi|156218845|gb|EDO39736.1| predicted protein [Nem ( 255) 722 168.2 4.1e-39 gi|72012797|ref|XP_781355.1| PREDICTED: similar to ( 343) 659 154.4 7.7e-35 gi|71682384|gb|AAI00094.1| Pald protein [Rattus no ( 104) 644 150.7 3e-34 gi|190581624|gb|EDV21700.1| hypothetical protein T ( 799) 606 143.0 4.8e-31 gi|115615080|ref|XP_780714.2| PREDICTED: similar t ( 174) 513 122.1 2.1e-25 gi|115939641|ref|XP_001195273.1| PREDICTED: simila ( 179) 513 122.1 2.2e-25 gi|47200202|emb|CAF88821.1| unnamed protein produc ( 262) 424 102.6 2.3e-19 gi|47196389|emb|CAF88365.1| unnamed protein produc ( 263) 424 102.6 2.3e-19 gi|70880014|gb|EAN93141.1| hypothetical protein, c (1504) 290 73.7 6.9e-10 gi|62359217|gb|AAX79660.1| hypothetical protein, c (1518) 271 69.5 1.3e-08 gi|159105827|gb|EDP44712.1| hypothetical protein M (1357) 255 65.9 1.3e-07 gi|70861734|gb|EAN80875.1| hypothetical protein, c ( 194) 238 61.5 3.9e-07 gi|115641733|ref|XP_001204152.1| PREDICTED: simila ( 60) 182 48.8 0.00081 gi|194295010|gb|ABC69361.2| protein tyrosine phosp ( 295) 188 50.7 0.0011 >>gi|26353606|dbj|BAC40433.1| unnamed protein product [M (859 aa) initn: 5760 init1: 5760 opt: 5760 Z-score: 6846.2 bits: 1277.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5760; 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