FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1308.ptfa, 924 aa vs ./tmplib.26680 library 1768093 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2669+/-0.00779; mu= -2.9152+/- 0.513 mean_var=301.4623+/-73.299, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 151 in 1/35 Lambda= 0.0739 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00153 ( 505 res) mpm10098 ( 505) 920 112 2.1e-25 mKIAA0959 ( 333 res) mid17095 ( 333) 873 107 5.2e-24 mKIAA0351 ( 537 res) mbg14564 ( 537) 257 41 0.00041 mKIAA4052 ( 1046 res) mbg11557 (1046) 230 39 0.0048 >>mFLJ00153 ( 505 res) mpm10098 (505 aa) initn: 1226 init1: 590 opt: 920 Z-score: 548.3 bits: 111.9 E(): 2.1e-25 Smith-Waterman score: 1184; 42.500% identity (47.222% ungapped) in 520 aa overlap (364-880:35-505) 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 PVPEPPQEPEPSLALAPELEPAVSQSLELESAPVPTPALEPSWSLPE--ATENG-LTEKP :.: : : :. . : . :.: .: : mFLJ00 AEAREAEKLLEDFLKEAKGEQTEEEKRLAWSGP-PRIAQTPGSEFAEDCVEEEGPSSEGP 10 20 30 40 50 60 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 HLLLFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVAQFNNV .:: : : ::::.::::.::: .: .::::.:::::. : ..::.::::::::.: mFLJ00 ELLDFSVDDVAEQLTLMDVELFLRVRSCECLGSMWSQRDRPGAAGISPTVRATVAQFNTV 70 80 90 100 110 120 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 ANCVITTCLGDQSMKAPDRARVVEHWIEVARECRALKNFSSLYAILSALQSNAIHRLKKT ..::. . :. .. : .::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::.. mFLJ00 TGCVLGSVLAAPGLAASQRAQRIEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRS 130 140 150 160 170 180 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 WEEVSRDSFRVFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPRRAQRRQKETGVI : :::. . ::.:::.:::::.:. :: .: .: :.. . : . . . mFLJ00 WGAVSREPLSVFRKLSQIFSDEDNHLSSRAILSQEETTE---DDDCPSGSL----PSKLP 190 200 210 220 230 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPE : :::::::::::::::::. : : : ::::::::::.:..:.:. ::. :. ::..:. mFLJ00 PGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDTLKGNLINFEKRRKEWEILARIQQLQQRCQRYSLSPR 240 250 260 270 280 290 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 EHFGTWFRAMERLSEAESYTLSCELEPPSESASNTLRSKKSTAIVKRWSDRQAPSTELST . . .::...::: .:: .: .:::. : .. : .. ...:: ::. mFLJ00 PPILAALRAQRQLSEEQSYRVSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKR----------LSA 300 310 320 330 340 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 SSSAHSKSCDQLRCSPYLGSGDITDALSVHSAGSSSSDVEEINMSFVPESPDGQEKKFWE . : ...: :: . :: .. : : :: : :: ..: mFLJ00 KLSREKNS------SPGGSPGDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRNREPP--- 350 360 370 380 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVSTTRTHKRSVSGVCSYSSSLPLYNQQVGDCC : : . : .: :.. : . : .: : . :: .:: .::... mFLJ00 -PPGSPPASPGPQSPSTKLSLTMDPPGPWPVTLTPS---------SSRVPLLGQQTSEAR 390 400 410 420 430 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 IIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPTVIRKAMDKHNLDEDEPEDYELVQIISEDHKLKI .::::.. ..::.:.:::.: :::::.:...:..:::. . .::.: :.. :..: : mFLJ00 VIRVSINNNHGNLYRSILLTCQDKAPSVVQRALEKHNVPQPWARDYQLFQVLPGDRELLI 440 450 460 470 480 490 880 890 900 910 920 mKIAA1 PENANVFYAMNSTANYDFILKKRTFTKGAKVKHGASSTLPRMKQKGLRIAKGIF :..::::::: mFLJ00 PDGANVFYAM 500 >>mKIAA0959 ( 333 res) mid17095 (333 aa) initn: 838 init1: 422 opt: 873 Z-score: 523.5 bits: 106.7 E(): 5.2e-24 Smith-Waterman score: 873; 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