FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1577.ptfa, 827 aa vs ./tmplib.26680 library 1768190 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8830+/-0.0038; mu= 14.5288+/- 0.254 mean_var=76.2376+/-17.287, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1469 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1511 ( 1207 res) mbg03448 (1207) 1997 434 6.7e-122 mFLJ00044 ( 733 res) mph00426 ( 733) 1872 407 4.4e-114 >>mKIAA1511 ( 1207 res) mbg03448 (1207 aa) initn: 3959 init1: 1989 opt: 1997 Z-score: 2280.8 bits: 433.5 E(): 6.7e-122 Smith-Waterman score: 4061; 70.953% identity (75.735% ungapped) in 871 aa overlap (1-821:195-1060) 10 20 30 mKIAA1 GGDETRLPFRRGIALLESGCVDNVLQVGFH :: : ::::::: ::.:: :.:::::::: mKIAA1 AAPAGSAPGAAGAGSSPGLGAGTGTASGGCGGGEG-LPFRRGIRLLDSGSVENVLQVGFH 170 180 190 200 210 220 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 LSGTVTEPAIQPEPETVCNVAISFDRCKITSVTCSCGNKDIFYCAHVVALSLYRIRKPEQ :::::::::. :: .. .:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::.: mKIAA1 LSGTVTEPAMASEPAVTYKVAISFDRCKITSVSCGCGNKDIFYCAHVVALSLYRIRKPDQ 230 240 250 260 270 280 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 VKLHLPISETLFQMNRDQLQKFVQYLITVHHTEVLPTAQKLADEILSQNSEINQVHGAPD :::.::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::.:::::::.:::: mKIAA1 VKLRLPISETLFQMNRDQLQKFIQYLITAHHTEVLPTAQKLADEILSSNSEINQVNGAPD 290 300 310 320 330 340 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 PTAGASIDDENCWHLDEEQVQEQVKVFLSQGGYHGSGKQLNMLFAKVREMLKMRDSNGAR ::::::::::::::::::::.::::.:::::::.::::::: .::::::::.:::::::: mKIAA1 PTAGASIDDENCWHLDEEQVKEQVKLFLSQGGYYGSGKQLNSMFAKVREMLRMRDSNGAR 350 360 370 380 390 400 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 MLTLITEQFMADPRLSLWRQQGTAMTDKYRQLWDELGALWMCIVLNPHCKLEQKASWLKQ :::::::::::::::.:::::::.:::: :::::::::::.::.::::::::.:. ::.: mKIAA1 MLTLITEQFMADPRLTLWRQQGTSMTDKCRQLWDELGALWVCIILNPHCKLEEKSCWLQQ 410 420 430 440 450 460 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 LKKWNSVDVCPWEDGNHGSELPNLTNALPQGANANQDSSNRPHRTVFTRAIEACDLHWQD :.::...:.:: ::::.: ::::.:::: :.:. . :: .::.:::::::::. .::::: mKIAA1 LQKWSDLDICPLEDGNYGHELPNITNALSQSASHSPDSLSRPRRTVFTRAIEGRELHWQD 470 480 490 500 510 520 340 350 360 mKIAA1 SHLQHIISSDLYTNYCYHDDTENSLFDSRGWPLW--H----------------------- ::::.:::: .:: . ..: ::.:.: ::: : mKIAA1 SHLQRIISSGIYTAPACQRENERLLFNSHGQPLWLEHVPTACARVDALRSHGYPKEALRL 530 540 550 560 570 580 370 380 390 400 mKIAA1 ------------------------ELPHKSITSITNLEGWVGHPLDPVGTLFSSLMEACH :: ... :.::::::::::::::.: :: .: :::. mKIAA1 TVAIINTLRLQQQRQLEIYKHQKKELLQRGTTTITNLEGWVGHPLDPIGCLFLTLTEACR 590 600 610 620 630 640 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 TDGDAFSGFSDCTDNMGQCKSLEYHHLP-AHKFLEEGESYVTLAVEVALIGLGQQRIMPD . :.. .:: :.. . :.:.: : . .:::..::.::::.:.::::.::. mKIAA1 LNDDSYMEMSD----MNESRLPVYQHVPVASGCPNSNESYLSLALEVALMGMGQQRVMPE 650 660 670 680 690 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 GLYTQEKVCRNEEQLISKLQEIELDDTLVKIFRKQAVFLLEAGPYSGLGEIIHRESVPMH :::.:.:::::::::.:.:::..::: ::. .::: ..:::.::.:::::.::::::::: mKIAA1 GLYAQDKVCRNEEQLLSQLQELQLDDELVQTLRKQCILLLEGGPFSGLGEVIHRESVPMH 700 710 720 730 740 750 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 TFAKYLFTSLLPHDAELAYKIALRAMRLLVLESTAPTGDLSRPHHIASVVPNRYPRWFTL :::::::..::::: .:.::.::::::: :::... .:: :.:::..::::.:::::::: mKIAA1 TFAKYLFSALLPHDPDLSYKLALRAMRLPVLENSSSAGDTSHPHHMVSVVPSRYPRWFTL 760 770 780 790 800 810 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 SHIESQQCELASTMLTAAKGDVRRLETVLESIQKNIHSSSHIFKLAQDAFKIATLMDSLP .:.::::::::::::::::::. ::.:.::.:::.::: : ::::::::::::: :: mKIAA1 GHLESQQCELASTMLTAAKGDTLRLRTLLEAIQKHIHSPSLIFKLAQDAFKIATPTDSST 820 830 840 850 860 870 650 660 670 680 690 700 mKIAA1 DITLLKVSLELGLQVMRMTLSTLNWRRREMVRWLVTCATEVGVYALDSIMQSWFTLFTPT : :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::.:::.:::::: mKIAA1 DGTLLNVALELGLQVMRMTLSTLNWRRREMVRWLVTCATEVGVRALVSILQSWYTLFTPT 880 890 900 910 920 930 710 720 730 740 750 760 mKIAA1 EATSIVATTVMSNSTIVRLHLDCHQQEKLASSARTLALQCAMKDPQNCALSALTLCEKDH :::::::.:..:..::.:: :: :.:.::: ::::::::::::::.::::::::::::: mKIAA1 EATSIVAATAVSHTTILRLSLDYPQREELASCARTLALQCAMKDPQSCALSALTLCEKDH 940 950 960 970 980 990 770 780 790 800 810 820 mKIAA1 IAFETAYQIVLDAATTGMSYTQLFTIARYMEHRGYPMRAYKLATLAMTHLNLSYNQDTHP ::::.::::..:::. ::...:::::::::: ::::.::.:::.:::.::::.::::::: mKIAA1 IAFEAAYQIAIDAAAGGMTHSQLFTIARYMELRGYPLRAFKLASLAMSHLNLAYNQDTHP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 AFVPFLT :. mKIAA1 AINDVLWACALSHSLGKNELAALIPLVVKSVHCATVLSDILRRCTVTAPGLAGIPGRRSS 1060 1070 1080 1090 1100 1110 >>mFLJ00044 ( 733 res) mph00426 (733 aa) initn: 2043 init1: 1159 opt: 1872 Z-score: 2140.4 bits: 406.8 E(): 4.4e-114 Smith-Waterman score: 1978; 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