# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbh02485.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1308.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1308, 924 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7907789 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0369+/-0.000201; mu= 10.4185+/- 0.011 mean_var=128.7726+/-24.478, 0's: 30 Z-trim: 73 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.113022 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|20073140|gb|AAH27225.1| Ral guanine nucleotide ( 852) 5575 921.1 0 gi|544402|sp|Q03385.1|GNDS_MOUSE RecName: Full=Ral ( 852) 5562 919.0 0 gi|74204540|dbj|BAE35345.1| unnamed protein produc ( 907) 5540 915.4 0 gi|33337513|gb|AAQ13414.1|AF027169_1 Ral guanine n ( 859) 4865 805.4 0 gi|109109913|ref|XP_001102309.1| PREDICTED: ral gu ( 902) 4849 802.8 0 gi|34534474|dbj|BAC87018.1| unnamed protein produc ( 913) 4831 799.8 0 gi|14549162|sp|Q12967.2|GNDS_HUMAN RecName: Full=R ( 914) 4829 799.5 0 gi|221039766|dbj|BAH11646.1| unnamed protein produ ( 985) 4818 797.7 0 gi|74206307|dbj|BAE24899.1| unnamed protein produc ( 840) 4800 794.7 0 gi|123857715|emb|CAM24092.1| ral guanine nucleotid ( 895) 4800 794.8 0 gi|74186593|dbj|BAE34771.1| unnamed protein produc ( 895) 4789 793.0 0 gi|119608443|gb|EAW88037.1| ral guanine nucleotide ( 847) 4750 786.6 0 gi|37589539|gb|AAH59362.1| RALGDS protein [Homo sa ( 902) 4714 780.8 0 gi|221043624|dbj|BAH13489.1| unnamed protein produ ( 885) 4700 778.5 0 gi|114627364|ref|XP_520337.2| PREDICTED: ral guani ( 977) 4693 777.4 0 gi|158517953|ref|NP_062123.2| ral guanine nucleoti ( 895) 4551 754.2 6.1e-215 gi|544403|sp|Q03386.1|GNDS_RAT RecName: Full=Ral g ( 895) 4522 749.4 1.6e-213 gi|109109917|ref|XP_001101851.1| PREDICTED: ral gu ( 899) 4495 745.0 3.5e-212 gi|194225972|ref|XP_001499222.2| PREDICTED: simila ( 905) 4247 704.6 5.2e-200 gi|73967660|ref|XP_859138.1| PREDICTED: similar to ( 894) 4205 697.8 5.9e-198 gi|18676576|dbj|BAB84940.1| FLJ00185 protein [Homo ( 824) 4151 688.9 2.5e-195 gi|109109911|ref|XP_001102215.1| PREDICTED: ral gu ( 890) 4147 688.3 4.1e-195 gi|119608447|gb|EAW88041.1| ral guanine nucleotide ( 953) 3780 628.5 4.5e-177 gi|193786435|dbj|BAG51718.1| unnamed protein produ ( 683) 3705 616.1 1.7e-173 gi|119608445|gb|EAW88039.1| ral guanine nucleotide ( 886) 3701 615.6 3.2e-173 gi|73967658|ref|XP_537806.2| PREDICTED: similar to ( 919) 3625 603.2 1.8e-169 gi|73967662|ref|XP_859177.1| PREDICTED: similar to ( 931) 3625 603.2 1.8e-169 gi|74203999|dbj|BAE29002.1| unnamed protein produc ( 555) 3608 600.2 8.6e-169 gi|151553967|gb|AAI49036.1| RALGDS protein [Bos ta ( 803) 3483 580.0 1.5e-162 gi|21748588|dbj|BAC03431.1| FLJ00371 protein [Homo ( 625) 3215 536.2 1.8e-149 gi|149642252|ref|XP_001511677.1| PREDICTED: simila ( 831) 2900 484.9 6.4e-134 gi|149039189|gb|EDL93409.1| ral guanine nucleotide ( 461) 2892 483.4 1.1e-133 gi|126297938|ref|XP_001371225.1| PREDICTED: simila ( 985) 2843 475.7 4.5e-131 gi|118099359|ref|XP_425331.2| PREDICTED: similar t ( 982) 2805 469.5 3.3e-129 gi|109109915|ref|XP_001102128.1| PREDICTED: ral gu ( 830) 2688 450.4 1.6e-123 gi|21620064|gb|AAH33198.1| Unknown (protein for IM ( 411) 2472 414.8 4e-113 gi|169155024|emb|CAQ13424.1| novel protein similar ( 813) 2042 345.0 8.2e-92 gi|189522617|ref|XP_001920221.1| PREDICTED: hypoth ( 882) 2042 345.1 8.7e-92 gi|538200|gb|AAA52360.1| Ral guanine nucleotide di ( 328) 1966 332.2 2.4e-88 gi|161611520|gb|AAI55691.1| LOC100135084 protein [ ( 807) 1883 319.1 5.2e-84 gi|18204882|gb|AAH21581.1|AAH21581 Unknown (protei ( 304) 1819 308.2 3.7e-81 gi|126306325|ref|XP_001366741.1| PREDICTED: simila ( 768) 1805 306.3 3.4e-80 gi|126306323|ref|XP_001366686.1| PREDICTED: simila ( 803) 1805 306.4 3.5e-80 gi|53134233|emb|CAG32313.1| hypothetical protein [ ( 768) 1783 302.8 4.1e-79 gi|119611574|gb|EAW91168.1| ral guanine nucleotide ( 766) 1770 300.6 1.8e-78 gi|14548230|sp|Q9NZL6.1|RGL1_HUMAN RecName: Full=R ( 768) 1770 300.6 1.8e-78 gi|10185686|gb|AAG14400.1|AF186798_1 RalGDS-like [ ( 768) 1770 300.6 1.8e-78 gi|7682473|gb|AAF67281.1|AF186780_1 RGL protein [H ( 803) 1770 300.7 1.8e-78 gi|55665873|emb|CAH73873.1| ral guanine nucleotide ( 803) 1770 300.7 1.8e-78 gi|10185687|gb|AAG14401.1|AF186798_2 RalGDS-like [ ( 803) 1770 300.7 1.8e-78 >>gi|20073140|gb|AAH27225.1| Ral guanine nucleotide diss (852 aa) initn: 5575 init1: 5575 opt: 5575 Z-score: 4917.8 bits: 921.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 5575; 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